More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4598 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



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Replicon accession
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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00536  copper/silver efflux system, membrane component  56.08 
 
 		 1047 aa  1226    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.756563  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3054  heavy metal efflux pump, CzcA family  56.17 
 
 		 1047 aa  1227    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  58.49 
 
 		 1070 aa  1252    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.594297  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1332  CzcA family heavy metal efflux protein  47.36 
 
 		 1045 aa  976    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0319  CzcA family heavy metal RND efflux protein  58.49 
 
 		 1070 aa  1253    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0149  CzcA family heavy metal efflux protein  93.21 
 
 		 1049 aa  2000    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3534  CzcA family heavy metal efflux protein  86.99 
 
 		 1047 aa  1881    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5387  CzcA family heavy metal RND efflux protein  58.16 
 
 		 1052 aa  1253    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.134582 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3643  cation efflux system protein  50.96 
 
 		 1063 aa  1087    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4264  CzcA family heavy metal efflux protein  45.61 
 
 		 1092 aa  956    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0061881 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2264  CzcA family heavy metal efflux protein  53.18 
 
 		 1066 aa  1124    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1504  heavy metal efflux pump protein  42.04 
 
 		 1049 aa  875    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0325139  normal  0.186965 
 
 
-
 
NC_003296  RS05405  cation efflux system transmembrane protein  59.64 
 
 		 1047 aa  1290    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0262  CzcA family heavy metal efflux protein  55.45 
 
 		 1048 aa  1216    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0332  CzcA family heavy metal RND efflux protein  58.49 
 
 		 1070 aa  1254    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.744474  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2212  CzcA family heavy metal efflux protein  57.7 
 
 		 1049 aa  1240    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.589008  normal  0.652924 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4858  cation efflux system protein CusA  58.79 
 
 		 1052 aa  1227    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0178  putative cation efflux system transmembrane protein  59.1 
 
 		 1056 aa  1260    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4598  CzcA family heavy metal efflux protein  100 
 
 		 1045 aa  2108    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0153  CzcA family heavy metal efflux protein  90.72 
 
 		 1045 aa  1920    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0210  CzcA family heavy metal efflux protein  85.8 
 
 		 1045 aa  1853    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3376  CzcA family heavy metal efflux protein  58.49 
 
 		 1070 aa  1252    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0282  CzcA family heavy metal efflux protein  93.21 
 
 		 1049 aa  1999    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2361  chemiosmotic efflux system B protein A  47.34 
 
 		 1047 aa  1008    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0473  CzcA family heavy metal efflux protein  60.13 
 
 		 1056 aa  1310    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.39068  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3989  CzcA family heavy metal efflux protein  74.62 
 
 		 1045 aa  1620    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3362  CzcA family heavy metal efflux protein  58.07 
 
 		 1039 aa  1199    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3385  CzcA family heavy metal efflux protein  51.59 
 
 		 1061 aa  1070    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3402  CzcA family heavy metal efflux protein  58.73 
 
 		 1068 aa  1263    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3046  CzcA family heavy metal RND efflux protein  58.49 
 
 		 1070 aa  1252    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2265  heavy metal efflux pump CzcA  53.48 
 
 		 1051 aa  1118    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.312771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2480  heavy metal efflux pump CzcA  51.75 
 
 		 1044 aa  1093    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.578305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0089  CzcA family heavy metal efflux protein  47.99 
 
 		 1048 aa  1007    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2246  CzcA family heavy metal efflux protein  45.36 
 
 		 1100 aa  939    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0022  CzcA family heavy metal efflux protein  58.25 
 
 		 1052 aa  1277    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00365409 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0593  cation efflux system protein cusA  55.98 
 
 		 1047 aa  1226    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0550143  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1333  heavy metal efflux pump CzcA  57.64 
 
 		 1060 aa  1243    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2926  CzcA family heavy metal efflux protein  47.99 
 
 		 1046 aa  962    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.377794  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3131  heavy metal efflux pump CzcA  50.29 
 
 		 1058 aa  1063    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0514  CzcA family heavy metal efflux protein  58.73 
 
 		 1070 aa  1249    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.564268  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4173  CzcA family heavy metal efflux protein  90.72 
 
 		 1049 aa  1951    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3783  CzcA family heavy metal efflux protein  91.28 
 
 		 1045 aa  1959    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1370  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  57.49 
 
 		 1042 aa  1233    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.775676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3650  CzcA family heavy metal efflux protein  48.71 
 
 		 1045 aa  1007    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1530  heavy metal efflux pump  53.09 
 
 		 1067 aa  1137    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1535  heavy metal efflux pump  49 
 
 		 1074 aa  1045    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2396  heavy metal efflux pump CzcA  57.97 
 
 		 1056 aa  1262    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.592906  normal  0.0141595 
 
 
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NC_007498  Pcar_1714  putative inner membrane component for iron transport  54.39 
 
 		 1074 aa  1178    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0452812  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4304  CzcA family heavy metal efflux protein  90.43 
 
 		 1049 aa  1946    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.099897 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1547  heavy metal efflux pump CzcA  47.56 
 
 		 1045 aa  999    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00394954  normal  0.706432 
 
 
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NC_008825  Mpe_A1627  putative cation efflux system transmembrane protein  60.56 
 
 		 1063 aa  1307    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0355  CzcA family heavy metal efflux protein  51.43 
 
 		 1044 aa  1041    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4591  CzcA family heavy metal efflux protein  50.48 
 
 		 1055 aa  1069    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.256511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1778  heavy metal efflux pump CzcA  58.42 
 
 		 1054 aa  1244    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06366  hypothetical protein  56.2 
 
 		 1059 aa  1208    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3475  CzcA family heavy metal efflux protein  84.73 
 
 		 1048 aa  1813    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0883  heavy metal efflux pump CzcA  43.93 
 
 		 1015 aa  870    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0136  CzcA family heavy metal efflux protein  58.97 
 
 		 1040 aa  1243    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1406  heavy metal efflux pump CzcA  49.09 
 
 		 1059 aa  1044    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5182  CzcA family heavy metal efflux protein  59.07 
 
 		 1068 aa  1278    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.669903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2238  CzcA family heavy metal RND efflux protein  58.49 
 
 		 1070 aa  1252    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0622  cation efflux system protein cusA  56.17 
 
 		 1047 aa  1227    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00104736  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2392  CzcA family heavy metal efflux protein  57.02 
 
 		 1045 aa  1192    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007760  Adeh_4104  heavy metal efflux pump CzcA  46.25 
 
 		 1094 aa  962    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1103  heavy metal efflux pump CzcA  51.38 
 
 		 1051 aa  1073    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.953555 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1232  CzcA family heavy metal efflux protein  57.86 
 
 		 1039 aa  1260    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.99301  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0411  heavy metal efflux pump CzcA  52 
 
 		 1043 aa  1111    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1931  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  59.48 
 
 		 1039 aa  1259    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.412028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0061  RND family outer membrane copper/silver/drug transport protein  50.43 
 
 		 1069 aa  1083    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2703  CzcA family heavy metal efflux protein  52.29 
 
 		 1059 aa  1112    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.54771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3935  ATP synthase F1, alpha subunit  57.28 
 
 		 1042 aa  1201    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4657  heavy metal efflux pump CzcA  51.24 
 
 		 1052 aa  1083    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.306321 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3426  cation efflux system protein cusA  51.34 
 
 		 1057 aa  1103    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.140148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6282  CzcA family heavy metal efflux protein  58.46 
 
 		 1068 aa  1268    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491237  normal  0.311834 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4513  CzcA family heavy metal efflux protein  59.67 
 
 		 1055 aa  1287    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3491  heavy metal efflux pump CzcA  59.77 
 
 		 1056 aa  1292    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4833  CzcA family heavy metal efflux protein  51.58 
 
 		 1056 aa  1087    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0831528 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3856  CzcA family heavy metal efflux protein  90.99 
 
 		 1045 aa  1954    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3509  heavy metal efflux pump CzcA  74.28 
 
 		 1042 aa  1625    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1157  CzcA family heavy metal efflux protein  59.19 
 
 		 1038 aa  1260    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2741  heavy metal efflux pump CzcA  52.07 
 
 		 1043 aa  1078    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2437  CzcA family heavy metal efflux protein  46.34 
 
 		 1091 aa  970    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1390  CzcA family heavy metal efflux protein  57.38 
 
 		 1039 aa  1222    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.245764  normal  0.515313 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4359  heavy metal efflux pump CzcA  51.58 
 
 		 1060 aa  1077    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4404  heavy metal efflux pump CzcA  51.2 
 
 		 1065 aa  1081    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1483  CzcA family heavy metal efflux protein  52.29 
 
 		 1043 aa  1115    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4015  CzcA family heavy metal efflux protein  58.41 
 
 		 1050 aa  1270    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.310699  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1854  heavy metal efflux pump CzcA  51.53 
 
 		 1060 aa  1072    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.871861  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4386  CzcA family heavy metal efflux protein  51.34 
 
 		 1058 aa  1083    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3983  CzcA family heavy metal efflux protein  91.47 
 
 		 1045 aa  1947    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6136  proton antiporter cation efflux protein SilA  59.28 
 
 		 1056 aa  1285    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0754089  normal  1 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4300  CzcA family heavy metal efflux protein  55.45 
 
 		 1048 aa  1216    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0162  CzcA family heavy metal efflux protein  90.7 
 
 		 1049 aa  1948    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5033  copper and silver tricomponent efflux pump cusA  60.02 
 
 		 1055 aa  1289    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2393  heavy metal efflux pump CzcA  57.4 
 
 		 1044 aa  1220    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.73106  normal  0.0219915 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2441  heavy metal efflux pump CzcA  56.84 
 
 		 1044 aa  1220    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2550  heavy metal efflux pump CzcA  57.81 
 
 		 1047 aa  1248    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.750026  normal  1 
 
 
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NC_009720  Xaut_3972  CzcA family heavy metal efflux protein  50.67 
 
 		 1057 aa  1077    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.287099 
 
 
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NC_008061  Bcen_4765  heavy metal efflux pump CzcA  58.73 
 
 		 1068 aa  1263    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008345  Sfri_0266  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  74.98 
 
 		 1047 aa  1652    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.792977  n/a   
 
 
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