More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1217 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3095  acriflavin resistance protein  53.89 
 
 		 880 aa  876    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3025  acriflavin resistance protein  53.89 
 
 		 880 aa  876    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1217  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 899 aa  1794    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.538405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3374  acriflavin resistance protein  54.35 
 
 		 900 aa  932    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4418  acriflavin resistance protein  50.36 
 
 		 954 aa  870    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.619549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3610  acriflavin resistance protein  29.01 
 
 		 1040 aa  365  1e-99  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35819  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1043  nodulation protein precursor  31.31 
 
 		 1069 aa  355  2e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1892  acriflavin resistance protein  33.24 
 
 		 1031 aa  354  5e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6179  acriflavin resistance protein  32.36 
 
 		 1065 aa  352  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.160015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3031  acriflavin resistance protein  32.39 
 
 		 1042 aa  348  3e-94  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.050113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2622  acriflavin resistance protein  34.52 
 
 		 1014 aa  348  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0815  acriflavin resistance protein  31.98 
 
 		 1036 aa  347  5e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0752  acriflavin resistance protein  31.79 
 
 		 1071 aa  345  2e-93  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5161  acriflavin resistance protein  32.01 
 
 		 1050 aa  343  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.938326  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0557  AcrB/AcrD/AcrF family mulitdrug efflux protein  31.97 
 
 		 1046 aa  331  4e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.644093  normal  0.291985 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3889  acriflavin resistance protein  32.1 
 
 		 1018 aa  325  3e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0552128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1338  acriflavin resistance protein  30.91 
 
 		 1044 aa  324  4e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4543  acriflavin resistance protein  33.1 
 
 		 1033 aa  324  5e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.266065 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3471  acriflavin resistance protein  33.1 
 
 		 1033 aa  324  5e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0282385  normal  0.0800862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2802  acriflavin resistance protein  31.94 
 
 		 1042 aa  321  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.749449  normal  0.186131 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1505  acriflavin resistance protein  26.89 
 
 		 1088 aa  319  2e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0176509 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05050  acriflavin resistance protein  31.78 
 
 		 1011 aa  317  4e-85  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000211109  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2498  acriflavin resistance protein  32.09 
 
 		 1041 aa  317  6e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.224537  normal  0.54052 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1383  acriflavin resistance protein  30.9 
 
 		 1022 aa  313  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3179  acriflavin resistance protein  27.25 
 
 		 1023 aa  312  2e-83  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.000000434633  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01779  transporter lipoprotein transmembrane  31.95 
 
 		 1405 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2258  acriflavin resistance protein  29.58 
 
 		 1053 aa  307  5.0000000000000004e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.456797  normal  0.166006 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0902  acriflavin resistance protein  28.06 
 
 		 1029 aa  307  5.0000000000000004e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.621432  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2369  acriflavin resistance protein  31.15 
 
 		 1050 aa  305  2.0000000000000002e-81  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000403174 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4164  acriflavin resistance protein  27.46 
 
 		 1040 aa  303  7.000000000000001e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0666932  normal  0.648782 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2862  acriflavin resistance protein  28.4 
 
 		 1036 aa  302  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3262  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  28.4 
 
 		 1036 aa  302  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2131  AcrB/AcrD/AcrF family protein  29.15 
 
 		 1024 aa  301  3e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4744  acriflavin resistance protein  31.78 
 
 		 1028 aa  300  1e-79  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.277916 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2099  acriflavin resistance protein  31.85 
 
 		 1043 aa  298  4e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2950  acriflavin resistance protein  29.91 
 
 		 1044 aa  297  6e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2104  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  29.6 
 
 		 1034 aa  296  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1761  acriflavin resistance protein  29.6 
 
 		 1034 aa  296  2e-78  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0169  acriflavin resistance protein  26.78 
 
 		 1036 aa  293  8e-78  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.78043 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2968  multidrug efflux system subunit MdtC  28.15 
 
 		 1026 aa  293  1e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0765  putative multidrug efflux protein  27.07 
 
 		 1026 aa  292  2e-77  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4317  acriflavin resistance protein  28.27 
 
 		 1263 aa  292  2e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1335  putative RND efflux transporter  30.63 
 
 		 1028 aa  292  2e-77  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.14004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0880  hydrophobe/amphiphile efflux-1 (HAE1) family protein  29.61 
 
 		 1068 aa  291  3e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.288102  normal  0.231109 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2783  acriflavin resistance protein  30.77 
 
 		 1045 aa  287  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0544081  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1856  acriflavin resistance protein  29.16 
 
 		 1041 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1922  acriflavin resistance protein  29.63 
 
 		 1022 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.209297  normal  0.294162 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1941  acriflavin resistance protein  29.02 
 
 		 1041 aa  285  4.0000000000000003e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.143318  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0379  acriflavin resistance protein  30.64 
 
 		 1024 aa  284  5.000000000000001e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4182  acriflavin resistance protein  29.69 
 
 		 1033 aa  282  2e-74  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.559486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4294  acriflavin resistance protein  29.69 
 
 		 1033 aa  282  2e-74  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1232  acriflavin resistance protein  26.38 
 
 		 1051 aa  281  5e-74  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.363088  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1652  acriflavin resistance protein  27.63 
 
 		 1037 aa  280  6e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.257724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001981  RND multidrug efflux transporter  26.34 
 
 		 1040 aa  281  6e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1037  acriflavin resistance protein  30.12 
 
 		 1036 aa  280  7e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0979  acriflavin resistance protein  30.76 
 
 		 1009 aa  279  1e-73  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.650548  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2109  acriflavin resistance protein  27.98 
 
 		 1044 aa  280  1e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2429  acriflavin resistance protein  30.63 
 
 		 1034 aa  280  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.618846 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3554  multidrug efflux system subunit MdtC  29.03 
 
 		 1026 aa  277  5e-73  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2704  multidrug efflux system subunit MdtC  28 
 
 		 1030 aa  276  9e-73  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1682  acriflavin resistance protein  29.72 
 
 		 1064 aa  276  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377778  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0451  acriflavin resistance protein  28.1 
 
 		 1055 aa  276  2.0000000000000002e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.931818 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3101  multidrug efflux system subunit MdtC  29.71 
 
 		 1024 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0416497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0354  acriflavin resistance protein  30.2 
 
 		 1101 aa  275  3e-72  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00649102  unclonable  0.0000000737583 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1579  acriflavin resistance protein  27.28 
 
 		 1046 aa  275  4.0000000000000004e-72  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0743  acriflavin resistance protein  28.97 
 
 		 1044 aa  275  4.0000000000000004e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.590398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0778  acriflavin resistance protein  30.47 
 
 		 1040 aa  274  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.21707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2349  acriflavin resistance protein  33.81 
 
 		 1070 aa  275  4.0000000000000004e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.253914  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5389  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  27.94 
 
 		 1038 aa  274  5.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.433954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4150  acriflavin resistance protein  26.09 
 
 		 1027 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1146  acriflavine resistance protein  28.59 
 
 		 1026 aa  274  7e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.199335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1330  multidrug efflux system subunit MdtC  29.71 
 
 		 1024 aa  273  8.000000000000001e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00480  multidrug efflux pump  25.8 
 
 		 1040 aa  273  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01445  hypothetical protein  31.46 
 
 		 1037 aa  273  1e-71  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1383  acriflavin resistance protein  26.68 
 
 		 1014 aa  273  1e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000121579  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3964  acriflavin resistance protein  26.72 
 
 		 1035 aa  273  1e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000156628 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0704  acriflavin resistance protein  30.67 
 
 		 1038 aa  272  2e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0871  acriflavin resistance plasma membrane protein  29.59 
 
 		 1012 aa  272  2e-71  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4004  acriflavin resistance protein  35.4 
 
 		 1470 aa  272  2e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1388  AcrB/AcrD/AcrF family protein  31.19 
 
 		 1043 aa  272  2e-71  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.944754  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1213  multidrug efflux system subunit MdtC  29.58 
 
 		 1024 aa  271  2.9999999999999997e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000286734  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2296  putative integral membrane efflux protein  27.04 
 
 		 1064 aa  271  4e-71  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2552  putative multidrug resistance protein  25.6 
 
 		 1036 aa  270  8e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000475921  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0439  putative multidrug resistance protein  30.15 
 
 		 1036 aa  270  8e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00223634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5114  transporter; acriflavin resistance protein  27.31 
 
 		 1038 aa  270  1e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1020  acriflavin resistance protein  24.53 
 
 		 1037 aa  270  1e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.00000109455  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0465  acriflavin resistance protein  26.19 
 
 		 1025 aa  269  1e-70  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.471269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3269  putative multidrug resistance protein  26.43 
 
 		 1023 aa  269  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1611  AcrB/AcrD/AcrF family protein  27.54 
 
 		 1032 aa  269  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.651571  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2382  acriflavin resistance protein  25.79 
 
 		 1083 aa  268  2e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5560  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  27.77 
 
 		 1038 aa  268  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5568  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.45 
 
 		 1039 aa  267  5.999999999999999e-70  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5616  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  27.42 
 
 		 1038 aa  266  8.999999999999999e-70  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5289  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.26 
 
 		 1038 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.388474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5686  AcrB/AcrD/AcrF family transporter  27.26 
 
 		 1038 aa  266  1e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5530  transporter, AcrB/AcrD/AcrF family  27.26 
 
 		 1038 aa  265  2e-69  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2083  RND superfamily multidrug efflux system protein  27.06 
 
 		 1036 aa  266  2e-69  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.334854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0948  acriflavin resistance protein  26.65 
 
 		 1015 aa  265  2e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2658  multidrug efflux membrane fusion protein  25.61 
 
 		 1030 aa  265  3e-69  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2283  acriflavin resistance protein  30.03 
 
 		 1051 aa  264  4.999999999999999e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>