More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_2550 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



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Replicon accession
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Product
% identity
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Alignment on homolog gene
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Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  67.05 
 
 		 1047 aa  1439    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  67.14 
 
 		 1047 aa  1441    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  54.57 
 
 		 1059 aa  1152    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  48.9 
 
 		 1045 aa  989    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  55.12 
 
 		 1043 aa  1148    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2212  CzcA family heavy metal efflux protein  73.02 
 
 		 1049 aa  1554    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589008  normal  0.652924 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  36.22 
 
 		 1077 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  73.03 
 
 		 1052 aa  1527    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  47.17 
 
 		 1046 aa  947    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  58.71 
 
 		 1042 aa  1271    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  56.91 
 
 		 1066 aa  1161    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  71.35 
 
 		 1047 aa  1517    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0282  CzcA family heavy metal efflux protein  57.25 
 
 		 1049 aa  1245    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  57.64 
 
 		 1045 aa  1242    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3385  CzcA family heavy metal efflux protein  54.6 
 
 		 1061 aa  1096    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  59.77 
 
 		 1052 aa  1241    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  57.54 
 
 		 1045 aa  1245    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  57.81 
 
 		 1045 aa  1243    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  57.69 
 
 		 1045 aa  1229    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3643  cation efflux system protein  53.98 
 
 		 1063 aa  1107    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  68.81 
 
 		 1070 aa  1454    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  36.12 
 
 		 1077 aa  640    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  48.08 
 
 		 1047 aa  1010    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0089  CzcA family heavy metal efflux protein  48.23 
 
 		 1048 aa  1006    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0332  CzcA family heavy metal RND efflux protein  68.71 
 
 		 1070 aa  1452    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.744474  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  36.33 
 
 		 1054 aa  638    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  37.05 
 
 		 1054 aa  645    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  66.63 
 
 		 1048 aa  1451    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  68.21 
 
 		 1068 aa  1444    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  54.84 
 
 		 1051 aa  1138    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  56.27 
 
 		 1044 aa  1165    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  68.95 
 
 		 1068 aa  1460    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0149  CzcA family heavy metal efflux protein  57.35 
 
 		 1049 aa  1248    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  35.69 
 
 		 1075 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  59.94 
 
 		 1048 aa  1268    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  35.14 
 
 		 1059 aa  635    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  75.43 
 
 		 1060 aa  1598    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3534  CzcA family heavy metal efflux protein  57.55 
 
 		 1047 aa  1251    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  54.32 
 
 		 1058 aa  1086    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  68.95 
 
 		 1070 aa  1447    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  36.31 
 
 		 1077 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  55.14 
 
 		 1047 aa  1217    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  36.22 
 
 		 1077 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  68.81 
 
 		 1070 aa  1454    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594297  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  54.2 
 
 		 1067 aa  1145    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  49 
 
 		 1074 aa  1013    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  73.52 
 
 		 1056 aa  1580    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  35.86 
 
 		 1050 aa  637    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  54.37 
 
 		 1074 aa  1169    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  35.78 
 
 		 1070 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  47.79 
 
 		 1045 aa  1003    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  57.83 
 
 		 1045 aa  1239    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  60.7 
 
 		 1056 aa  1276    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1627  putative cation efflux system transmembrane protein  72.3 
 
 		 1063 aa  1532    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  55.84 
 
 		 1054 aa  1159    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4513  CzcA family heavy metal efflux protein  71.55 
 
 		 1055 aa  1523    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  41.8 
 
 		 1015 aa  827    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  47.22 
 
 		 1045 aa  976    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  51.44 
 
 		 1059 aa  1082    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2437  CzcA family heavy metal efflux protein  46.59 
 
 		 1091 aa  950    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  36.31 
 
 		 1077 aa  645    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  36.41 
 
 		 1077 aa  646    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  47.53 
 
 		 1094 aa  978    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  54.61 
 
 		 1051 aa  1092    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3426  cation efflux system protein cusA  54.64 
 
 		 1057 aa  1115    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  55.13 
 
 		 1043 aa  1156    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  59.79 
 
 		 1039 aa  1280    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  68.81 
 
 		 1070 aa  1454    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  57.38 
 
 		 1039 aa  1198    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  58.82 
 
 		 1042 aa  1223    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  55.35 
 
 		 1052 aa  1120    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1232  CzcA family heavy metal efflux protein  75.14 
 
 		 1039 aa  1589    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.99301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  36.8 
 
 		 1040 aa  646    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2238  CzcA family heavy metal RND efflux protein  68.81 
 
 		 1070 aa  1454    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  71.74 
 
 		 1056 aa  1530    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0061  RND family outer membrane copper/silver/drug transport protein  54.27 
 
 		 1069 aa  1122    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  55.99 
 
 		 1042 aa  1230    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0162  CzcA family heavy metal efflux protein  58.22 
 
 		 1049 aa  1266    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  55.45 
 
 		 1043 aa  1113    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  60.71 
 
 		 1040 aa  1276    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  37.36 
 
 		 1028 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  54.41 
 
 		 1060 aa  1098    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  54.23 
 
 		 1065 aa  1125    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  36.31 
 
 		 1077 aa  645    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0319  CzcA family heavy metal RND efflux protein  68.71 
 
 		 1070 aa  1452    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  55.8 
 
 		 1060 aa  1100    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2246  CzcA family heavy metal efflux protein  46.52 
 
 		 1100 aa  923    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0262  CzcA family heavy metal efflux protein  66.63 
 
 		 1048 aa  1454    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  71.06 
 
 		 1056 aa  1503    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1157  CzcA family heavy metal efflux protein  65.13 
 
 		 1038 aa  1401    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0022  CzcA family heavy metal efflux protein  72.68 
 
 		 1052 aa  1546    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  72.28 
 
 		 1055 aa  1548    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  73.33 
 
 		 1044 aa  1550    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  75.79 
 
 		 1044 aa  1594    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  100 
 
 		 1047 aa  2088    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  36.22 
 
 		 1077 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  68.95 
 
 		 1068 aa  1460    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  57.29 
 
 		 1045 aa  1194    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  55.27 
 
 		 1058 aa  1129    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  42.12 
 
 		 1049 aa  854    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
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