More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2549 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  38.81 
 
 		 1034 aa  692    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2944  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.32 
 
 		 1054 aa  743    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  38.31 
 
 		 1034 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2728  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.7 
 
 		 1450 aa  645    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.32 
 
 		 1054 aa  743    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3687  CzcA family heavy metal efflux protein  40.74 
 
 		 1049 aa  739    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  44.62 
 
 		 1021 aa  828    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.03 
 
 		 1034 aa  692    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  36.95 
 
 		 1033 aa  647    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  39.56 
 
 		 1033 aa  744    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.08 
 
 		 1063 aa  644    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  36.69 
 
 		 1032 aa  682    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  40.6 
 
 		 1028 aa  781    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  79.4 
 
 		 1038 aa  1716    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  37.89 
 
 		 1038 aa  719    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.41 
 
 		 1034 aa  701    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  38.84 
 
 		 1063 aa  716    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  57.71 
 
 		 1039 aa  1251    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  37.1 
 
 		 1456 aa  665    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  37 
 
 		 1077 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  36.69 
 
 		 1053 aa  637    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  36.61 
 
 		 1077 aa  669    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  37.66 
 
 		 1025 aa  689    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  36.21 
 
 		 1049 aa  668    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  35.92 
 
 		 1052 aa  652    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  52.07 
 
 		 1040 aa  1137    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2529  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.14 
 
 		 1055 aa  737    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0729585 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  41.72 
 
 		 1033 aa  753    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  41.17 
 
 		 1029 aa  787    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4393  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.43 
 
 		 1031 aa  707    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.421403  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  37.37 
 
 		 1070 aa  670    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0687  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.6 
 
 		 1033 aa  641    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0323863 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.6 
 
 		 1025 aa  734    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  40.86 
 
 		 1039 aa  785    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1404  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.73 
 
 		 1056 aa  730    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100387  normal  0.0917264 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  36.18 
 
 		 1075 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  35.72 
 
 		 1059 aa  643    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2683  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.41 
 
 		 1458 aa  654    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.858123  normal  0.311516 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  40.61 
 
 		 1050 aa  757    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  37.09 
 
 		 1077 aa  674    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  39.14 
 
 		 1045 aa  637    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  35.34 
 
 		 1047 aa  637    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.45 
 
 		 1454 aa  662    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.668316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  62.08 
 
 		 1032 aa  1302    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  36.9 
 
 		 1050 aa  666    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  36.9 
 
 		 1083 aa  719    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  37.19 
 
 		 1070 aa  671    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  37.27 
 
 		 1070 aa  669    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  38.54 
 
 		 1034 aa  677    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  36.71 
 
 		 1077 aa  670    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.43 
 
 		 1031 aa  707    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2011  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.02 
 
 		 1040 aa  762    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.742526  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4985  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.14 
 
 		 1055 aa  737    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00799341 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.75 
 
 		 1034 aa  673    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  37.92 
 
 		 1079 aa  714    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  42.93 
 
 		 1019 aa  827    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  36.79 
 
 		 1459 aa  660    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  37.14 
 
 		 1077 aa  666    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.63 
 
 		 1056 aa  736    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  37.37 
 
 		 1070 aa  671    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1242  CzcA family heavy metal efflux protein  39.73 
 
 		 1056 aa  731    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.861006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  41.05 
 
 		 1040 aa  770    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  36.19 
 
 		 1029 aa  642    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  77.13 
 
 		 1031 aa  1637    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  41.51 
 
 		 1040 aa  773    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.23 
 
 		 1459 aa  688    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  37.37 
 
 		 1036 aa  696    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  37 
 
 		 1077 aa  674    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  37.13 
 
 		 1031 aa  662    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  40.72 
 
 		 1029 aa  748    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  35.25 
 
 		 1040 aa  640    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  35.91 
 
 		 1046 aa  635    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  51.5 
 
 		 1034 aa  1124    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  36.89 
 
 		 1083 aa  665    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  68.54 
 
 		 1032 aa  1486    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.54 
 
 		 1052 aa  671    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  37.26 
 
 		 1030 aa  686    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3517  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.2 
 
 		 1042 aa  695    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416534  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  38.62 
 
 		 1034 aa  734    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  37.15 
 
 		 1054 aa  673    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  36.71 
 
 		 1077 aa  670    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  36.24 
 
 		 1069 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  36.44 
 
 		 1072 aa  649    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1588  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.83 
 
 		 1439 aa  650    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.418417 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  35.69 
 
 		 1051 aa  642    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  41.27 
 
 		 1050 aa  781    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  36.89 
 
 		 1063 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  37.88 
 
 		 1455 aa  690    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  38.96 
 
 		 1023 aa  655    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  36.62 
 
 		 1043 aa  653    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  40.42 
 
 		 1045 aa  785    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  36.67 
 
 		 1039 aa  697    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  40.52 
 
 		 1027 aa  798    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  36.71 
 
 		 1077 aa  670    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  36.97 
 
 		 1048 aa  661    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  35.89 
 
 		 1061 aa  636    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1550  CzcA family heavy metal efflux protein  37.23 
 
 		 1057 aa  648    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  36.33 
 
 		 1046 aa  639    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  38.06 
 
 		 1032 aa  699    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  37.37 
 
 		 1070 aa  671    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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