More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_0294 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  48.78 
 
 		 1023 aa  949    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3058  acriflavin resistance protein  42.78 
 
 		 1066 aa  731    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.37635  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0064  CzcA family heavy metal efflux protein  48.88 
 
 		 1039 aa  949    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3471  CzcA family heavy metal efflux protein  43.57 
 
 		 1043 aa  784    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  unclonable  0.00106273  normal  0.764993 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4126  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.97 
 
 		 1049 aa  753    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3406  CzcA family heavy metal efflux protein  43.89 
 
 		 1043 aa  769    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1584  heavy metal efflux pump, CzcA family  49.27 
 
 		 1034 aa  913    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0183  acriflavin resistance protein  38.85 
 
 		 1032 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0995  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.94 
 
 		 1048 aa  792    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.998262  normal  0.0908924 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2073  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  44 
 
 		 1066 aa  820    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2351  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  43.83 
 
 		 1071 aa  825    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2063  chemiosmotic efflux system protein A-like protein  43.93 
 
 		 1066 aa  817    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1297  multidrug ABC transporter  39.48 
 
 		 1052 aa  660    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.777713  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1329  CzcA family heavy metal efflux protein  42.27 
 
 		 1039 aa  767    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.039425  normal  0.381421 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2617  heavy metal efflux pump CzcA  42.08 
 
 		 1039 aa  768    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  0.427313 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0181  CzcA family heavy metal efflux protein  43.19 
 
 		 1047 aa  728    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.543317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5616  acriflavin resistance protein  43.39 
 
 		 1031 aa  775    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0902  heavy metal efflux pump CzcA  40.12 
 
 		 1036 aa  708    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.920503 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1746  heavy metal efflux pump CzcA  44.25 
 
 		 1034 aa  831    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.787262 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4089  acriflavin resistance protein  42.41 
 
 		 1075 aa  737    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.320158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0294  heavy metal efflux pump  100 
 
 		 1041 aa  2068    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.393519  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4387  acriflavin resistance protein  49.76 
 
 		 1030 aa  837    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.285885  normal  0.792526 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2095  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.95 
 
 		 1039 aa  784    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1887  heavy metal efflux pump, CzcA family  44.67 
 
 		 1037 aa  783    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0646993  normal  0.625428 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0144  CzcA family heavy metal efflux protein  44.47 
 
 		 1047 aa  805    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2098  heavy metal efflux pump, CzcA family  48.92 
 
 		 1026 aa  860    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1059  acriflavin resistance protein  35.9 
 
 		 1052 aa  644    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0110  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.39 
 
 		 1049 aa  763    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.705785 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2382  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.95 
 
 		 1039 aa  784    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0207882  hitchhiker  0.000762741 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2949  acriflavin resistance protein  42.87 
 
 		 1058 aa  728    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.522411 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1142  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.58 
 
 		 1048 aa  763    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0325102  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2534  CzcA family heavy metal efflux protein  43.67 
 
 		 1049 aa  752    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.409022  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1542  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.64 
 
 		 1054 aa  736    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4094  CzcA family heavy metal efflux protein  65.05 
 
 		 1045 aa  1320    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.966069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2831  acriflavin resistance protein  43.21 
 
 		 1058 aa  737    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.310418 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0669  heavy metal efflux pump, CzcA family  42.1 
 
 		 1092 aa  820    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.725798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2674  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.76 
 
 		 1039 aa  770    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0949  heavy metal efflux pump, CzcA family  40.45 
 
 		 1053 aa  747    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1103  heavy metal efflux pump, CzcA family  43 
 
 		 1049 aa  760    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.442224  normal  0.0460054 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18570  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.41 
 
 		 1039 aa  783    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219423  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4731  heavy metal efflux pump, CzcA family  43.52 
 
 		 1037 aa  773    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.971345 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1783  acriflavin resistance protein  51.31 
 
 		 1040 aa  995    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.146507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1649  cation efflux system protein, AcrB/AcrD/AcrF family protein  42.27 
 
 		 1039 aa  775    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.880571  normal  0.706094 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1742  CzcA family heavy metal efflux protein  45.2 
 
 		 1043 aa  813    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.415877 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4569  CzcA family heavy metal efflux protein  42.18 
 
 		 1039 aa  762    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1991  heavy metal efflux pump, CzcA family  41.51 
 
 		 1061 aa  773    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0623146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1184  heavy metal efflux pump CzcA, putative  38.01 
 
 		 1039 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5032  acriflavin resistance protein  37.99 
 
 		 1064 aa  597  1e-169  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.561041 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  35.96 
 
 		 1029 aa  592  1e-168  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  35.02 
 
 		 1065 aa  595  1e-168  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3709  acriflavin resistance protein  37.67 
 
 		 1054 aa  595  1e-168  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.294251  decreased coverage  0.000260897 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  34.89 
 
 		 1049 aa  592  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  34.64 
 
 		 1052 aa  592  1e-167  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.63 
 
 		 1049 aa  591  1e-167  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  36.18 
 
 		 1033 aa  588  1e-166  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1632  acriflavin resistance protein  34.77 
 
 		 1046 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.951985  normal  0.0573923 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  34 
 
 		 1059 aa  581  1e-164  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  34.57 
 
 		 1076 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  34.02 
 
 		 1066 aa  576  1.0000000000000001e-163  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  35.29 
 
 		 1040 aa  576  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  34.58 
 
 		 1069 aa  576  1.0000000000000001e-163  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4980  acriflavin resistance protein  37.92 
 
 		 1064 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.418063  normal  0.190212 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2183  acriflavin resistance protein  36.23 
 
 		 1054 aa  577  1.0000000000000001e-163  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  33.68 
 
 		 1070 aa  575  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  33.68 
 
 		 1070 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.69 
 
 		 1052 aa  574  1.0000000000000001e-162  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4520  acriflavin resistance protein  38.01 
 
 		 1064 aa  575  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.73342 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  33.68 
 
 		 1070 aa  574  1.0000000000000001e-162  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2877  acriflavin resistance protein  38.04 
 
 		 1061 aa  570  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.342054  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  34.12 
 
 		 1077 aa  572  1e-161  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  33.59 
 
 		 1070 aa  571  1e-161  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  34.12 
 
 		 1077 aa  572  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  34.12 
 
 		 1077 aa  572  1e-161  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  34.21 
 
 		 1069 aa  569  1e-161  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  34.68 
 
 		 1066 aa  571  1e-161  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  34.12 
 
 		 1077 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0079  AcrB/AcrD/AcrF family protein  36.35 
 
 		 1028 aa  568  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.60921  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  34.9 
 
 		 1068 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  33.65 
 
 		 1070 aa  568  1e-160  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  34.12 
 
 		 1077 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3973  CzcA family heavy metal efflux protein  35 
 
 		 1068 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3847  CzcA family heavy metal efflux protein  35 
 
 		 1068 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  34.12 
 
 		 1077 aa  568  1e-160  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  35.27 
 
 		 1062 aa  567  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1087  CzcA family heavy metal efflux protein  34.82 
 
 		 1061 aa  568  1e-160  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  34.45 
 
 		 1082 aa  566  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  34.41 
 
 		 1048 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  34.03 
 
 		 1077 aa  566  1.0000000000000001e-159  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  35.17 
 
 		 1075 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3285  CzcA family heavy metal efflux protein  34.42 
 
 		 1048 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.571532 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  33.18 
 
 		 1075 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  34.48 
 
 		 1074 aa  561  1e-158  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  33.72 
 
 		 1062 aa  559  1e-158  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3791  heavy metal efflux pump, CzcA family  34.9 
 
 		 1068 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.79 
 
 		 1063 aa  561  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2044  CzcA family heavy metal efflux protein  34.51 
 
 		 1048 aa  561  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.668471  normal  0.474032 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  33.85 
 
 		 1046 aa  561  1e-158  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  33.43 
 
 		 1043 aa  562  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  34.74 
 
 		 1076 aa  562  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  33.4 
 
 		 1064 aa  556  1e-157  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>