More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4295 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



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Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  36.2 
 
 
1034 aa  693    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.68 
 
 
1047 aa  679    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  36.78 
 
 
1034 aa  675    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  36.55 
 
 
1053 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  35.69 
 
 
1048 aa  645    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  41.4 
 
 
1021 aa  793    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4985  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.89 
 
 
1055 aa  704    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00799341 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  34.59 
 
 
1033 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  38.91 
 
 
1033 aa  744    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  37.35 
 
 
1079 aa  719    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  34.32 
 
 
1032 aa  649    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  39.35 
 
 
1025 aa  718    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  35.86 
 
 
1032 aa  701    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  36.73 
 
 
1038 aa  737    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4462  CzcA family heavy metal efflux protein  36.21 
 
 
1446 aa  654    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1404  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.89 
 
 
1056 aa  723    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100387  normal  0.0917264 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  36.93 
 
 
1034 aa  699    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1550  CzcA family heavy metal efflux protein  35 
 
 
1057 aa  652    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893235  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.78 
 
 
1025 aa  713    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  36.69 
 
 
1053 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  35.15 
 
 
1077 aa  635    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7204  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.32 
 
 
1051 aa  695    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.57085  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  36.37 
 
 
1049 aa  669    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  35.41 
 
 
1052 aa  651    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  36.55 
 
 
1054 aa  667    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4393  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.18 
 
 
1031 aa  720    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.421403  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  36.93 
 
 
1033 aa  723    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  37.07 
 
 
1029 aa  746    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2011  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.61 
 
 
1040 aa  739    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.742526  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  35.15 
 
 
1077 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  37.13 
 
 
1063 aa  706    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.23 
 
 
1034 aa  696    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  36.85 
 
 
1039 aa  725    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0147  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.74 
 
 
1443 aa  694    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.33 
 
 
1034 aa  689    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  35.44 
 
 
1061 aa  637    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.94 
 
 
1454 aa  682    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.668316 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  34.56 
 
 
1030 aa  677    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  38.16 
 
 
1050 aa  741    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  100 
 
 
1034 aa  2083    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  35.15 
 
 
1077 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2944  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.99 
 
 
1054 aa  709    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1588  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.07 
 
 
1439 aa  691    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.418417 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.69 
 
 
1034 aa  684    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  35.59 
 
 
1050 aa  664    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  35.92 
 
 
1070 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.18 
 
 
1031 aa  720    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  36.15 
 
 
1034 aa  676    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  35.92 
 
 
1083 aa  700    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2297  CzcA family heavy metal efflux protein  34.53 
 
 
1080 aa  636    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446981  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  35.97 
 
 
1048 aa  649    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  36.56 
 
 
1040 aa  643    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  35.67 
 
 
1040 aa  640    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2549  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.5 
 
 
1046 aa  1113    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595471  normal  0.0930113 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  42.14 
 
 
1019 aa  816    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  35.78 
 
 
1048 aa  648    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  35.55 
 
 
1077 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  36.55 
 
 
1053 aa  675    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  36.55 
 
 
1053 aa  675    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  39.15 
 
 
1040 aa  746    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3687  CzcA family heavy metal efflux protein  39.83 
 
 
1049 aa  743    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534955  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  35.15 
 
 
1077 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  35.26 
 
 
1029 aa  656    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.13 
 
 
1459 aa  694    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2529  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.89 
 
 
1055 aa  704    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0729585 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2728  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.35 
 
 
1450 aa  674    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632568  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  35.65 
 
 
1031 aa  643    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  38.56 
 
 
1029 aa  726    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  34.71 
 
 
1040 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.09 
 
 
1052 aa  647    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.99 
 
 
1038 aa  1143    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  35.33 
 
 
1083 aa  642    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1242  CzcA family heavy metal efflux protein  38.89 
 
 
1056 aa  723    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.861006  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  36.45 
 
 
1053 aa  671    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3726  heavy metal efflux pump, CzcA family  53.19 
 
 
1040 aa  1110    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0290592  normal  0.111264 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2683  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.42 
 
 
1458 aa  686    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.858123  normal  0.311516 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  49.12 
 
 
1032 aa  1052    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.31 
 
 
1039 aa  1108    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  35.71 
 
 
1069 aa  646    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  35.87 
 
 
1072 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  38.73 
 
 
1459 aa  700    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.41 
 
 
1056 aa  727    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  39.1 
 
 
1050 aa  762    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3517  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.35 
 
 
1042 aa  696    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416534  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.99 
 
 
1054 aa  709    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  39.63 
 
 
1040 aa  753    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  35.62 
 
 
1023 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  68.68 
 
 
1040 aa  1481    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  38.05 
 
 
1045 aa  754    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  35.58 
 
 
1039 aa  697    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  38.74 
 
 
1027 aa  780    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  35.18 
 
 
1046 aa  641    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  38.03 
 
 
1455 aa  710    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  50.97 
 
 
1031 aa  1097    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  35.93 
 
 
1048 aa  650    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0917  heavy metal efflux pump, CzcA family  50.73 
 
 
1043 aa  1090    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.164104 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  36.34 
 
 
1036 aa  712    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  36.88 
 
 
1028 aa  756    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  37.33 
 
 
1456 aa  668    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
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NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  53.39 
 
 
1032 aa  1132    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal 
 
 
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