More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1959 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  38.54 
 
 		 1070 aa  678    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  38.54 
 
 		 1070 aa  678    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  40.79 
 
 		 1034 aa  753    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  38.78 
 
 		 1070 aa  684    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  40.7 
 
 		 1034 aa  733    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  59.44 
 
 		 1053 aa  1260    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  58.39 
 
 		 1048 aa  1209    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4066  CzcA family heavy metal efflux protein  36.28 
 
 		 1017 aa  653    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  37.28 
 
 		 1021 aa  644    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  41.53 
 
 		 1032 aa  726    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  40.62 
 
 		 1033 aa  755    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3951  CzcA family heavy metal efflux protein  36.43 
 
 		 1017 aa  655    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  58.58 
 
 		 1062 aa  1216    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  57.27 
 
 		 1077 aa  1219    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2720  CzcA family heavy metal efflux protein  38.63 
 
 		 1016 aa  669    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.541366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  40.19 
 
 		 1049 aa  676    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  56.61 
 
 		 1064 aa  1192    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4384  CzcA family heavy metal efflux protein  58.28 
 
 		 1047 aa  1206    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.55849  normal  0.35087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  100 
 
 		 1038 aa  2076    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  38.82 
 
 		 1066 aa  718    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  44.61 
 
 		 1455 aa  845    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  38.4 
 
 		 1075 aa  674    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  59.19 
 
 		 1053 aa  1234    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  57.17 
 
 		 1077 aa  1217    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  58.52 
 
 		 1049 aa  1241    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  58.35 
 
 		 1052 aa  1231    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  58.72 
 
 		 1054 aa  1237    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  41.4 
 
 		 1036 aa  700    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  37.24 
 
 		 1033 aa  645    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  37.46 
 
 		 1029 aa  664    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  40.3 
 
 		 1032 aa  717    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  57.27 
 
 		 1077 aa  1219    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  37.68 
 
 		 1066 aa  674    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  40.1 
 
 		 1032 aa  720    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2801  heavy metal efflux pump CzcA  38.62 
 
 		 1028 aa  640    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  38 
 
 		 1039 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  41.45 
 
 		 1038 aa  697    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  57.01 
 
 		 1075 aa  1221    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  38.43 
 
 		 1068 aa  676    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  57.35 
 
 		 1054 aa  1219    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  59.94 
 
 		 1059 aa  1282    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  44.57 
 
 		 1456 aa  832    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  58.51 
 
 		 1066 aa  1201    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  57.2 
 
 		 1077 aa  1222    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  41.6 
 
 		 1045 aa  717    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  56.73 
 
 		 1047 aa  1165    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  58.19 
 
 		 1062 aa  1220    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4154  CzcA family heavy metal efflux protein  60.35 
 
 		 1046 aa  1219    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36883 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  58.1 
 
 		 1050 aa  1242    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  56.57 
 
 		 1070 aa  1226    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  56.48 
 
 		 1070 aa  1229    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  41.18 
 
 		 1034 aa  750    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  39.48 
 
 		 1028 aa  720    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  38.45 
 
 		 1065 aa  729    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  38.38 
 
 		 1064 aa  728    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  58.61 
 
 		 1037 aa  1206    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  57.36 
 
 		 1077 aa  1222    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  39.75 
 
 		 1040 aa  727    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3858  CzcA family heavy metal efflux protein  36.28 
 
 		 1017 aa  653    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  57.36 
 
 		 1077 aa  1222    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  57.67 
 
 		 1058 aa  1186    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  57.48 
 
 		 1077 aa  1216    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  39.23 
 
 		 1022 aa  704    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3857  heavy metal efflux pump CzcA  40.08 
 
 		 1045 aa  651    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  40.99 
 
 		 1046 aa  754    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3457  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  59.77 
 
 		 1038 aa  1207    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.230333  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4294  heavy metal efflux pump CzcA  39.46 
 
 		 1026 aa  654    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  47.18 
 
 		 1083 aa  987    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  60 
 
 		 1061 aa  1240    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11693  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  41.95 
 
 		 1481 aa  760    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  69.44 
 
 		 1043 aa  1444    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  66.96 
 
 		 1038 aa  1387    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3887  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  36.53 
 
 		 1017 aa  650    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  38.17 
 
 		 1062 aa  671    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  40.52 
 
 		 1031 aa  734    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  57.27 
 
 		 1077 aa  1219    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  58.96 
 
 		 1040 aa  1246    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  57.46 
 
 		 1046 aa  1190    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  55.89 
 
 		 1083 aa  1222    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0576  heavy metal efflux pump CzcA  38.34 
 
 		 1077 aa  671    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  56.88 
 
 		 1070 aa  1198    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2319  CzcA family heavy metal efflux protein  39.64 
 
 		 1035 aa  692    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  57.78 
 
 		 1070 aa  1217    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  57.07 
 
 		 1056 aa  1188    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4188  heavy metal efflux pump CzcA  39.25 
 
 		 1026 aa  668    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809737 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  38.68 
 
 		 1028 aa  689    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0099  CzcA family heavy metal efflux protein  35.76 
 
 		 1017 aa  658    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  57.93 
 
 		 1069 aa  1231    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  59.08 
 
 		 1072 aa  1225    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31010  putative cation efflux system protein  59.65 
 
 		 1045 aa  1224    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160016  unclonable  6.07631e-21 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  49.91 
 
 		 1079 aa  1032    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  58.56 
 
 		 1063 aa  1246    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6145  proton antiporter cation efflux protein NccA  46.44 
 
 		 1076 aa  926    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6210  heavy metal efflux pump CzcA  46.5 
 
 		 1076 aa  947    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339725  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  41.12 
 
 		 1023 aa  718    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  58.34 
 
 		 1043 aa  1237    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  67.95 
 
 		 1037 aa  1422    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2449  heavy metal efflux pump CzcA  49.62 
 
 		 1075 aa  975    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2569  heavy metal efflux pump CzcA  50.05 
 
 		 1078 aa  1012    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.819785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2579  heavy metal efflux pump CzcA  46.23 
 
 		 1081 aa  927    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.820402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>