More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_1546 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  49.48 
 
 		 1040 aa  1015    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2529  heavy metal efflux pump, CzcA family  68.33 
 
 		 1055 aa  1423    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0729585 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  40.36 
 
 		 1021 aa  711    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.09 
 
 		 1038 aa  719    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  67.66 
 
 		 1083 aa  1523    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  36.58 
 
 		 1051 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  100 
 
 		 1079 aa  2179    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3687  CzcA family heavy metal efflux protein  49.24 
 
 		 1049 aa  987    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  37.31 
 
 		 1034 aa  706    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4058  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.75 
 
 		 1037 aa  719    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  37.96 
 
 		 1033 aa  641    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  38.57 
 
 		 1029 aa  704    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.6 
 
 		 1025 aa  676    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  68.61 
 
 		 1054 aa  1435    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  34.73 
 
 		 1036 aa  638    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.62 
 
 		 1031 aa  706    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4985  heavy metal efflux pump, CzcA family  68.33 
 
 		 1055 aa  1424    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00799341 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  38.78 
 
 		 1039 aa  700    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  48.95 
 
 		 1056 aa  989    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  49.31 
 
 		 1050 aa  1017    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  39.27 
 
 		 1028 aa  739    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.16 
 
 		 1040 aa  677    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3517  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.92 
 
 		 1042 aa  645    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416534  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1242  CzcA family heavy metal efflux protein  48.75 
 
 		 1056 aa  979    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.861006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2928  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.74 
 
 		 1032 aa  768    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  38.93 
 
 		 1019 aa  705    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  49 
 
 		 1040 aa  1011    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1404  heavy metal efflux pump, CzcA family  48.75 
 
 		 1056 aa  980    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100387  normal  0.0917264 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4393  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.27 
 
 		 1031 aa  706    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.421403  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  40.04 
 
 		 1025 aa  733    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1612  acriflavin resistance protein  38.64 
 
 		 1010 aa  690    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2944  heavy metal efflux pump, CzcA family  68.61 
 
 		 1054 aa  1435    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  38.26 
 
 		 1032 aa  734    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0792  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.75 
 
 		 1027 aa  736    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00116886  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  41.59 
 
 		 1029 aa  759    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3726  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.83 
 
 		 1040 aa  742    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0290592  normal  0.111264 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.27 
 
 		 1031 aa  706    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.98 
 
 		 1039 aa  749    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  61 
 
 		 1063 aa  1288    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  38.71 
 
 		 1032 aa  702    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  50.05 
 
 		 1050 aa  1049    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0917  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.37 
 
 		 1043 aa  776    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.164104 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  71.4 
 
 		 1045 aa  1549    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  37.35 
 
 		 1027 aa  680    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2011  heavy metal efflux pump, CzcA family  49.48 
 
 		 1040 aa  1006    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.742526  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2549  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.92 
 
 		 1046 aa  699    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595471  normal  0.0930113 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.12 
 
 		 1034 aa  635  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  34.96 
 
 		 1047 aa  634  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  36.71 
 
 		 1034 aa  632  1e-179  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.15 
 
 		 1052 aa  630  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  34.77 
 
 		 1032 aa  628  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  35.96 
 
 		 1077 aa  628  1e-178  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.76 
 
 		 1462 aa  627  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  35.13 
 
 		 1034 aa  625  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.72 
 
 		 1034 aa  625  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  35.89 
 
 		 1038 aa  625  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  35.24 
 
 		 1050 aa  624  1e-177  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.31 
 
 		 1049 aa  625  1e-177  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  35.63 
 
 		 1053 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7204  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.9 
 
 		 1051 aa  622  1e-176  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.57085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  35.63 
 
 		 1053 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  35.36 
 
 		 1034 aa  620  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  35.63 
 
 		 1062 aa  620  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  35.63 
 
 		 1053 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  35.88 
 
 		 1069 aa  620  1e-176  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  36.24 
 
 		 1043 aa  620  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  35.38 
 
 		 1032 aa  616  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  35.5 
 
 		 1077 aa  616  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  35.5 
 
 		 1077 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  35.54 
 
 		 1053 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  35.5 
 
 		 1077 aa  617  1e-175  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  35.4 
 
 		 1077 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.81 
 
 		 1034 aa  614  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  35.4 
 
 		 1077 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  35.4 
 
 		 1077 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  35.88 
 
 		 1039 aa  615  9.999999999999999e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  35.31 
 
 		 1077 aa  611  1e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  35.33 
 
 		 1075 aa  609  1e-173  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  35.81 
 
 		 1054 aa  609  1e-173  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  33.96 
 
 		 1065 aa  611  1e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2683  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.67 
 
 		 1458 aa  611  1e-173  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.858123  normal  0.311516 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  34.89 
 
 		 1034 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  35.59 
 
 		 1070 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  35.89 
 
 		 1030 aa  608  9.999999999999999e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  35.71 
 
 		 1070 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  35.17 
 
 		 1049 aa  604  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  35.95 
 
 		 1052 aa  605  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  35.62 
 
 		 1070 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  35.62 
 
 		 1070 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  35.86 
 
 		 1072 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  35.62 
 
 		 1070 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  35.19 
 
 		 1033 aa  600  1e-170  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3555  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.33 
 
 		 1062 aa  601  1e-170  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  35.33 
 
 		 1054 aa  601  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  34.28 
 
 		 1059 aa  602  1e-170  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  36.54 
 
 		 1048 aa  600  1e-170  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  33.55 
 
 		 1040 aa  599  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  34.11 
 
 		 1083 aa  601  1e-170  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  35.51 
 
 		 1053 aa  598  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  34.68 
 
 		 1062 aa  596  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>