More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3857 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_0225  CzcA family heavy metal efflux protein  41.46 
 
 
1040 aa  686    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0387  CzcA family heavy metal efflux protein  41.25 
 
 
1051 aa  697    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  40.94 
 
 
1053 aa  724    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  41.66 
 
 
1061 aa  695    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2607  CzcA family heavy metal efflux protein  42.48 
 
 
1061 aa  655    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0578707  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  40.94 
 
 
1053 aa  724    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  42.49 
 
 
1048 aa  712    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31010  putative cation efflux system protein  41.86 
 
 
1045 aa  670    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160016  unclonable  6.07631e-21 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  41.9 
 
 
1070 aa  714    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02029  putative RND efflux system protein  39.12 
 
 
1044 aa  652    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.517154  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2969  CzcA family heavy metal efflux protein  42.38 
 
 
1054 aa  712    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3933  CzcA family heavy metal efflux protein  38.36 
 
 
1459 aa  707    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  38.23 
 
 
1455 aa  722    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4443  CzcA family heavy metal efflux protein  40.27 
 
 
1060 aa  679    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4083  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.26 
 
 
1082 aa  671    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4462  CzcA family heavy metal efflux protein  37.91 
 
 
1446 aa  672    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1072  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.09 
 
 
1082 aa  655    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.510993  normal  0.615287 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  42.71 
 
 
1064 aa  728    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2382  CzcA family heavy metal efflux protein  46.92 
 
 
1040 aa  736    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.34537  normal  0.0621249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  40.08 
 
 
1038 aa  669    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  42.52 
 
 
1077 aa  717    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7181  heavy metal efflux pump CzcA  41.89 
 
 
1062 aa  655    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  41.29 
 
 
1053 aa  705    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  42.23 
 
 
1077 aa  710    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  40.53 
 
 
1049 aa  731    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  40.21 
 
 
1052 aa  707    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  40.51 
 
 
1054 aa  696    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  41.89 
 
 
1070 aa  712    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00305  Heavy metal efflux pump CzcA  40.06 
 
 
1048 aa  647    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.86 
 
 
1063 aa  722    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1402  CzcA family heavy metal efflux protein  41.25 
 
 
1079 aa  652    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0340496 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  41.98 
 
 
1070 aa  715    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  40.85 
 
 
1053 aa  720    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0667  CzcA family heavy metal efflux protein  39.9 
 
 
1042 aa  695    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  41.07 
 
 
1062 aa  716    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3868  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA (cation efflux system protein CzcA)  39.9 
 
 
1044 aa  698    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  41.37 
 
 
1040 aa  706    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  41.52 
 
 
1075 aa  710    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2297  CzcA family heavy metal efflux protein  41.66 
 
 
1080 aa  682    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.446981  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  40.98 
 
 
1062 aa  683    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  41.52 
 
 
1059 aa  720    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  41.36 
 
 
1066 aa  661    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  41.3 
 
 
1048 aa  675    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  42.52 
 
 
1077 aa  716    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7263  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  40.34 
 
 
1060 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.24626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  39.79 
 
 
1047 aa  680    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  40.93 
 
 
1062 aa  674    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  41.08 
 
 
1050 aa  712    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  41.7 
 
 
1070 aa  709    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  41.15 
 
 
1054 aa  696    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  42.33 
 
 
1077 aa  713    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2138  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.55 
 
 
1081 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0537771  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2300  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.47 
 
 
1070 aa  687    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  40.94 
 
 
1053 aa  724    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  38.31 
 
 
1037 aa  654    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1238  CzcA family heavy metal efflux protein  42.13 
 
 
1057 aa  637    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3958  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.95 
 
 
1069 aa  638    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160749  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  42.4 
 
 
1048 aa  711    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  41.39 
 
 
1058 aa  667    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  42.54 
 
 
1077 aa  719    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2346  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.68 
 
 
1071 aa  671    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.752496  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3857  heavy metal efflux pump CzcA  100 
 
 
1045 aa  2025    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3413  RND divalent metal cation efflux transporter CnrA  37.99 
 
 
1082 aa  636    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.382082  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3369  CzcA family heavy metal efflux protein  41.82 
 
 
1060 aa  686    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957207  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  42.28 
 
 
1048 aa  708    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  40.09 
 
 
1083 aa  658    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5715  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.55 
 
 
1045 aa  664    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.308306  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  41.11 
 
 
1043 aa  696    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  40.61 
 
 
1038 aa  714    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0614  CzcA family heavy metal efflux protein  41.47 
 
 
1069 aa  669    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.97346 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1080  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.2 
 
 
1051 aa  723    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114839  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3995  CzcA family heavy metal efflux protein  40.23 
 
 
1047 aa  662    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  40.51 
 
 
1040 aa  708    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  41.39 
 
 
1046 aa  684    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  41.03 
 
 
1083 aa  702    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  42.33 
 
 
1077 aa  713    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  41.47 
 
 
1070 aa  686    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4384  CzcA family heavy metal efflux protein  40.61 
 
 
1047 aa  678    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.55849  normal  0.35087 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  40.9 
 
 
1070 aa  667    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  41.59 
 
 
1056 aa  682    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00374  putative RND efflux system protein  41.2 
 
 
1035 aa  703    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3920  heavy metal efflux pump, CzcA family  97.33 
 
 
1047 aa  1911    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3984  CzcA family heavy metal efflux protein  42.11 
 
 
1069 aa  679    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.544325  normal  0.398907 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  40.77 
 
 
1069 aa  691    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  41.13 
 
 
1072 aa  682    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  38.05 
 
 
1079 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  42.33 
 
 
1077 aa  713    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  40.77 
 
 
1063 aa  723    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2805  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.54 
 
 
1070 aa  642    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.769559  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6210  heavy metal efflux pump CzcA  38.92 
 
 
1076 aa  641    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339725  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  41.49 
 
 
1051 aa  709    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  41.24 
 
 
1043 aa  712    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  42.59 
 
 
1061 aa  673    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  42.52 
 
 
1077 aa  717    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2449  heavy metal efflux pump CzcA  43.08 
 
 
1075 aa  709    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_008048  Sala_2569  heavy metal efflux pump CzcA  41.26 
 
 
1078 aa  678    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.819785  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3998  heavy metal efflux pump, CzcA family  98.85 
 
 
1047 aa  1909    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  41.98 
 
 
1070 aa  715    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  38.65 
 
 
1037 aa  660    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  37.13 
 
 
1456 aa  675    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
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