More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_1550 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  35.31 
 
 		 1034 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4393  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.52 
 
 		 1031 aa  660    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.421403  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.51 
 
 		 1049 aa  660    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  37.62 
 
 		 1053 aa  653    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  38.69 
 
 		 1077 aa  656    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  41.75 
 
 		 1021 aa  723    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3555  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.85 
 
 		 1062 aa  646    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  36.68 
 
 		 1033 aa  636    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  38.95 
 
 		 1033 aa  675    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.5 
 
 		 1034 aa  637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  43.75 
 
 		 1032 aa  812    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  34.65 
 
 		 1032 aa  660    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.83 
 
 		 1047 aa  652    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  65.46 
 
 		 1038 aa  1340    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  38.87 
 
 		 1064 aa  660    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  38.26 
 
 		 1036 aa  712    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1080  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.24 
 
 		 1051 aa  641    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114839  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  38.17 
 
 		 1034 aa  665    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1550  CzcA family heavy metal efflux protein  100 
 
 		 1057 aa  2110    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893235  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  38.02 
 
 		 1053 aa  638    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  38.51 
 
 		 1077 aa  649    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  38.38 
 
 		 1049 aa  694    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  37.73 
 
 		 1052 aa  664    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  38.16 
 
 		 1054 aa  642    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3726  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.88 
 
 		 1040 aa  706    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0290592  normal  0.111264 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  38.06 
 
 		 1033 aa  650    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  38.2 
 
 		 1029 aa  696    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  37.52 
 
 		 1053 aa  650    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4058  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.59 
 
 		 1037 aa  696    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  38.82 
 
 		 1039 aa  722    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7204  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.75 
 
 		 1051 aa  722    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.57085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  37.89 
 
 		 1075 aa  653    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  38.6 
 
 		 1077 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  38.6 
 
 		 1077 aa  651    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  38.31 
 
 		 1059 aa  659    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  35.54 
 
 		 1032 aa  649    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  38.69 
 
 		 1077 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  38.72 
 
 		 1029 aa  669    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  38.81 
 
 		 1070 aa  672    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2549  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.92 
 
 		 1046 aa  689    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595471  normal  0.0930113 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  37.34 
 
 		 1050 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  39.09 
 
 		 1070 aa  677    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2928  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.5 
 
 		 1032 aa  729    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  37.62 
 
 		 1053 aa  653    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.97 
 
 		 1031 aa  696    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.39 
 
 		 1034 aa  663    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0687  heavy metal efflux pump, CzcA family  49.22 
 
 		 1033 aa  982    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0323863 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  38.6 
 
 		 1077 aa  651    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6552  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.14 
 
 		 1060 aa  727    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.418504 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  40.04 
 
 		 1019 aa  754    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  38.35 
 
 		 1077 aa  649    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.37 
 
 		 1039 aa  725    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.81 
 
 		 1025 aa  664    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.14 
 
 		 1040 aa  687    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.26 
 
 		 1052 aa  668    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.7 
 
 		 1038 aa  695    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  38.01 
 
 		 1029 aa  639    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  36 
 
 		 1040 aa  638    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  38.4 
 
 		 1046 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  38.39 
 
 		 1083 aa  666    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  37.62 
 
 		 1053 aa  653    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  38.27 
 
 		 1054 aa  667    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.36 
 
 		 1054 aa  637    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  72.02 
 
 		 1030 aa  1444    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  37.44 
 
 		 1063 aa  637    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  38.81 
 
 		 1070 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  38.72 
 
 		 1070 aa  669    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0917  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.43 
 
 		 1043 aa  728    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.164104 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  37.2 
 
 		 1028 aa  674    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  37.92 
 
 		 1079 aa  648    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  37.23 
 
 		 1050 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  37 
 
 		 1063 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  38.69 
 
 		 1077 aa  656    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2944  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.36 
 
 		 1054 aa  637    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  38.01 
 
 		 1043 aa  649    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.81 
 
 		 1063 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  36.55 
 
 		 1045 aa  646    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  63.94 
 
 		 1039 aa  1335    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  39.49 
 
 		 1027 aa  700    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.52 
 
 		 1031 aa  660    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.93 
 
 		 1459 aa  659    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  35 
 
 		 1034 aa  691    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  38.81 
 
 		 1070 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3517  heavy metal efflux pump, CzcA family  75.58 
 
 		 1042 aa  1549    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.02 
 
 		 1462 aa  654    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  38.37 
 
 		 1032 aa  716    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2529  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.1 
 
 		 1055 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0729585 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  38.41 
 
 		 1050 aa  633  1e-180  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.1 
 
 		 1480 aa  634  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  38.62 
 
 		 1048 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  37.29 
 
 		 1025 aa  635  1e-180  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  37.19 
 
 		 1051 aa  634  1e-180  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4985  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.1 
 
 		 1055 aa  634  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00799341 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  38.62 
 
 		 1048 aa  632  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  38.62 
 
 		 1048 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  36.53 
 
 		 1043 aa  632  1e-179  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
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NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  37.02 
 
 		 1062 aa  629  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
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NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  37.45 
 
 		 1069 aa  627  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  36.27 
 
 		 1079 aa  628  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
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NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  34.18 
 
 		 1455 aa  626  1e-178  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
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