More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0018 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  35.63 
 
 		 1034 aa  649    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0687  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.12 
 
 		 1033 aa  644    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0323863 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  35.86 
 
 		 1034 aa  642    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.16 
 
 		 1462 aa  636    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  34.52 
 
 		 1036 aa  665    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3726  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.96 
 
 		 1040 aa  735    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0290592  normal  0.111264 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  41.81 
 
 		 1021 aa  774    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  56.24 
 
 		 1033 aa  1159    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.01 
 
 		 1047 aa  641    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  36.06 
 
 		 1083 aa  651    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  37.54 
 
 		 1038 aa  689    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  100 
 
 		 1034 aa  2075    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.73 
 
 		 1025 aa  794    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2529  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.82 
 
 		 1055 aa  664    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0729585 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6552  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.76 
 
 		 1060 aa  652    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.418504 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.56 
 
 		 1034 aa  639    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  39.69 
 
 		 1033 aa  713    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  41.82 
 
 		 1029 aa  794    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.92 
 
 		 1054 aa  669    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  41.26 
 
 		 1039 aa  783    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.17 
 
 		 1038 aa  762    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  37.32 
 
 		 1050 aa  650    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.04 
 
 		 1056 aa  636    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4393  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.24 
 
 		 1031 aa  669    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.421403  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.47 
 
 		 1034 aa  639    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  36.46 
 
 		 1034 aa  638    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  36.65 
 
 		 1079 aa  661    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1550  CzcA family heavy metal efflux protein  38.18 
 
 		 1057 aa  645    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.67 
 
 		 1034 aa  639    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  37.17 
 
 		 1063 aa  687    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  39.71 
 
 		 1019 aa  770    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2928  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.57 
 
 		 1032 aa  777    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  36.51 
 
 		 1034 aa  723    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  36.63 
 
 		 1025 aa  645    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  38.96 
 
 		 1032 aa  736    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.85 
 
 		 1039 aa  756    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  38.57 
 
 		 1029 aa  682    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4985  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.82 
 
 		 1055 aa  663    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00799341 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3517  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.77 
 
 		 1042 aa  704    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416534  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  38.91 
 
 		 1030 aa  702    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2944  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.92 
 
 		 1054 aa  669    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  44.2 
 
 		 1028 aa  843    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7204  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.88 
 
 		 1051 aa  677    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.57085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  36.7 
 
 		 1032 aa  725    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0917  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.67 
 
 		 1043 aa  770    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.164104 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  37.03 
 
 		 1050 aa  664    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4058  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.18 
 
 		 1037 aa  737    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2549  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.33 
 
 		 1046 aa  748    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595471  normal  0.0930113 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  37.12 
 
 		 1043 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  38.17 
 
 		 1045 aa  711    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  38 
 
 		 1039 aa  696    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  36.3 
 
 		 1027 aa  650    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  36.21 
 
 		 1032 aa  659    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.56 
 
 		 1040 aa  720    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.24 
 
 		 1031 aa  669    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.33 
 
 		 1031 aa  731    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3687  CzcA family heavy metal efflux protein  37.78 
 
 		 1049 aa  633  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534955  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1588  heavy metal efflux pump, CzcA family  36 
 
 		 1439 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.418417 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1242  CzcA family heavy metal efflux protein  36.74 
 
 		 1056 aa  629  1e-179  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.861006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  37.08 
 
 		 1040 aa  631  1e-179  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1404  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.74 
 
 		 1056 aa  629  1e-178  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100387  normal  0.0917264 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  36.6 
 
 		 1075 aa  627  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  37.33 
 
 		 1070 aa  627  1e-178  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2011  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.63 
 
 		 1040 aa  627  1e-178  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.742526  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  36.52 
 
 		 1054 aa  626  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.55 
 
 		 1459 aa  625  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31010  putative cation efflux system protein  37.04 
 
 		 1045 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160016  unclonable  6.07631e-21 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2728  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.77 
 
 		 1450 aa  625  1e-177  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632568  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  36.47 
 
 		 1064 aa  624  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  36.28 
 
 		 1049 aa  624  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  36.26 
 
 		 1040 aa  623  1e-177  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  36.34 
 
 		 1043 aa  624  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.67 
 
 		 1454 aa  624  1e-177  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.668316 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.73 
 
 		 1052 aa  623  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  36.7 
 
 		 1051 aa  619  1e-176  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  36.11 
 
 		 1059 aa  622  1e-176  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  35.1 
 
 		 1459 aa  622  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  35.35 
 
 		 1062 aa  621  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  36.58 
 
 		 1070 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  36.49 
 
 		 1070 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  36.58 
 
 		 1070 aa  620  1e-176  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4462  CzcA family heavy metal efflux protein  35 
 
 		 1446 aa  616  1e-175  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  36.49 
 
 		 1070 aa  618  1e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  36.36 
 
 		 1062 aa  618  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3868  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA (cation efflux system protein CzcA)  35.48 
 
 		 1044 aa  618  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  36.3 
 
 		 1061 aa  619  1e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  35.03 
 
 		 1033 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  35.19 
 
 		 1032 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  37.64 
 
 		 1077 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  37.64 
 
 		 1077 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  37.64 
 
 		 1077 aa  615  9.999999999999999e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.63 
 
 		 1063 aa  610  1e-173  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  37.36 
 
 		 1077 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  35.28 
 
 		 1050 aa  610  1e-173  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  37.36 
 
 		 1077 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  37.36 
 
 		 1077 aa  610  1e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  33.46 
 
 		 1455 aa  612  1e-173  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  35.18 
 
 		 1040 aa  609  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  36.04 
 
 		 1083 aa  612  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
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NC_006369  lpl1046  HelA protein  35.8 
 
 		 1052 aa  607  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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