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for query gene Rpal_2011 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.14 
 
 		 1052 aa  642    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  42.66 
 
 		 1021 aa  757    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1767  CzcA family heavy metal efflux protein  38.01 
 
 		 1033 aa  637    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.71 
 
 		 1459 aa  658    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3452  putative cation/heavy metal efflux system protein  83.4 
 
 		 514 aa  856    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.137894 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2989  putative cation/heavy metal efflux system protein  86.61 
 
 		 1040 aa  1793    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3726  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.5 
 
 		 1040 aa  791    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0290592  normal  0.111264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2169  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.08 
 
 		 1025 aa  693    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.245456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1300  CzcA family heavy metal efflux protein  38.41 
 
 		 1025 aa  687    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.187575  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2928  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.15 
 
 		 1032 aa  796    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.190271  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0917  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.56 
 
 		 1043 aa  800    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.164104 
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4985  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.16 
 
 		 1055 aa  1040    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00799341 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2944  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.3 
 
 		 1054 aa  1036    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  39.67 
 
 		 1033 aa  706    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  39.46 
 
 		 1029 aa  684    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0792  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.28 
 
 		 1027 aa  756    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00116886  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  39.9 
 
 		 1039 aa  719    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0580  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.46 
 
 		 1038 aa  762    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00250892  hitchhiker  0.00955632 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4058  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.37 
 
 		 1037 aa  779    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3687  CzcA family heavy metal efflux protein  60.71 
 
 		 1049 aa  1271    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.534955  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4482  CzcA family heavy metal efflux protein  36.57 
 
 		 1036 aa  636    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2911  heavy metal efflux pump CzcA  70.88 
 
 		 1050 aa  1479    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.800261 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4283  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.03 
 
 		 1031 aa  712    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.820694  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2529  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.16 
 
 		 1055 aa  1041    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0729585 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.52 
 
 		 1049 aa  697    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2752  CzcA family heavy metal efflux protein  49.85 
 
 		 1063 aa  978    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.262647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1341  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.13 
 
 		 1039 aa  838    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  41.66 
 
 		 1019 aa  745    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4393  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.03 
 
 		 1031 aa  712    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.421403  normal  0.548372 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1546  putative cation efflux system protein  49.48 
 
 		 1079 aa  1034    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.161901  normal  0.236691 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3560  heavy metal efflux pump CzcA  91.33 
 
 		 1040 aa  1898    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.802571  normal  0.499923 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  39.9 
 
 		 1028 aa  695    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1404  heavy metal efflux pump, CzcA family  67.15 
 
 		 1056 aa  1379    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.100387  normal  0.0917264 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3449  putative cation/heavy metal efflux system protein  82.46 
 
 		 547 aa  863    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.622093  normal  0.200783 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1242  CzcA family heavy metal efflux protein  67.15 
 
 		 1056 aa  1379    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.861006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1306  heavy metal efflux pump CzcA  42.73 
 
 		 1029 aa  762    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.147325 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2683  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.08 
 
 		 1458 aa  636    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.858123  normal  0.311516 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2011  heavy metal efflux pump, CzcA family  100 
 
 		 1040 aa  2089    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.742526  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1672  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.3 
 
 		 1054 aa  1036    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  35.57 
 
 		 1455 aa  637    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2549  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.87 
 
 		 1046 aa  770    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0595471  normal  0.0930113 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1183  heavy metal efflux pump, CzcA family  66.67 
 
 		 1056 aa  1376    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.292353  normal  0.30181 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1813  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.69 
 
 		 1040 aa  746    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.683643  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3298  heavy metal efflux pump CzcA  71.79 
 
 		 1050 aa  1517    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.43 
 
 		 1462 aa  676    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4295  CzcA family heavy metal efflux protein  38.96 
 
 		 1034 aa  752    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  36.68 
 
 		 1051 aa  641    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1612  acriflavin resistance protein  40.14 
 
 		 1010 aa  759    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5319  heavy metal cation tricomponent efflux efflux pump ZniA  51.35 
 
 		 1045 aa  1080    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.358374  normal  0.430552 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0449  heavy metal efflux pump CzcA  40.58 
 
 		 1027 aa  762    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.438615 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0831  cation eflux protein  41.43 
 
 		 1032 aa  767    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00269228  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3469  putative cation efflux system protein  48.97 
 
 		 1083 aa  1011    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.806114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2731  CzcA family heavy metal efflux protein  39.83 
 
 		 1032 aa  776    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2747  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.21 
 
 		 1031 aa  773    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02377  putative cation efflux system transmembrane protein  36.7 
 
 		 1038 aa  634  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.127084 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  35.56 
 
 		 1040 aa  635  1e-180  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  36.72 
 
 		 1043 aa  635  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  35.18 
 
 		 1034 aa  629  1e-179  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6757  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.32 
 
 		 1480 aa  631  1e-179  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.603059  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2728  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.98 
 
 		 1450 aa  627  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.632568  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  35.77 
 
 		 1059 aa  626  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  36.98 
 
 		 1077 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  36.36 
 
 		 1050 aa  629  1e-178  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.5 
 
 		 1034 aa  629  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  36.74 
 
 		 1083 aa  628  1e-178  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1588  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.24 
 
 		 1439 aa  628  1e-178  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.418417 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5329  heavy metal cation tricomponent efflux pump ZneA  37.3 
 
 		 1039 aa  629  1e-178  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.259593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  35.02 
 
 		 1032 aa  629  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  36.98 
 
 		 1077 aa  625  1e-177  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  36.58 
 
 		 1064 aa  624  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.87 
 
 		 1034 aa  624  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  36.88 
 
 		 1077 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  35.84 
 
 		 1047 aa  624  1e-177  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  37.48 
 
 		 1061 aa  623  1e-177  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  36.88 
 
 		 1077 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  36.98 
 
 		 1077 aa  625  1e-177  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  36.88 
 
 		 1077 aa  623  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0018  CzcA family heavy metal efflux protein  36.44 
 
 		 1034 aa  623  1e-177  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2324  CzcA family heavy metal efflux protein  36.14 
 
 		 1032 aa  622  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  36.79 
 
 		 1077 aa  621  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5715  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.83 
 
 		 1045 aa  619  1e-176  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.308306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6552  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.18 
 
 		 1060 aa  617  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.383306  normal  0.418504 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  35.95 
 
 		 1062 aa  616  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  36.88 
 
 		 1070 aa  616  1e-175  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  36.88 
 
 		 1077 aa  619  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3555  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.24 
 
 		 1062 aa  616  1e-175  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  36.04 
 
 		 1053 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  36.79 
 
 		 1070 aa  614  9.999999999999999e-175  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1238  CzcA family heavy metal efflux protein  38.94 
 
 		 1057 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  35.77 
 
 		 1049 aa  614  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  36.79 
 
 		 1070 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  36.39 
 
 		 1075 aa  615  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  36.04 
 
 		 1053 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3517  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.85 
 
 		 1042 aa  612  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.416534  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6771  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.2 
 
 		 1469 aa  612  9.999999999999999e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  34.62 
 
 		 1065 aa  614  9.999999999999999e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  36.79 
 
 		 1070 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  36.04 
 
 		 1053 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
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NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  36.55 
 
 		 1054 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
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NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  36.79 
 
 		 1070 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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