More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3517 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



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Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  39.9 
 
 		 1025 aa  689    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3369  CzcA family heavy metal efflux protein  38.38 
 
 		 1060 aa  640    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  35.56 
 
 		 1034 aa  659    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  38.55 
 
 		 1077 aa  666    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4682  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.87 
 
 		 1049 aa  638    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.439534 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  38.62 
 
 		 1053 aa  685    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  39.19 
 
 		 1048 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  42.42 
 
 		 1021 aa  772    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  39.15 
 
 		 1032 aa  666    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  37.33 
 
 		 1033 aa  684    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  39.55 
 
 		 1033 aa  718    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  39.79 
 
 		 1061 aa  656    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  42.73 
 
 		 1032 aa  812    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  38.55 
 
 		 1077 aa  666    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  38.62 
 
 		 1053 aa  685    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  68.04 
 
 		 1038 aa  1402    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  40.47 
 
 		 1064 aa  703    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  36.79 
 
 		 1046 aa  639    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  39 
 
 		 1048 aa  665    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  35.58 
 
 		 1032 aa  664    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0225  CzcA family heavy metal efflux protein  38.02 
 
 		 1040 aa  652    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  38.21 
 
 		 1053 aa  659    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  38.44 
 
 		 1077 aa  660    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  39.26 
 
 		 1049 aa  715    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  38.89 
 
 		 1052 aa  692    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  38.17 
 
 		 1054 aa  660    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2297  CzcA family heavy metal efflux protein  38.03 
 
 		 1080 aa  646    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446981  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  39.41 
 
 		 1033 aa  679    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  39.4 
 
 		 1029 aa  734    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  37.29 
 
 		 1032 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  38.53 
 
 		 1077 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  36.9 
 
 		 1032 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  40.22 
 
 		 1028 aa  721    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  40.33 
 
 		 1039 aa  752    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1402  CzcA family heavy metal efflux protein  38.9 
 
 		 1079 aa  638    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0340496 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  38.4 
 
 		 1075 aa  684    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  36.82 
 
 		 1032 aa  704    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  38.91 
 
 		 1059 aa  702    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  38.28 
 
 		 1066 aa  641    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  37.85 
 
 		 1050 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  38.55 
 
 		 1077 aa  665    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  36.92 
 
 		 1045 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  37.82 
 
 		 1047 aa  636    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1550  CzcA family heavy metal efflux protein  75.98 
 
 		 1057 aa  1482    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7263  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  38.4 
 
 		 1060 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.24626 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  38.18 
 
 		 1050 aa  669    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  38.12 
 
 		 1070 aa  663    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  37.37 
 
 		 1062 aa  647    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  35.76 
 
 		 1034 aa  640    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  38.46 
 
 		 1051 aa  674    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  38.62 
 
 		 1053 aa  685    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  37.92 
 
 		 1079 aa  658    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  77.66 
 
 		 1030 aa  1574    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  38.74 
 
 		 1054 aa  681    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  38.12 
 
 		 1040 aa  666    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  41.27 
 
 		 1019 aa  788    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  38.21 
 
 		 1058 aa  636    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  38.17 
 
 		 1077 aa  664    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.38 
 
 		 1031 aa  708    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  38.95 
 
 		 1029 aa  686    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  36.35 
 
 		 1034 aa  703    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  37.24 
 
 		 1459 aa  662    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  40.35 
 
 		 1036 aa  764    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  38.23 
 
 		 1043 aa  660    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  37.87 
 
 		 1061 aa  654    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  38.67 
 
 		 1034 aa  689    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  37.66 
 
 		 1031 aa  681    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  41.03 
 
 		 1029 aa  704    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  37.48 
 
 		 1040 aa  671    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  38.89 
 
 		 1046 aa  671    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  38.19 
 
 		 1083 aa  658    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  38.53 
 
 		 1077 aa  662    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  38.09 
 
 		 1070 aa  660    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  38.09 
 
 		 1070 aa  661    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  38.33 
 
 		 1070 aa  641    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0387  CzcA family heavy metal efflux protein  37.5 
 
 		 1051 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  38.53 
 
 		 1077 aa  662    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0614  CzcA family heavy metal efflux protein  38.48 
 
 		 1069 aa  639    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  35.7 
 
 		 1455 aa  643    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  38.1 
 
 		 1069 aa  662    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  37.51 
 
 		 1072 aa  656    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  38.52 
 
 		 1053 aa  682    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  38.68 
 
 		 1079 aa  694    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  37.52 
 
 		 1050 aa  663    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  38.77 
 
 		 1063 aa  689    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3413  RND divalent metal cation efflux transporter CnrA  37.93 
 
 		 1082 aa  650    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382082  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6210  heavy metal efflux pump CzcA  35.81 
 
 		 1076 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339725  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  37.48 
 
 		 1023 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  39.31 
 
 		 1043 aa  704    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  39.1 
 
 		 1048 aa  664    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  37.54 
 
 		 1045 aa  667    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  67.61 
 
 		 1039 aa  1394    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  40.25 
 
 		 1027 aa  721    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  37.86 
 
 		 1040 aa  668    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  37.79 
 
 		 1062 aa  673    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  38.09 
 
 		 1070 aa  659    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  38.09 
 
 		 1070 aa  661    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  37.12 
 
 		 1037 aa  639    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.77 
 
 		 1063 aa  689    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
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NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  37.84 
 
 		 1032 aa  717    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
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