More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3402 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



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Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

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Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  62.08 
 
 
1047 aa  1371    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  62.08 
 
 
1047 aa  1372    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2238  CzcA family heavy metal RND efflux protein  85.51 
 
 
1070 aa  1818    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  50.19 
 
 
1045 aa  1027    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  36.3 
 
 
1077 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0332  CzcA family heavy metal RND efflux protein  85.51 
 
 
1070 aa  1818    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.744474  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  36.21 
 
 
1077 aa  649    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  68.62 
 
 
1052 aa  1454    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0319  CzcA family heavy metal RND efflux protein  85.61 
 
 
1070 aa  1820    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  36.3 
 
 
1077 aa  652    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  55.21 
 
 
1066 aa  1147    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  61.71 
 
 
1056 aa  1303    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  72.14 
 
 
1047 aa  1538    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  36.21 
 
 
1077 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  58.12 
 
 
1047 aa  1263    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0038  CzcA family heavy metal efflux protein  35.73 
 
 
1028 aa  636    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  58.95 
 
 
1052 aa  1248    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2246  CzcA family heavy metal efflux protein  47.26 
 
 
1100 aa  930    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  58.32 
 
 
1045 aa  1267    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  58.37 
 
 
1045 aa  1245    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3426  cation efflux system protein cusA  54.08 
 
 
1057 aa  1121    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140148  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  85.51 
 
 
1070 aa  1818    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  36.11 
 
 
1077 aa  647    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  47.54 
 
 
1047 aa  1004    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  33.68 
 
 
1049 aa  636    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0282  CzcA family heavy metal efflux protein  58.6 
 
 
1049 aa  1281    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4015  CzcA family heavy metal efflux protein  68.27 
 
 
1050 aa  1468    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.310699  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  54.76 
 
 
1059 aa  1144    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3385  CzcA family heavy metal efflux protein  55 
 
 
1061 aa  1114    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  58.6 
 
 
1045 aa  1276    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  54.89 
 
 
1051 aa  1153    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  55.45 
 
 
1044 aa  1136    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  36.21 
 
 
1077 aa  649    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  58.98 
 
 
1045 aa  1278    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  58.25 
 
 
1042 aa  1281    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0089  CzcA family heavy metal efflux protein  48.28 
 
 
1048 aa  1016    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3643  cation efflux system protein  54.79 
 
 
1063 aa  1117    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  67.62 
 
 
1060 aa  1442    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  94.19 
 
 
1068 aa  1972    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  55.31 
 
 
1058 aa  1101    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  85.61 
 
 
1070 aa  1806    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  36.3 
 
 
1077 aa  652    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  48.61 
 
 
1046 aa  972    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1232  CzcA family heavy metal efflux protein  68.94 
 
 
1039 aa  1478    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.99301  normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  49.38 
 
 
1045 aa  1013    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  53.59 
 
 
1067 aa  1123    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  48.95 
 
 
1074 aa  1019    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  68.32 
 
 
1056 aa  1479    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0061  RND family outer membrane copper/silver/drug transport protein  54.08 
 
 
1069 aa  1125    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  53.88 
 
 
1074 aa  1158    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  36.3 
 
 
1070 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  47.75 
 
 
1045 aa  1000    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2212  CzcA family heavy metal efflux protein  68.74 
 
 
1049 aa  1466    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589008  normal  0.652924 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  60.77 
 
 
1039 aa  1258    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1157  CzcA family heavy metal efflux protein  66.57 
 
 
1038 aa  1426    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  58.56 
 
 
1054 aa  1221    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3534  CzcA family heavy metal efflux protein  58.97 
 
 
1047 aa  1277    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  43.39 
 
 
1015 aa  873    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  85.51 
 
 
1070 aa  1818    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594297  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  51.76 
 
 
1059 aa  1092    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  100 
 
 
1068 aa  2119    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  58.99 
 
 
1045 aa  1276    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  36.36 
 
 
1077 aa  651    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  47.3 
 
 
1094 aa  963    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  55.21 
 
 
1051 aa  1110    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  60.13 
 
 
1048 aa  1280    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  55.21 
 
 
1043 aa  1162    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  59.69 
 
 
1039 aa  1277    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  61.27 
 
 
1040 aa  1283    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  36.49 
 
 
1070 aa  641    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  59.9 
 
 
1042 aa  1237    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  55.42 
 
 
1052 aa  1127    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1627  putative cation efflux system transmembrane protein  70.56 
 
 
1063 aa  1508    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  34.78 
 
 
1040 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0162  CzcA family heavy metal efflux protein  58.43 
 
 
1049 aa  1274    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  71.29 
 
 
1056 aa  1521    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  59.35 
 
 
1042 aa  1269    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  37.56 
 
 
1054 aa  659    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  55.5 
 
 
1043 aa  1116    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  55.31 
 
 
1043 aa  1145    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2437  CzcA family heavy metal efflux protein  46.76 
 
 
1091 aa  961    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463281  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  54.49 
 
 
1060 aa  1127    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  55.94 
 
 
1065 aa  1145    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0149  CzcA family heavy metal efflux protein  58.7 
 
 
1049 aa  1285    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4513  CzcA family heavy metal efflux protein  70.61 
 
 
1055 aa  1516    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  56.05 
 
 
1060 aa  1126    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0262  CzcA family heavy metal efflux protein  61.85 
 
 
1048 aa  1365    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  71.64 
 
 
1056 aa  1528    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  85.51 
 
 
1070 aa  1818    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0022  CzcA family heavy metal efflux protein  67.47 
 
 
1052 aa  1446    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  72.05 
 
 
1055 aa  1549    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  65.84 
 
 
1044 aa  1390    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  66.76 
 
 
1044 aa  1402    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  68.81 
 
 
1047 aa  1476    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  36.49 
 
 
1070 aa  641    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  100 
 
 
1068 aa  2119    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  61.85 
 
 
1048 aa  1364    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  57.51 
 
 
1045 aa  1193    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  55.21 
 
 
1058 aa  1121    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  43.11 
 
 
1049 aa  880    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
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