More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_5033 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  65.16 
 
 		 1047 aa  1414    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  65.26 
 
 		 1047 aa  1415    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4264  CzcA family heavy metal efflux protein  46.4 
 
 		 1092 aa  965    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0061881 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  49.76 
 
 		 1045 aa  1024    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  72.68 
 
 		 1068 aa  1536    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0262  CzcA family heavy metal efflux protein  65.68 
 
 		 1048 aa  1428    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4173  CzcA family heavy metal efflux protein  60.4 
 
 		 1049 aa  1305    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  71.99 
 
 		 1052 aa  1516    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  56.65 
 
 		 1043 aa  1172    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0162  CzcA family heavy metal efflux protein  60.17 
 
 		 1049 aa  1309    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0282  CzcA family heavy metal efflux protein  59.75 
 
 		 1049 aa  1289    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  57.02 
 
 		 1066 aa  1178    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2437  CzcA family heavy metal efflux protein  47.32 
 
 		 1091 aa  962    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  87.37 
 
 		 1047 aa  1841    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0210  CzcA family heavy metal efflux protein  59.04 
 
 		 1045 aa  1282    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2246  CzcA family heavy metal efflux protein  47.26 
 
 		 1100 aa  952    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  72.36 
 
 		 1070 aa  1517    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594297  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  60.7 
 
 		 1052 aa  1285    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0622  cation efflux system protein cusA  65.26 
 
 		 1047 aa  1415    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00104736  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  60.02 
 
 		 1045 aa  1279    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  59.75 
 
 		 1045 aa  1270    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0149  CzcA family heavy metal efflux protein  59.85 
 
 		 1049 aa  1291    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  72.36 
 
 		 1070 aa  1517    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3426  cation efflux system protein cusA  55.94 
 
 		 1057 aa  1162    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140148  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  48.12 
 
 		 1047 aa  1025    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3362  CzcA family heavy metal efflux protein  69.04 
 
 		 1039 aa  1408    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0061  RND family outer membrane copper/silver/drug transport protein  56.05 
 
 		 1069 aa  1162    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0022  CzcA family heavy metal efflux protein  72.06 
 
 		 1052 aa  1534    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2212  CzcA family heavy metal efflux protein  73.2 
 
 		 1049 aa  1550    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589008  normal  0.652924 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  56.1 
 
 		 1047 aa  1232    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  36.29 
 
 		 1054 aa  637    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  56.88 
 
 		 1051 aa  1183    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  57.02 
 
 		 1044 aa  1179    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  48.27 
 
 		 1045 aa  1006    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  72.36 
 
 		 1070 aa  1517    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4304  CzcA family heavy metal efflux protein  59.98 
 
 		 1049 aa  1301    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.099897 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4015  CzcA family heavy metal efflux protein  73.72 
 
 		 1050 aa  1564    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.310699  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  72.08 
 
 		 1060 aa  1543    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  43.61 
 
 		 1049 aa  910    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  56.09 
 
 		 1058 aa  1129    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  72.52 
 
 		 1070 aa  1511    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06366  hypothetical protein  60.26 
 
 		 1059 aa  1293    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  63 
 
 		 1040 aa  1326    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1232  CzcA family heavy metal efflux protein  73.8 
 
 		 1039 aa  1548    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.99301  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  72.05 
 
 		 1068 aa  1524    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  55.86 
 
 		 1067 aa  1176    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  49.62 
 
 		 1074 aa  1029    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  73.08 
 
 		 1056 aa  1565    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2238  CzcA family heavy metal RND efflux protein  72.36 
 
 		 1070 aa  1517    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  54.36 
 
 		 1074 aa  1184    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0593  cation efflux system protein cusA  65.32 
 
 		 1047 aa  1417    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550143  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  48.27 
 
 		 1045 aa  1018    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  60.04 
 
 		 1045 aa  1293    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  59.9 
 
 		 1045 aa  1283    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0319  CzcA family heavy metal RND efflux protein  72.36 
 
 		 1070 aa  1516    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  59.53 
 
 		 1054 aa  1243    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3643  cation efflux system protein  56.13 
 
 		 1063 aa  1153    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4591  CzcA family heavy metal efflux protein  56.92 
 
 		 1055 aa  1149    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  42.63 
 
 		 1015 aa  860    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0089  CzcA family heavy metal efflux protein  48.37 
 
 		 1048 aa  1021    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  52.69 
 
 		 1059 aa  1103    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  63.11 
 
 		 1056 aa  1323    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  56.19 
 
 		 1059 aa  1178    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3989  CzcA family heavy metal efflux protein  56.77 
 
 		 1045 aa  1237    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  47.33 
 
 		 1094 aa  974    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  56.53 
 
 		 1051 aa  1135    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  56.09 
 
 		 1043 aa  1185    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  61.71 
 
 		 1039 aa  1320    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  47.46 
 
 		 1046 aa  967    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4513  CzcA family heavy metal efflux protein  77.29 
 
 		 1055 aa  1644    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  61.27 
 
 		 1042 aa  1271    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  56.81 
 
 		 1052 aa  1166    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3534  CzcA family heavy metal efflux protein  59.04 
 
 		 1047 aa  1273    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1627  putative cation efflux system transmembrane protein  77.78 
 
 		 1063 aa  1658    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  77.49 
 
 		 1056 aa  1634    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0332  CzcA family heavy metal RND efflux protein  72.36 
 
 		 1070 aa  1515    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.744474  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  59.9 
 
 		 1045 aa  1295    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  57.43 
 
 		 1042 aa  1242    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3385  CzcA family heavy metal efflux protein  53.62 
 
 		 1061 aa  1105    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  56.24 
 
 		 1043 aa  1135    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  61.74 
 
 		 1042 aa  1338    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  61.54 
 
 		 1048 aa  1303    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  55.28 
 
 		 1060 aa  1137    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  55.89 
 
 		 1065 aa  1146    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4833  CzcA family heavy metal efflux protein  57.13 
 
 		 1056 aa  1156    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831528 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  65.68 
 
 		 1048 aa  1427    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  55.76 
 
 		 1060 aa  1130    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  59.34 
 
 		 1039 aa  1245    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1157  CzcA family heavy metal efflux protein  68.5 
 
 		 1038 aa  1481    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  87.11 
 
 		 1056 aa  1833    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3972  CzcA family heavy metal efflux protein  56.38 
 
 		 1057 aa  1147    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287099 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  36.22 
 
 		 1043 aa  639    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  100 
 
 		 1055 aa  2110    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  68.47 
 
 		 1044 aa  1419    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  71.19 
 
 		 1044 aa  1476    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  72.28 
 
 		 1047 aa  1548    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0355  CzcA family heavy metal efflux protein  53.68 
 
 		 1044 aa  1053    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  72.05 
 
 		 1068 aa  1524    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  60.15 
 
 		 1045 aa  1265    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  56.65 
 
 		 1058 aa  1155    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>