More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3650 on replicon NC_008607
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  47.09 
 
 
1047 aa  991    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  47.18 
 
 
1047 aa  993    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  35.95 
 
 
1034 aa  692    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  86.89 
 
 
1045 aa  1853    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  37 
 
 
1034 aa  694    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  34.38 
 
 
1053 aa  655    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  35.32 
 
 
1048 aa  648    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  47.6 
 
 
1052 aa  993    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  37.34 
 
 
1021 aa  652    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  39.06 
 
 
1032 aa  686    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  36.21 
 
 
1033 aa  675    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  52.68 
 
 
1066 aa  1112    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  55.52 
 
 
1049 aa  1185    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  36.92 
 
 
1049 aa  638    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  47.98 
 
 
1047 aa  1010    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  34.99 
 
 
1064 aa  654    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  48.47 
 
 
1045 aa  1010    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  48.25 
 
 
1052 aa  1009    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  48.71 
 
 
1045 aa  1019    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  48.23 
 
 
1045 aa  999    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  35.61 
 
 
1053 aa  672    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  48.47 
 
 
1070 aa  1007    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  35.77 
 
 
1077 aa  672    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  48.8 
 
 
1047 aa  1029    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  36.43 
 
 
1049 aa  693    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  36.47 
 
 
1052 aa  686    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  35.73 
 
 
1054 aa  677    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  37.6 
 
 
1036 aa  659    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  36.71 
 
 
1029 aa  647    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  37.43 
 
 
1032 aa  666    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  54.02 
 
 
1051 aa  1150    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  52.81 
 
 
1044 aa  1114    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  37.09 
 
 
1032 aa  664    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  48.71 
 
 
1045 aa  1012    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  37.2 
 
 
1038 aa  666    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  35.01 
 
 
1075 aa  655    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  35.55 
 
 
1059 aa  661    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  46.07 
 
 
1060 aa  955    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  47.44 
 
 
1056 aa  1001    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  50.91 
 
 
1058 aa  1053    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  48.51 
 
 
1070 aa  1001    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  36.03 
 
 
1077 aa  680    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  37.12 
 
 
1045 aa  670    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  35.88 
 
 
1047 aa  643    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  36.05 
 
 
1062 aa  677    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  48.73 
 
 
1067 aa  1024    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  49.43 
 
 
1074 aa  1016    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  47.26 
 
 
1056 aa  998    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  36.27 
 
 
1050 aa  691    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  51.13 
 
 
1074 aa  1122    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  36.05 
 
 
1070 aa  681    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  90.33 
 
 
1045 aa  1935    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  36.58 
 
 
1034 aa  691    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  33.95 
 
 
1065 aa  649    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  47.66 
 
 
1054 aa  957    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  34.05 
 
 
1064 aa  642    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  42.96 
 
 
1015 aa  842    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.64 
 
 
1049 aa  652    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  37.39 
 
 
1040 aa  690    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  49.81 
 
 
1059 aa  1078    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  37.52 
 
 
1019 aa  712    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  47.95 
 
 
1047 aa  1013    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  36.12 
 
 
1077 aa  680    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  40.15 
 
 
1022 aa  716    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  45.63 
 
 
1094 aa  949    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  50.67 
 
 
1051 aa  1036    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  35.15 
 
 
1456 aa  656    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  53.17 
 
 
1043 aa  1145    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  48.02 
 
 
1039 aa  1022    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  35.38 
 
 
1043 aa  652    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  46.67 
 
 
1039 aa  976    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  46.46 
 
 
1042 aa  954    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  51.92 
 
 
1052 aa  1068    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  36.47 
 
 
1031 aa  675    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  36.28 
 
 
1040 aa  683    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  35.15 
 
 
1046 aa  655    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  48.56 
 
 
1056 aa  1000    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  35.93 
 
 
1083 aa  677    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  49.33 
 
 
1042 aa  1013    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  34.96 
 
 
1070 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  51.68 
 
 
1043 aa  1048    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  52.56 
 
 
1058 aa  1073    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  34.55 
 
 
1056 aa  639    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2319  CzcA family heavy metal efflux protein  36.09 
 
 
1035 aa  647    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  52.55 
 
 
1060 aa  1075    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  52.17 
 
 
1065 aa  1077    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  34.58 
 
 
1069 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  34.96 
 
 
1072 aa  647    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  52.06 
 
 
1060 aa  1061    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  37.05 
 
 
1455 aa  704    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  36.02 
 
 
1063 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  48.06 
 
 
1056 aa  1018    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  38.35 
 
 
1023 aa  683    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  36.26 
 
 
1043 aa  681    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  48.27 
 
 
1055 aa  1031    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  46.58 
 
 
1044 aa  962    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  47.59 
 
 
1044 aa  974    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  47.22 
 
 
1047 aa  996    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  36.52 
 
 
1070 aa  682    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  49.57 
 
 
1068 aa  1024    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>