More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_11693 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  39.06 
 
 		 1034 aa  741    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  41.49 
 
 		 1061 aa  783    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  39.21 
 
 		 1034 aa  718    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  41.42 
 
 		 1053 aa  832    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  42.21 
 
 		 1048 aa  813    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4154  CzcA family heavy metal efflux protein  41.45 
 
 		 1046 aa  777    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36883 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  37.65 
 
 		 1021 aa  657    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  38.28 
 
 		 1032 aa  692    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  36.26 
 
 		 1033 aa  696    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  35.55 
 
 		 1066 aa  682    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  35.09 
 
 		 1076 aa  682    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  43 
 
 		 1048 aa  839    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2720  CzcA family heavy metal efflux protein  36.82 
 
 		 1016 aa  664    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.541366  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7181  heavy metal efflux pump CzcA  41.19 
 
 		 1062 aa  749    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  41.42 
 
 		 1053 aa  832    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  44.13 
 
 		 1456 aa  1198    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  41.58 
 
 		 1064 aa  813    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  44.7 
 
 		 1455 aa  1234    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  42.88 
 
 		 1038 aa  801    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  36.82 
 
 		 1066 aa  679    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7263  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  41.78 
 
 		 1060 aa  810    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.24626 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  35.1 
 
 		 1075 aa  671    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  43.06 
 
 		 1053 aa  837    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  41.32 
 
 		 1077 aa  834    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  36.43 
 
 		 1046 aa  662    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4384  CzcA family heavy metal efflux protein  41.33 
 
 		 1047 aa  784    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.55849  normal  0.35087 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  43.3 
 
 		 1049 aa  865    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  42.55 
 
 		 1052 aa  845    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.39 
 
 		 1070 aa  681    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  42.55 
 
 		 1054 aa  835    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11693  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  100 
 
 		 1481 aa  2991    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  43.94 
 
 		 1054 aa  888    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4462  CzcA family heavy metal efflux protein  41.07 
 
 		 1446 aa  1087    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  36.91 
 
 		 1032 aa  677    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  35.29 
 
 		 1070 aa  675    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  36.88 
 
 		 1032 aa  674    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  42.57 
 
 		 1070 aa  854    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  41.72 
 
 		 1459 aa  1072    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  36.48 
 
 		 1038 aa  638    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  42.57 
 
 		 1075 aa  855    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  41.42 
 
 		 1077 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  44.32 
 
 		 1062 aa  833    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  41.61 
 
 		 1059 aa  837    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  40.62 
 
 		 1037 aa  790    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  41.85 
 
 		 1066 aa  776    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0225  CzcA family heavy metal efflux protein  42.95 
 
 		 1040 aa  803    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  41.51 
 
 		 1077 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  37.18 
 
 		 1045 aa  672    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  43.82 
 
 		 1047 aa  828    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  42.3 
 
 		 1062 aa  812    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  41.42 
 
 		 1077 aa  837    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  42.75 
 
 		 1050 aa  848    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3457  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  42.03 
 
 		 1038 aa  786    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.230333  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  42.86 
 
 		 1070 aa  856    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  35.72 
 
 		 1068 aa  691    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  39.34 
 
 		 1034 aa  728    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  35.19 
 
 		 1028 aa  642    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  36.32 
 
 		 1065 aa  707    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  35.93 
 
 		 1064 aa  689    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  41.36 
 
 		 1037 aa  794    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  35.81 
 
 		 1075 aa  687    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  35.81 
 
 		 1040 aa  670    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.29 
 
 		 1070 aa  675    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  36.31 
 
 		 1019 aa  657    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  42.09 
 
 		 1058 aa  806    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  41.49 
 
 		 1077 aa  827    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  38.59 
 
 		 1022 aa  664    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  37.12 
 
 		 1032 aa  642    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2607  CzcA family heavy metal efflux protein  38.17 
 
 		 1061 aa  696    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0578707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  41.51 
 
 		 1077 aa  838    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  39.94 
 
 		 1083 aa  773    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31010  putative cation efflux system protein  42.42 
 
 		 1045 aa  824    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160016  unclonable  6.07631e-21 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  42.94 
 
 		 1043 aa  848    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  42.1 
 
 		 1038 aa  807    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  38.01 
 
 		 1031 aa  726    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  41.51 
 
 		 1077 aa  838    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  41.84 
 
 		 1040 aa  831    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  42.4 
 
 		 1046 aa  827    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  35.27 
 
 		 1062 aa  679    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  42.18 
 
 		 1083 aa  849    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0576  heavy metal efflux pump CzcA  34.58 
 
 		 1077 aa  658    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  43.45 
 
 		 1070 aa  820    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  42.84 
 
 		 1070 aa  815    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  43.68 
 
 		 1056 aa  816    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  38.83 
 
 		 1032 aa  742    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  41.42 
 
 		 1077 aa  837    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  42.63 
 
 		 1069 aa  831    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  42.23 
 
 		 1072 aa  810    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  38.79 
 
 		 1079 aa  761    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  42.57 
 
 		 1070 aa  854    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  43.61 
 
 		 1063 aa  857    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6145  proton antiporter cation efflux protein NccA  38.82 
 
 		 1076 aa  738    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6210  heavy metal efflux pump CzcA  39.24 
 
 		 1076 aa  766    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339725  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  37.54 
 
 		 1023 aa  664    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  44.23 
 
 		 1043 aa  877    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2579  heavy metal efflux pump CzcA  38.85 
 
 		 1081 aa  755    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.820402 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3413  RND divalent metal cation efflux transporter CnrA  39.16 
 
 		 1082 aa  739    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  42.99 
 
 		 1040 aa  818    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3995  CzcA family heavy metal efflux protein  41.71 
 
 		 1047 aa  778    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2449  heavy metal efflux pump CzcA  38.82 
 
 		 1075 aa  714    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>