More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0387 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_4066  CzcA family heavy metal efflux protein  35.55 
 
 		 1017 aa  647    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  38.25 
 
 		 1066 aa  677    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  41.98 
 
 		 1034 aa  774    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3951  CzcA family heavy metal efflux protein  35.45 
 
 		 1017 aa  648    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  42.18 
 
 		 1034 aa  759    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  58.51 
 
 		 1053 aa  1229    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  57.63 
 
 		 1048 aa  1174    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2319  CzcA family heavy metal efflux protein  39.84 
 
 		 1035 aa  694    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  38.49 
 
 		 1021 aa  646    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  42.35 
 
 		 1032 aa  754    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  40.77 
 
 		 1033 aa  763    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  36.76 
 
 		 1033 aa  639    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  35.61 
 
 		 1066 aa  650    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  35.85 
 
 		 1032 aa  645    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2720  CzcA family heavy metal efflux protein  39.73 
 
 		 1016 aa  697    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.541366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  41.43 
 
 		 1049 aa  698    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  56.94 
 
 		 1064 aa  1186    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  37.69 
 
 		 1070 aa  673    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  78.42 
 
 		 1038 aa  1623    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  38.19 
 
 		 1066 aa  696    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  37.47 
 
 		 1075 aa  665    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  58.31 
 
 		 1053 aa  1204    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  57.89 
 
 		 1077 aa  1223    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  58.55 
 
 		 1049 aa  1243    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  58.25 
 
 		 1052 aa  1211    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  57.88 
 
 		 1054 aa  1200    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  41.8 
 
 		 1036 aa  728    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4154  CzcA family heavy metal efflux protein  60.33 
 
 		 1046 aa  1221    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36883 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  38.78 
 
 		 1029 aa  686    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  39.53 
 
 		 1032 aa  711    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11693  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  40.24 
 
 		 1481 aa  746    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  35.03 
 
 		 1044 aa  639    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  39.41 
 
 		 1032 aa  707    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2801  heavy metal efflux pump CzcA  38.09 
 
 		 1028 aa  649    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  38.04 
 
 		 1039 aa  659    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  41.71 
 
 		 1038 aa  725    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  57.56 
 
 		 1075 aa  1216    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5655  heavy metal efflux pump CzcA  37.37 
 
 		 1037 aa  646    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657207  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3887  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  35.51 
 
 		 1017 aa  648    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  59.73 
 
 		 1059 aa  1263    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1457  heavy metal efflux pump CzcA  57.21 
 
 		 1066 aa  1185    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.40317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  37.69 
 
 		 1070 aa  678    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  57.99 
 
 		 1077 aa  1228    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  42.06 
 
 		 1045 aa  730    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  55.92 
 
 		 1047 aa  1158    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  55.63 
 
 		 1062 aa  1181    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  34.46 
 
 		 1056 aa  639    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  57.8 
 
 		 1050 aa  1219    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  57.57 
 
 		 1070 aa  1219    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3457  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  59.98 
 
 		 1038 aa  1219    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.230333  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  42.12 
 
 		 1034 aa  770    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  39.96 
 
 		 1028 aa  739    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  39.1 
 
 		 1065 aa  734    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  37.62 
 
 		 1064 aa  708    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  56.76 
 
 		 1037 aa  1186    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2011  heavy metal efflux pump CzcA  34.8 
 
 		 1021 aa  647    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  40.86 
 
 		 1040 aa  766    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  38 
 
 		 1028 aa  679    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  38.12 
 
 		 1019 aa  668    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  57.43 
 
 		 1058 aa  1163    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  57.99 
 
 		 1077 aa  1217    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  40.24 
 
 		 1022 aa  714    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3857  heavy metal efflux pump CzcA  41.25 
 
 		 1045 aa  677    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  39.27 
 
 		 1046 aa  720    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4294  heavy metal efflux pump CzcA  38.88 
 
 		 1026 aa  648    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200453  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  49.1 
 
 		 1083 aa  1003    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  34.06 
 
 		 1043 aa  642    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  35.05 
 
 		 1039 aa  636    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  71.3 
 
 		 1043 aa  1486    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  66.96 
 
 		 1038 aa  1404    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  43.2 
 
 		 1456 aa  822    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31010  putative cation efflux system protein  58.83 
 
 		 1045 aa  1220    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160016  unclonable  6.07631e-21 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  42.17 
 
 		 1031 aa  775    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4384  CzcA family heavy metal efflux protein  56.8 
 
 		 1047 aa  1180    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.55849  normal  0.35087 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  59.92 
 
 		 1040 aa  1247    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  57.73 
 
 		 1046 aa  1167    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  55.72 
 
 		 1083 aa  1205    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0576  heavy metal efflux pump CzcA  37.6 
 
 		 1077 aa  667    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  56.92 
 
 		 1070 aa  1178    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  37.13 
 
 		 1062 aa  659    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  57.89 
 
 		 1070 aa  1216    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  56.92 
 
 		 1056 aa  1182    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4188  heavy metal efflux pump CzcA  38.43 
 
 		 1026 aa  665    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809737 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  57.57 
 
 		 1070 aa  1221    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  34.97 
 
 		 1065 aa  640    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  57.82 
 
 		 1069 aa  1225    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  58.55 
 
 		 1072 aa  1210    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  37.69 
 
 		 1070 aa  671    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  50.38 
 
 		 1079 aa  1045    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  57.62 
 
 		 1063 aa  1216    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3858  CzcA family heavy metal efflux protein  35.45 
 
 		 1017 aa  648    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6145  proton antiporter cation efflux protein NccA  47.41 
 
 		 1076 aa  950    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6210  heavy metal efflux pump CzcA  47.08 
 
 		 1076 aa  979    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.339725  normal  0.173806 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  41.8 
 
 		 1023 aa  749    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  58.81 
 
 		 1043 aa  1236    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  44.17 
 
 		 1455 aa  855    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2449  heavy metal efflux pump CzcA  49.62 
 
 		 1075 aa  976    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  67.98 
 
 		 1037 aa  1404    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2569  heavy metal efflux pump CzcA  49.76 
 
 		 1078 aa  996    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.819785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2579  heavy metal efflux pump CzcA  47.17 
 
 		 1081 aa  951    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.820402 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>