More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_6210 on replicon NC_007972
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  38.33 
 
 		 1034 aa  728    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  48.47 
 
 		 1062 aa  971    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  38.3 
 
 		 1034 aa  696    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  39.74 
 
 		 1456 aa  729    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  49.48 
 
 		 1053 aa  1014    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  48.83 
 
 		 1048 aa  976    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  48.56 
 
 		 1048 aa  977    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  48.09 
 
 		 1061 aa  973    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  38.42 
 
 		 1032 aa  695    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  37.36 
 
 		 1033 aa  690    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7263  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  49.43 
 
 		 1060 aa  1001    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.24626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31010  putative cation efflux system protein  48.18 
 
 		 1045 aa  967    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160016  unclonable  6.07631e-21 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  48.5 
 
 		 1054 aa  1006    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3984  CzcA family heavy metal efflux protein  50.09 
 
 		 1069 aa  1027    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.544325  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3413  RND divalent metal cation efflux transporter CnrA  55.87 
 
 		 1082 aa  1159    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0614  CzcA family heavy metal efflux protein  50.09 
 
 		 1069 aa  1031    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  49.34 
 
 		 1064 aa  999    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  49.16 
 
 		 1077 aa  1009    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  46.5 
 
 		 1038 aa  922    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7181  heavy metal efflux pump CzcA  50.18 
 
 		 1062 aa  995    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  49.16 
 
 		 1077 aa  1009    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  49.48 
 
 		 1053 aa  996    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  49.07 
 
 		 1077 aa  1008    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  48.51 
 
 		 1051 aa  997    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  48.68 
 
 		 1049 aa  1016    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  48.4 
 
 		 1052 aa  996    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  48.94 
 
 		 1054 aa  996    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  38.07 
 
 		 1036 aa  647    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  38.99 
 
 		 1029 aa  724    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3868  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA (cation efflux system protein CzcA)  48.21 
 
 		 1044 aa  990    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  37.15 
 
 		 1032 aa  640    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  48.73 
 
 		 1070 aa  1008    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4154  CzcA family heavy metal efflux protein  49.28 
 
 		 1046 aa  976    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  37.34 
 
 		 1032 aa  649    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  49.44 
 
 		 1077 aa  1014    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  49.48 
 
 		 1053 aa  1014    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  49.39 
 
 		 1053 aa  1011    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  49.63 
 
 		 1075 aa  1007    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  48.59 
 
 		 1048 aa  974    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0143  heavy metal efflux pump CzcA  39.66 
 
 		 1023 aa  646    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.609125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  48.01 
 
 		 1059 aa  1015    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  48.41 
 
 		 1066 aa  967    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3457  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  49.19 
 
 		 1038 aa  972    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.230333  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  49.44 
 
 		 1077 aa  1014    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  37.55 
 
 		 1045 aa  662    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  47.01 
 
 		 1047 aa  955    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  48.62 
 
 		 1062 aa  977    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  49.53 
 
 		 1050 aa  1020    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  48.64 
 
 		 1070 aa  1010    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3995  CzcA family heavy metal efflux protein  45.62 
 
 		 1047 aa  927    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  38.48 
 
 		 1034 aa  716    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  39.22 
 
 		 1028 aa  675    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  35.01 
 
 		 1065 aa  636    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  37.23 
 
 		 1032 aa  705    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  45.45 
 
 		 1037 aa  919    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  48.73 
 
 		 1070 aa  1008    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  37.91 
 
 		 1040 aa  682    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  49.16 
 
 		 1077 aa  1009    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  37.98 
 
 		 1019 aa  667    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  47.2 
 
 		 1058 aa  941    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  49.22 
 
 		 1077 aa  1021    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  40.84 
 
 		 1022 aa  681    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4462  CzcA family heavy metal efflux protein  39.51 
 
 		 1446 aa  739    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0225  CzcA family heavy metal efflux protein  48.37 
 
 		 1040 aa  952    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11693  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  39.15 
 
 		 1481 aa  713    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  61.15 
 
 		 1083 aa  1354    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2382  CzcA family heavy metal efflux protein  41.96 
 
 		 1040 aa  730    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34537  normal  0.0621249 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  47.6 
 
 		 1043 aa  973    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  47.39 
 
 		 1038 aa  951    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  38.68 
 
 		 1031 aa  698    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  50.09 
 
 		 1061 aa  978    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  48.32 
 
 		 1040 aa  1006    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  49.29 
 
 		 1046 aa  981    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  48.61 
 
 		 1083 aa  1009    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3369  CzcA family heavy metal efflux protein  48.42 
 
 		 1060 aa  971    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957207  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  49.31 
 
 		 1070 aa  1022    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  49.68 
 
 		 1070 aa  1023    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  48.66 
 
 		 1056 aa  1021    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4188  heavy metal efflux pump CzcA  39.21 
 
 		 1026 aa  663    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809737 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4384  CzcA family heavy metal efflux protein  46.1 
 
 		 1047 aa  936    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.55849  normal  0.35087 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  49.68 
 
 		 1069 aa  1037    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  48.97 
 
 		 1072 aa  1004    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  55.45 
 
 		 1079 aa  1159    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0387  CzcA family heavy metal efflux protein  47.08 
 
 		 1051 aa  952    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  47.6 
 
 		 1063 aa  992    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6145  proton antiporter cation efflux protein NccA  89.27 
 
 		 1076 aa  1895    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6210  heavy metal efflux pump CzcA  100 
 
 		 1076 aa  2149    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339725  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  39.24 
 
 		 1023 aa  652    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  49.58 
 
 		 1043 aa  1015    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2607  CzcA family heavy metal efflux protein  54.9 
 
 		 1061 aa  1087    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0578707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  36.03 
 
 		 1028 aa  639    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  48.46 
 
 		 1040 aa  978    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  39.85 
 
 		 1455 aa  759    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  49.44 
 
 		 1077 aa  1014    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  46.35 
 
 		 1037 aa  934    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2449  heavy metal efflux pump CzcA  54.98 
 
 		 1075 aa  1120    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  38.81 
 
 		 1459 aa  711    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2569  heavy metal efflux pump CzcA  55.17 
 
 		 1078 aa  1125    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.819785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2579  heavy metal efflux pump CzcA  59.14 
 
 		 1081 aa  1285    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.820402 
 
 
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NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  48.73 
 
 		 1070 aa  1008    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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