More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6552 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  35.4 
 
 		 1034 aa  643    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4058  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.22 
 
 		 1037 aa  704    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  35.07 
 
 		 1070 aa  645    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00706  cation efflux system protein  40.06 
 
 		 1030 aa  738    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0736219  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  41.63 
 
 		 1021 aa  739    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  43.35 
 
 		 1032 aa  850    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  40.26 
 
 		 1038 aa  764    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.77 
 
 		 1040 aa  697    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.46 
 
 		 1031 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  35.53 
 
 		 1049 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  35.73 
 
 		 1052 aa  651    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  36.01 
 
 		 1034 aa  695    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  38.5 
 
 		 1033 aa  689    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  40.44 
 
 		 1029 aa  743    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  35.07 
 
 		 1070 aa  645    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1550  CzcA family heavy metal efflux protein  39.44 
 
 		 1057 aa  695    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.893235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  39.48 
 
 		 1039 aa  726    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  68.18 
 
 		 1036 aa  1458    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1080  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.5 
 
 		 1051 aa  642    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.31 
 
 		 1031 aa  731    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  34.98 
 
 		 1051 aa  640    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2728  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.76 
 
 		 1450 aa  646    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  35.16 
 
 		 1070 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2549  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.84 
 
 		 1046 aa  701    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595471  normal  0.0930113 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  35.75 
 
 		 1034 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.74 
 
 		 1039 aa  738    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.23 
 
 		 1038 aa  744    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  35.07 
 
 		 1070 aa  645    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  40.46 
 
 		 1019 aa  734    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  39.81 
 
 		 1032 aa  741    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6552  heavy metal efflux pump, CzcA family  100 
 
 		 1060 aa  2121    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.418504 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  34.33 
 
 		 1077 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.82 
 
 		 1459 aa  653    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  35.11 
 
 		 1043 aa  638    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0687  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.82 
 
 		 1033 aa  646    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0323863 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  34.33 
 
 		 1077 aa  637    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  36.04 
 
 		 1031 aa  638    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  38.25 
 
 		 1029 aa  668    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  36.27 
 
 		 1034 aa  637    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1588  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.73 
 
 		 1439 aa  659    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.418417 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2928  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.73 
 
 		 1032 aa  764    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  35.59 
 
 		 1032 aa  644    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.55 
 
 		 1063 aa  637    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3517  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.32 
 
 		 1042 aa  759    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416534  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  36.83 
 
 		 1050 aa  643    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  38.08 
 
 		 1028 aa  684    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4393  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.46 
 
 		 1031 aa  675    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.421403  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  34.73 
 
 		 1043 aa  654    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  36.34 
 
 		 1045 aa  640    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  41.35 
 
 		 1039 aa  759    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  39.18 
 
 		 1027 aa  698    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0917  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.04 
 
 		 1043 aa  725    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.164104 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  38.24 
 
 		 1025 aa  661    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  35.07 
 
 		 1070 aa  645    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3726  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.23 
 
 		 1040 aa  703    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0290592  normal  0.111264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7204  heavy metal efflux pump, CzcA family  68.93 
 
 		 1051 aa  1492    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.57085  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.71 
 
 		 1025 aa  736    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  38.68 
 
 		 1032 aa  694    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  35.96 
 
 		 1455 aa  662    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.01 
 
 		 1462 aa  633  1e-180  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0147  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.46 
 
 		 1443 aa  635  1e-180  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  36.36 
 
 		 1053 aa  635  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  34.24 
 
 		 1077 aa  634  1e-180  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.4 
 
 		 1034 aa  634  1e-180  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  34.14 
 
 		 1077 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.36 
 
 		 1052 aa  634  1e-180  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  34.23 
 
 		 1062 aa  633  1e-180  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  34.14 
 
 		 1077 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  35.93 
 
 		 1456 aa  635  1e-180  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  34.14 
 
 		 1077 aa  632  1e-180  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  34.05 
 
 		 1077 aa  631  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  36.1 
 
 		 1054 aa  631  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  37.63 
 
 		 1050 aa  632  1e-179  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  35.63 
 
 		 1050 aa  632  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.4 
 
 		 1034 aa  629  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.17 
 
 		 1454 aa  629  1e-179  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.668316 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  34.95 
 
 		 1077 aa  632  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  34.42 
 
 		 1046 aa  629  1e-179  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.18 
 
 		 1049 aa  630  1e-179  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  34.37 
 
 		 1063 aa  630  1e-179  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  36.16 
 
 		 1033 aa  628  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  34.87 
 
 		 1054 aa  629  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  34.08 
 
 		 1075 aa  626  1e-178  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  33.95 
 
 		 1059 aa  626  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  34.58 
 
 		 1064 aa  627  1e-178  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4315  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.18 
 
 		 1046 aa  629  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.41 
 
 		 1480 aa  627  1e-178  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  34.17 
 
 		 1083 aa  627  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  34.9 
 
 		 1069 aa  627  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  35.44 
 
 		 1045 aa  624  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.55 
 
 		 1047 aa  625  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  34.6 
 
 		 1064 aa  623  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  34.91 
 
 		 1061 aa  624  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.24 
 
 		 1056 aa  625  1e-177  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  36.07 
 
 		 1061 aa  622  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  36.5 
 
 		 1032 aa  622  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4462  CzcA family heavy metal efflux protein  34.3 
 
 		 1446 aa  622  1e-176  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  34.54 
 
 		 1062 aa  620  1e-176  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  35.53 
 
 		 1029 aa  622  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1404  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.98 
 
 		 1056 aa  620  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100387  normal  0.0917264 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>