More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3011 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



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E-value
Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  38.02 
 
 		 1034 aa  644    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  39.08 
 
 		 1034 aa  640    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  38.24 
 
 		 1070 aa  639    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  40.45 
 
 		 1029 aa  650    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  40.77 
 
 		 1033 aa  664    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6240  putative cation efflux system protein  54.13 
 
 		 1025 aa  904    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  38.92 
 
 		 1061 aa  639    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  38.24 
 
 		 1070 aa  639    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2720  CzcA family heavy metal efflux protein  56.91 
 
 		 1016 aa  986    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.541366  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3951  CzcA family heavy metal efflux protein  49.57 
 
 		 1017 aa  910    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  39.64 
 
 		 1064 aa  659    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1943  cation efflux system protein CzcA  45.9 
 
 		 1024 aa  834    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3246  heavy metal efflux pump, CzcA family  59.57 
 
 		 1026 aa  986    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.88 
 
 		 1063 aa  640    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  39.41 
 
 		 1053 aa  647    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1680  CzcA family heavy metal efflux protein  52.92 
 
 		 1042 aa  931    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  39.41 
 
 		 1054 aa  646    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2709  CzcA family heavy metal efflux protein  97.34 
 
 		 1031 aa  1638    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00104  cation efflux system protein CzcA  47.14 
 
 		 1009 aa  801    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3712  CzcA family heavy metal efflux protein  60.76 
 
 		 1023 aa  976    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0204  heavy metal efflux pump, CzcA family  56.2 
 
 		 1034 aa  990    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.48458  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2801  heavy metal efflux pump CzcA  60.98 
 
 		 1028 aa  998    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4441  CzcA family heavy metal efflux protein  50.54 
 
 		 1017 aa  937    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.883147 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5655  heavy metal efflux pump CzcA  55.24 
 
 		 1037 aa  955    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0143  heavy metal efflux pump CzcA  57.28 
 
 		 1023 aa  925    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.609125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1461  heavy metal efflux pump, CzcA family  58.81 
 
 		 1034 aa  980    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.344532  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  38.71 
 
 		 1062 aa  647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0099  CzcA family heavy metal efflux protein  50.33 
 
 		 1017 aa  934    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  37.73 
 
 		 1032 aa  640    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  39.43 
 
 		 1050 aa  647    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4246  heavy metal efflux pump, CzcA family  50.54 
 
 		 1017 aa  938    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  37.97 
 
 		 1070 aa  637    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  52.93 
 
 		 1028 aa  966    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4301  CzcA family heavy metal efflux protein  50.43 
 
 		 1017 aa  937    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4375  heavy metal efflux pump, CzcA family  56.43 
 
 		 1037 aa  933    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2011  heavy metal efflux pump CzcA  45.82 
 
 		 1021 aa  862    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4972  heavy metal efflux pump, CzcA family  58.2 
 
 		 1031 aa  963    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615697  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3918  CzcA family heavy metal efflux protein  55.7 
 
 		 1038 aa  946    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00256702  normal  0.0818754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4294  heavy metal efflux pump CzcA  57.87 
 
 		 1026 aa  961    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200453  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4507  heavy metal efflux pump, CzcA family  56.43 
 
 		 1037 aa  933    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.541209 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3887  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  50.33 
 
 		 1017 aa  928    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  38.24 
 
 		 1070 aa  638    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  38.24 
 
 		 1070 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4188  heavy metal efflux pump CzcA  58.2 
 
 		 1026 aa  986    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3858  CzcA family heavy metal efflux protein  49.67 
 
 		 1017 aa  910    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.96 
 
 		 1049 aa  639    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4066  CzcA family heavy metal efflux protein  50 
 
 		 1017 aa  911    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3011  heavy metal efflux pump CzcA  100 
 
 		 1009 aa  1991    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0135257 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  39.25 
 
 		 1043 aa  637    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3766  CzcA family heavy metal efflux protein  50.59 
 
 		 1017 aa  895    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  38.37 
 
 		 1053 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  38.37 
 
 		 1053 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  37.7 
 
 		 1034 aa  632  1e-180  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  39.43 
 
 		 1040 aa  634  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  38.67 
 
 		 1063 aa  635  1e-180  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  38.37 
 
 		 1053 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.45 
 
 		 1034 aa  630  1e-179  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  38.27 
 
 		 1053 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  38.11 
 
 		 1077 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  38.69 
 
 		 1054 aa  627  1e-178  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  38.16 
 
 		 1059 aa  627  1e-178  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  38.11 
 
 		 1077 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  38.11 
 
 		 1077 aa  628  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  39.87 
 
 		 1069 aa  626  1e-178  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.14 
 
 		 1052 aa  625  1e-177  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  38.04 
 
 		 1077 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  38.04 
 
 		 1077 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  38.04 
 
 		 1077 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  37.93 
 
 		 1077 aa  623  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.19 
 
 		 1462 aa  624  1e-177  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  37.86 
 
 		 1083 aa  624  1e-177  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.9 
 
 		 1034 aa  624  1e-177  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  38.04 
 
 		 1077 aa  624  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  39.81 
 
 		 1047 aa  622  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3555  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.74 
 
 		 1062 aa  621  1e-176  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  38.13 
 
 		 1047 aa  618  1e-175  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  39.37 
 
 		 1051 aa  618  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  39.94 
 
 		 1048 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  38.02 
 
 		 1075 aa  615  9.999999999999999e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.41 
 
 		 1034 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  39.12 
 
 		 1031 aa  613  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  37.02 
 
 		 1049 aa  611  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  41.8 
 
 		 1022 aa  610  1e-173  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1079  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.48 
 
 		 1022 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0885781  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  37.95 
 
 		 1062 aa  609  1e-173  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  38.79 
 
 		 1070 aa  609  1e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4443  CzcA family heavy metal efflux protein  38.77 
 
 		 1060 aa  612  1e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  39.22 
 
 		 1048 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  39.96 
 
 		 1032 aa  608  9.999999999999999e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  39.11 
 
 		 1048 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  41.12 
 
 		 1023 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  35.96 
 
 		 1052 aa  602  1e-170  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4682  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.27 
 
 		 1049 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.439534 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3605  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.27 
 
 		 1049 aa  601  1e-170  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.584733  normal  0.967685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  38.58 
 
 		 1048 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1080  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.77 
 
 		 1051 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114839  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  40.38 
 
 		 1049 aa  593  1e-168  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2300  heavy metal efflux pump, CzcA family  38.21 
 
 		 1070 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  37.47 
 
 		 1062 aa  593  1e-168  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
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NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  38.21 
 
 		 1070 aa  593  1e-168  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212316 
 
 
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