More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4283 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  38.87 
 
 		 1034 aa  703    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3687  CzcA family heavy metal efflux protein  43.09 
 
 		 1049 aa  765    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  38.54 
 
 		 1034 aa  664    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  37.37 
 
 		 1053 aa  665    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  38.04 
 
 		 1048 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  43.01 
 
 		 1021 aa  790    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  38.65 
 
 		 1032 aa  669    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  36.99 
 
 		 1033 aa  669    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  39.07 
 
 		 1033 aa  711    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  36.39 
 
 		 1061 aa  641    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  36.69 
 
 		 1032 aa  659    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  38.35 
 
 		 1034 aa  678    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  37.27 
 
 		 1053 aa  662    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  39.78 
 
 		 1038 aa  764    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  35.91 
 
 		 1455 aa  642    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  38.07 
 
 		 1064 aa  688    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  37.41 
 
 		 1029 aa  655    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4985  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.98 
 
 		 1055 aa  785    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00799341 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1242  CzcA family heavy metal efflux protein  39.35 
 
 		 1056 aa  714    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.861006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  39.71 
 
 		 1032 aa  776    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  38.12 
 
 		 1053 aa  666    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  37.46 
 
 		 1077 aa  671    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  37.14 
 
 		 1049 aa  663    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  36.72 
 
 		 1052 aa  650    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  37.97 
 
 		 1054 aa  663    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  38.2 
 
 		 1048 aa  642    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  42.16 
 
 		 1033 aa  749    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  43.56 
 
 		 1029 aa  807    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  37.68 
 
 		 1070 aa  679    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1550  CzcA family heavy metal efflux protein  39.2 
 
 		 1057 aa  666    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  37.37 
 
 		 1053 aa  665    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  38.6 
 
 		 1032 aa  701    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  41.33 
 
 		 1039 aa  765    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.14 
 
 		 1034 aa  687    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  37.64 
 
 		 1075 aa  686    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  37.8 
 
 		 1048 aa  642    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  36.56 
 
 		 1059 aa  673    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  36.61 
 
 		 1062 aa  669    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  40.39 
 
 		 1050 aa  744    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  37.75 
 
 		 1077 aa  675    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  41.1 
 
 		 1063 aa  776    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  38.01 
 
 		 1047 aa  676    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  37 
 
 		 1062 aa  650    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3868  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA (cation efflux system protein CzcA)  36.66 
 
 		 1044 aa  639    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  37.9 
 
 		 1050 aa  657    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  37.78 
 
 		 1070 aa  680    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.74 
 
 		 1056 aa  720    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  39.22 
 
 		 1034 aa  691    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  37.44 
 
 		 1028 aa  644    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  40.11 
 
 		 1079 aa  753    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7263  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  37.38 
 
 		 1060 aa  642    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.24626 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  37.56 
 
 		 1077 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  37.75 
 
 		 1077 aa  677    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  37.61 
 
 		 1040 aa  653    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  37.78 
 
 		 1051 aa  670    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  44.6 
 
 		 1019 aa  834    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.39 
 
 		 1054 aa  791    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  37.37 
 
 		 1077 aa  668    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  37.63 
 
 		 1062 aa  652    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  37.75 
 
 		 1077 aa  677    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  41.16 
 
 		 1040 aa  746    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  37.68 
 
 		 1070 aa  679    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  100 
 
 		 1031 aa  2080    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.88 
 
 		 1049 aa  689    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  37.13 
 
 		 1043 aa  657    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  37.85 
 
 		 1038 aa  663    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  38.63 
 
 		 1031 aa  692    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  61.13 
 
 		 1029 aa  1222    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  36.1 
 
 		 1040 aa  654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1612  acriflavin resistance protein  37.62 
 
 		 1010 aa  677    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  40.38 
 
 		 1083 aa  774    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  37.36 
 
 		 1083 aa  684    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  40.89 
 
 		 1028 aa  770    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  37.52 
 
 		 1070 aa  650    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  39.18 
 
 		 1034 aa  763    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  37.17 
 
 		 1070 aa  638    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2944  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.39 
 
 		 1054 aa  791    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  38.78 
 
 		 1054 aa  685    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  41.35 
 
 		 1040 aa  753    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  37.37 
 
 		 1053 aa  665    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  37.95 
 
 		 1069 aa  661    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  36.67 
 
 		 1072 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  37.58 
 
 		 1070 aa  680    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  41.16 
 
 		 1050 aa  770    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  37.21 
 
 		 1063 aa  671    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  36.04 
 
 		 1046 aa  652    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  66.54 
 
 		 1025 aa  1313    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  39.12 
 
 		 1061 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  38.15 
 
 		 1023 aa  666    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  37.54 
 
 		 1043 aa  688    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  41.5 
 
 		 1045 aa  799    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  39.55 
 
 		 1039 aa  737    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  41.25 
 
 		 1027 aa  792    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  41.22 
 
 		 1032 aa  790    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  37.56 
 
 		 1077 aa  674    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  37.56 
 
 		 1077 aa  674    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  37.68 
 
 		 1070 aa  679    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  40.16 
 
 		 1030 aa  744    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  37.91 
 
 		 1048 aa  637    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.21 
 
 		 1063 aa  673    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>