More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0687 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  37.2 
 
 		 1025 aa  655    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  38.02 
 
 		 1021 aa  671    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6552  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.82 
 
 		 1060 aa  662    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.418504 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  37.95 
 
 		 1032 aa  702    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  50.78 
 
 		 1038 aa  1017    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.77 
 
 		 1038 aa  655    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  37.04 
 
 		 1033 aa  642    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  36.16 
 
 		 1029 aa  641    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  36.88 
 
 		 1070 aa  646    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4058  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.67 
 
 		 1037 aa  652    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  35.53 
 
 		 1039 aa  662    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  36.88 
 
 		 1070 aa  647    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1550  CzcA family heavy metal efflux protein  49.46 
 
 		 1057 aa  936    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0687  heavy metal efflux pump, CzcA family  100 
 
 		 1033 aa  2088    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0323863 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  37.13 
 
 		 1077 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  36.15 
 
 		 1070 aa  644    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  37.13 
 
 		 1077 aa  636    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3726  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.64 
 
 		 1040 aa  670    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0290592  normal  0.111264 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  36.78 
 
 		 1070 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  37.57 
 
 		 1019 aa  717    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  33.37 
 
 		 1034 aa  648    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  37.36 
 
 		 1077 aa  638    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  35 
 
 		 1031 aa  655    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.68 
 
 		 1025 aa  675    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  35.76 
 
 		 1028 aa  639    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  38.14 
 
 		 1029 aa  655    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7204  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.88 
 
 		 1051 aa  681    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.57085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3517  heavy metal efflux pump, CzcA family  49.81 
 
 		 1042 aa  1005    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416534  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0917  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.69 
 
 		 1043 aa  666    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.164104 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.4 
 
 		 1040 aa  641    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.74 
 
 		 1031 aa  655    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.02 
 
 		 1039 aa  677    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2549  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.6 
 
 		 1046 aa  642    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595471  normal  0.0930113 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  49.37 
 
 		 1030 aa  992    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  50.98 
 
 		 1039 aa  1016    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  36.58 
 
 		 1027 aa  667    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  37.13 
 
 		 1077 aa  636    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4393  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.74 
 
 		 1031 aa  655    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.421403  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  36.88 
 
 		 1070 aa  646    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  36.17 
 
 		 1036 aa  677    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2928  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.96 
 
 		 1032 aa  643    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  35.42 
 
 		 1032 aa  638    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  37.03 
 
 		 1077 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.28 
 
 		 1047 aa  634  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  37.03 
 
 		 1077 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  35.74 
 
 		 1059 aa  633  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  37.03 
 
 		 1077 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  36.17 
 
 		 1034 aa  635  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.42 
 
 		 1459 aa  634  1e-180  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  36.94 
 
 		 1077 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.69 
 
 		 1052 aa  629  1e-179  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.11 
 
 		 1480 aa  632  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  35.06 
 
 		 1033 aa  627  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  35.89 
 
 		 1040 aa  627  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  36.32 
 
 		 1046 aa  627  1e-178  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  36.17 
 
 		 1083 aa  629  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  35.95 
 
 		 1054 aa  626  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  34.85 
 
 		 1033 aa  625  1e-177  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  33.01 
 
 		 1032 aa  622  1e-177  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2683  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.66 
 
 		 1458 aa  625  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.858123  normal  0.311516 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  35.38 
 
 		 1049 aa  624  1e-177  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  35.24 
 
 		 1031 aa  624  1e-177  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6771  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.73 
 
 		 1469 aa  625  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  36.41 
 
 		 1043 aa  625  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.38 
 
 		 1462 aa  624  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  33.94 
 
 		 1034 aa  620  1e-176  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.73 
 
 		 1063 aa  621  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  35.38 
 
 		 1062 aa  621  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  33.65 
 
 		 1032 aa  616  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  35.63 
 
 		 1063 aa  615  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.33 
 
 		 1034 aa  616  1e-175  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  33.5 
 
 		 1455 aa  615  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1588  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.33 
 
 		 1439 aa  613  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.418417 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  35.56 
 
 		 1075 aa  614  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0667  CzcA family heavy metal efflux protein  34.39 
 
 		 1042 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  35.3 
 
 		 1053 aa  612  1e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  35.47 
 
 		 1064 aa  609  1e-173  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  35.3 
 
 		 1053 aa  612  1e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  35.3 
 
 		 1053 aa  612  1e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  35.59 
 
 		 1053 aa  606  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  35.69 
 
 		 1054 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.63 
 
 		 1049 aa  608  9.999999999999999e-173  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
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NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  35.65 
 
 		 1051 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
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NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  35.47 
 
 		 1029 aa  608  9.999999999999999e-173  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
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NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  33.53 
 
 		 1043 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
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NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  34.39 
 
 		 1079 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
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NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  35.2 
 
 		 1053 aa  609  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  35.04 
 
 		 1045 aa  607  9.999999999999999e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
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NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  35.83 
 
 		 1062 aa  606  9.999999999999999e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
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NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  33.93 
 
 		 1066 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_006369  lpl1046  HelA protein  34.92 
 
 		 1052 aa  602  1.0000000000000001e-171  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_012791  Vapar_3555  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.56 
 
 		 1062 aa  603  1.0000000000000001e-171  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_3868  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA (cation efflux system protein CzcA)  34.1 
 
 		 1044 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007794  Saro_2146  heavy metal efflux pump CzcA  33.68 
 
 		 1083 aa  603  1.0000000000000001e-171  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.580962  n/a   
 
 
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NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  36.34 
 
 		 1069 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  35.91 
 
 		 1036 aa  600  1e-170  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
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NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  34.48 
 
 		 1034 aa  597  1e-169  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013162  Coch_0147  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.48 
 
 		 1443 aa  597  1e-169  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  34.58 
 
 		 1034 aa  598  1e-169  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  34.41 
 
 		 1040 aa  597  1e-169  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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