More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4437 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4437  cation/multidrug efflux pump-like protein  100 
 
 
299 aa  593  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3981  acriflavin resistance protein  64.93 
 
 
1014 aa  362  3e-99  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6008  acriflavin resistance protein  59.56 
 
 
1026 aa  303  2.0000000000000002e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142083  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1002  acriflavin resistance protein  52.81 
 
 
1028 aa  283  3.0000000000000004e-75  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.507874  normal  0.0489892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3931  acriflavin resistance protein  51.21 
 
 
1026 aa  259  3e-68  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415531  normal  0.145125 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1535  acriflavin resistance protein  46.82 
 
 
1030 aa  252  5.000000000000001e-66  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.455491  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0507  acriflavin resistance protein  46.82 
 
 
1020 aa  226  4e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.433089  normal  0.988199 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2269  RND family efflux transporter  33.33 
 
 
1039 aa  168  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4648  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.73 
 
 
1041 aa  157  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.84833  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  33.84 
 
 
1043 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2558  acriflavin resistance protein  33.59 
 
 
1035 aa  155  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0417174  normal  0.272072 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0608  acriflavin resistance protein  33.95 
 
 
1059 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0300308  normal  0.48397 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  34.35 
 
 
1011 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1907  acriflavin resistance protein  32.58 
 
 
1051 aa  149  6e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0495674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4520  acriflavin resistance protein  34.11 
 
 
1043 aa  148  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0176  acriflavin resistance protein  31.56 
 
 
1034 aa  147  2.0000000000000003e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  29.55 
 
 
1034 aa  146  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1268  acriflavin resistance protein  31.65 
 
 
1058 aa  144  2e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 
1044 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  33.08 
 
 
1050 aa  143  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2683  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.45 
 
 
1458 aa  143  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.858123  normal  0.311516 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0965  AcrB/AcrD/AcrF family protein  32.72 
 
 
1024 aa  142  5e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00708155  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5032  AcrB/AcrD/AcrF family protein  34.72 
 
 
1024 aa  142  6e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1939  acriflavin resistance protein  31.18 
 
 
1044 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  34.29 
 
 
1052 aa  142  8e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  33.2 
 
 
1064 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  30.65 
 
 
1068 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3973  CzcA family heavy metal efflux protein  30.65 
 
 
1068 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3503  heavy metal efflux pump CzcA  34.25 
 
 
1039 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0796424  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3847  CzcA family heavy metal efflux protein  30.65 
 
 
1068 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1217  acriflavin resistance protein  36.2 
 
 
899 aa  140  3e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538405  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1942  acriflavin resistance protein  32.84 
 
 
1040 aa  140  3e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.211904  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  31.44 
 
 
1032 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1842  acriflavin resistance protein  29.37 
 
 
1058 aa  139  4.999999999999999e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.844387  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1875  heavy metal efflux pump CzcA  31.84 
 
 
1029 aa  139  4.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.66936  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  30.62 
 
 
1075 aa  139  7e-32  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3400  CzcA family heavy metal efflux protein  31 
 
 
1023 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0160  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 
1033 aa  139  7.999999999999999e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2953  acriflavin resistance protein  29.45 
 
 
1038 aa  139  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.133437  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  29.24 
 
 
1044 aa  139  7.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  29.01 
 
 
1032 aa  138  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  32.62 
 
 
1028 aa  138  1e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 
1038 aa  137  2e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1942  acriflavin resistance protein  32.3 
 
 
1036 aa  137  2e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427834  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3791  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.27 
 
 
1068 aa  137  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  28.63 
 
 
1032 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  30.5 
 
 
1045 aa  136  3.0000000000000003e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.22 
 
 
1462 aa  136  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0828  acriflavin resistance protein  33.46 
 
 
1031 aa  136  4e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2274  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.06 
 
 
1034 aa  136  4e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.256296 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  32.17 
 
 
1034 aa  136  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  29.15 
 
 
1054 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  31.78 
 
 
1023 aa  135  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 
1046 aa  135  7.000000000000001e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1782  acriflavin resistance protein  32.19 
 
 
1043 aa  135  8e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.849886  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1648  acriflavin resistance protein  30.19 
 
 
1082 aa  135  9e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  29.89 
 
 
1070 aa  135  9e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  29.5 
 
 
1075 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  32.85 
 
 
1049 aa  135  9.999999999999999e-31  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  31.64 
 
 
1038 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5659  acriflavin resistance protein  37.11 
 
 
1022 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.891494  normal  0.720908 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1925  acriflavin resistance protein  33.21 
 
 
1020 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.553474  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  32.71 
 
 
1029 aa  135  9.999999999999999e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1937  acriflavin resistance protein  30.97 
 
 
1034 aa  135  9.999999999999999e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.256217  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  29.89 
 
 
1070 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  30.62 
 
 
1066 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  32.08 
 
 
1035 aa  135  9.999999999999999e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  29.89 
 
 
1070 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1959  putative RND efflux system protein  33.46 
 
 
1038 aa  134  1.9999999999999998e-30  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00374  putative RND efflux system protein  32.58 
 
 
1035 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0527  acriflavin resistance protein  28.57 
 
 
1067 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.64955  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2689  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.71 
 
 
1459 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.812811  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4058  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.97 
 
 
1037 aa  134  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  31.06 
 
 
1034 aa  134  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3757  acriflavin resistance protein  31.97 
 
 
1047 aa  134  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2809  cation efflux protein  27.76 
 
 
1050 aa  133  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.354726  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1453  acriflavin resistance protein  29.96 
 
 
1031 aa  133  3e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  30.12 
 
 
1020 aa  133  3.9999999999999996e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3246  heavy metal efflux pump, CzcA family  32.08 
 
 
1026 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3312  acriflavin resistance protein  31.92 
 
 
1008 aa  133  3.9999999999999996e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4384  CzcA family heavy metal efflux protein  30.51 
 
 
1047 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.55849  normal  0.35087 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1941  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.06 
 
 
1034 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0917  heavy metal efflux pump, CzcA family  31.99 
 
 
1043 aa  132  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.164104 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0226  acriflavin resistance protein  35.59 
 
 
1054 aa  132  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.38584  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3203  acriflavin resistance protein  28.73 
 
 
1041 aa  132  6e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  30.97 
 
 
1040 aa  132  6e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0763  acriflavin resistance protein  32.6 
 
 
1039 aa  132  6.999999999999999e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  30.25 
 
 
1071 aa  132  7.999999999999999e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  29.47 
 
 
1070 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  32.22 
 
 
1051 aa  132  9e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3171  acriflavin resistance protein  32.96 
 
 
1074 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.1622  hitchhiker  0.0000000446015 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  32.97 
 
 
1042 aa  131  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0885  acriflavin resistance protein  29.54 
 
 
1063 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3454  acriflavin resistance protein  30.15 
 
 
1063 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  29.03 
 
 
1077 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0576  heavy metal efflux pump CzcA  29.89 
 
 
1077 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  30.74 
 
 
1043 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00104  cation efflux system protein CzcA  31.43 
 
 
1009 aa  132  1.0000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1210  acriflavin resistance protein  30.3 
 
 
1074 aa  131  1.0000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.154202  normal  0.271752 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0658  acriflavin resistance protein  29.78 
 
 
1050 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>