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for query gene Tgr7_1584 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



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Organism name
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Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  66.21 
 
 		 1026 aa  1217    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  46.06 
 
 		 1043 aa  788    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  46.16 
 
 		 1049 aa  775    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  49.26 
 
 		 1023 aa  920    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  46.65 
 
 		 1049 aa  779    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  47.5 
 
 		 1039 aa  915    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  46.62 
 
 		 1043 aa  794    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.97 
 
 		 1039 aa  762    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  44.72 
 
 		 1039 aa  771    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  46.07 
 
 		 1058 aa  752    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  44.41 
 
 		 1075 aa  746    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  41.86 
 
 		 1066 aa  764    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  41.12 
 
 		 1071 aa  789    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.41 
 
 		 1037 aa  754    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  41.97 
 
 		 1066 aa  769    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.73 
 
 		 1048 aa  805    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  43.37 
 
 		 1039 aa  760    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  43.2 
 
 		 1039 aa  761    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  43.59 
 
 		 1036 aa  738    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  48.15 
 
 		 1034 aa  858    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  51.76 
 
 		 1045 aa  942    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  49.27 
 
 		 1041 aa  928    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.5 
 
 		 1039 aa  772    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.21 
 
 		 1054 aa  761    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  43.71 
 
 		 1039 aa  750    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  45.87 
 
 		 1031 aa  775    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.21 
 
 		 1053 aa  761    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.2 
 
 		 1048 aa  750    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
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NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  36.92 
 
 		 1052 aa  685    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.24 
 
 		 1092 aa  802    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  46.06 
 
 		 1049 aa  761    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.38 
 
 		 1049 aa  772    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
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NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  44.44 
 
 		 1043 aa  761    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
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NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  49.12 
 
 		 1030 aa  752    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
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NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  45.25 
 
 		 1058 aa  729    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
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NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  45.45 
 
 		 1066 aa  751    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
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NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  45.92 
 
 		 1037 aa  751    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
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NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.2 
 
 		 1061 aa  781    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
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NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  45.88 
 
 		 1047 aa  790    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
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NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  40.66 
 
 		 1032 aa  665    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.5 
 
 		 1039 aa  772    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  45.22 
 
 		 1040 aa  770    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
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NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  100 
 
 		 1034 aa  2012    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  45.35 
 
 		 1047 aa  744    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
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NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.47 
 
 		 1039 aa  755    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
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NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  40.55 
 
 		 1052 aa  635  1e-180  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
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NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  36.59 
 
 		 1065 aa  624  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
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NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  36.15 
 
 		 1040 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.29 
 
 		 1034 aa  611  1e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
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NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  36.03 
 
 		 1066 aa  604  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  35.51 
 
 		 1069 aa  602  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.33 
 
 		 1049 aa  604  1.0000000000000001e-171  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  34.86 
 
 		 1032 aa  601  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  35.89 
 
 		 1064 aa  602  1e-170  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.29 
 
 		 1034 aa  595  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.89 
 
 		 1034 aa  597  1e-169  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  37.06 
 
 		 1070 aa  596  1e-169  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
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NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  36.88 
 
 		 1070 aa  597  1e-169  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
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NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  37.06 
 
 		 1070 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  37.06 
 
 		 1070 aa  597  1e-169  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  37.25 
 
 		 1076 aa  593  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
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NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  35.34 
 
 		 1053 aa  593  1e-168  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  37.04 
 
 		 1077 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  37.04 
 
 		 1077 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  37.04 
 
 		 1077 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  36.97 
 
 		 1070 aa  595  1e-168  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  36.52 
 
 		 1048 aa  594  1e-168  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  35.37 
 
 		 1034 aa  592  1e-167  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  36.75 
 
 		 1077 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  36.75 
 
 		 1077 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  36.75 
 
 		 1077 aa  590  1e-167  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  34.71 
 
 		 1059 aa  590  1e-167  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  36.36 
 
 		 1077 aa  590  1e-167  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  40.54 
 
 		 1054 aa  590  1e-167  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  36.09 
 
 		 1083 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  36.18 
 
 		 1062 aa  591  1e-167  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  36.66 
 
 		 1077 aa  588  1e-166  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  35.2 
 
 		 1054 aa  588  1e-166  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  36.81 
 
 		 1046 aa  587  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  37.56 
 
 		 1075 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009831  Ssed_3868  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA (cation efflux system protein CzcA)  35.41 
 
 		 1044 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  38.73 
 
 		 1039 aa  584  1.0000000000000001e-165  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  35.24 
 
 		 1046 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  37.27 
 
 		 1070 aa  580  1e-164  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  37.5 
 
 		 1066 aa  582  1e-164  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.26 
 
 		 1052 aa  580  1e-164  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  37.08 
 
 		 1070 aa  579  1e-164  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  36.17 
 
 		 1029 aa  580  1e-164  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  36.6 
 
 		 1082 aa  579  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2031  CzcA family heavy metal efflux protein  34.04 
 
 		 1037 aa  582  1e-164  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  34.35 
 
 		 1053 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  37.01 
 
 		 1075 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009997  Sbal195_3973  CzcA family heavy metal efflux protein  37.45 
 
 		 1068 aa  577  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.99 
 
 		 1063 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
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NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  35.34 
 
 		 1075 aa  576  1.0000000000000001e-163  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
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NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  35.83 
 
 		 1034 aa  578  1.0000000000000001e-163  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  36.03 
 
 		 1061 aa  578  1.0000000000000001e-163  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  36.52 
 
 		 1076 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  34.35 
 
 		 1053 aa  576  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
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NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  34.89 
 
 		 1063 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
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