More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_2926 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  45.81 
 
 
1047 aa  959    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.91 
 
 
1047 aa  960    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  35.91 
 
 
1034 aa  682    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  78.47 
 
 
1045 aa  1693    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  37.12 
 
 
1034 aa  692    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  35.69 
 
 
1053 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  36.91 
 
 
1048 aa  654    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  47.45 
 
 
1052 aa  982    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  39.49 
 
 
1032 aa  684    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  36.16 
 
 
1033 aa  660    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  51.34 
 
 
1066 aa  1077    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  52.47 
 
 
1049 aa  1139    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  47.75 
 
 
1047 aa  988    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  35.56 
 
 
1064 aa  671    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  47.52 
 
 
1047 aa  998    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  47.17 
 
 
1052 aa  967    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  35.32 
 
 
1455 aa  676    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  48.08 
 
 
1045 aa  989    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  46.93 
 
 
1045 aa  963    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  37.36 
 
 
1053 aa  676    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  47.51 
 
 
1070 aa  979    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  35.96 
 
 
1077 aa  664    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  47.65 
 
 
1047 aa  1017    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  37.71 
 
 
1049 aa  701    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  37.29 
 
 
1052 aa  690    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  36.73 
 
 
1054 aa  679    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  38.15 
 
 
1036 aa  659    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  36.25 
 
 
1029 aa  649    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  36.13 
 
 
1032 aa  640    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  52.01 
 
 
1051 aa  1099    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  51.15 
 
 
1044 aa  1081    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  36.32 
 
 
1032 aa  641    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  35.8 
 
 
1039 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  38.88 
 
 
1038 aa  668    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  35.26 
 
 
1075 aa  642    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  35.26 
 
 
1059 aa  662    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  46.93 
 
 
1060 aa  959    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  36.75 
 
 
1046 aa  681    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  50.77 
 
 
1058 aa  1014    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  47.64 
 
 
1070 aa  977    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  36.34 
 
 
1077 aa  671    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  37.35 
 
 
1045 aa  659    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  46.77 
 
 
1039 aa  953    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  36.15 
 
 
1062 aa  665    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  47.19 
 
 
1067 aa  995    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  47.66 
 
 
1074 aa  971    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  46.3 
 
 
1056 aa  976    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  37.3 
 
 
1050 aa  702    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  49.15 
 
 
1074 aa  1077    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  36.27 
 
 
1070 aa  673    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  79.43 
 
 
1045 aa  1709    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  36.32 
 
 
1034 aa  682    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  36.36 
 
 
1070 aa  676    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  34.23 
 
 
1065 aa  635    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  46.26 
 
 
1054 aa  938    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  34.33 
 
 
1064 aa  637    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  41.75 
 
 
1015 aa  825    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.74 
 
 
1049 aa  669    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  37.97 
 
 
1040 aa  675    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  48.99 
 
 
1059 aa  1064    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  36.86 
 
 
1019 aa  674    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  36.06 
 
 
1077 aa  666    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  40.83 
 
 
1022 aa  704    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  44.14 
 
 
1094 aa  919    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  50.91 
 
 
1051 aa  1019    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  51.39 
 
 
1043 aa  1099    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  45.9 
 
 
1039 aa  971    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  35.23 
 
 
1043 aa  638    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  47.41 
 
 
1045 aa  976    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  45.34 
 
 
1042 aa  927    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  50.81 
 
 
1052 aa  1044    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  38.24 
 
 
1031 aa  690    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  35.31 
 
 
1040 aa  671    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  35.11 
 
 
1046 aa  642    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  47.06 
 
 
1056 aa  974    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  35.67 
 
 
1083 aa  653    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  46.94 
 
 
1042 aa  969    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  35.19 
 
 
1070 aa  644    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  50.24 
 
 
1043 aa  1016    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  48.61 
 
 
1056 aa  1000    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  35.55 
 
 
1056 aa  642    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  48.79 
 
 
1068 aa  1002    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  51.06 
 
 
1060 aa  1037    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  51.16 
 
 
1065 aa  1035    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  35.04 
 
 
1069 aa  655    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  35.74 
 
 
1072 aa  654    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  51.44 
 
 
1060 aa  1032    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  47.13 
 
 
1045 aa  974    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  35.89 
 
 
1063 aa  651    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  47.14 
 
 
1056 aa  986    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  38.52 
 
 
1023 aa  677    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  36.61 
 
 
1043 aa  671    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  47.56 
 
 
1055 aa  999    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  47.16 
 
 
1044 aa  954    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  47.16 
 
 
1044 aa  946    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  47.17 
 
 
1047 aa  980    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  36.36 
 
 
1070 aa  676    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  48.7 
 
 
1068 aa  993    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  44.91 
 
 
1045 aa  926    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  52.27 
 
 
1058 aa  1052    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>