More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_00104 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1583  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.04 
 
 		 1049 aa  643    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.840242  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1461  heavy metal efflux pump, CzcA family  49.8 
 
 		 1034 aa  895    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.344532  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  36.08 
 
 		 1053 aa  654    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6240  putative cation efflux system protein  47.88 
 
 		 1025 aa  882    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  39.98 
 
 		 1032 aa  655    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  38.45 
 
 		 1033 aa  682    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4507  heavy metal efflux pump, CzcA family  48.42 
 
 		 1037 aa  882    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.541209 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2720  CzcA family heavy metal efflux protein  49.9 
 
 		 1016 aa  936    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.541366  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1680  CzcA family heavy metal efflux protein  47.58 
 
 		 1042 aa  867    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1943  cation efflux system protein CzcA  55.77 
 
 		 1024 aa  1116    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3918  CzcA family heavy metal efflux protein  48.38 
 
 		 1038 aa  879    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  decreased coverage  0.00256702  normal  0.0818754 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  36.41 
 
 		 1053 aa  655    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2212  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.71 
 
 		 1052 aa  645    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3712  CzcA family heavy metal efflux protein  50.2 
 
 		 1023 aa  894    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  36.08 
 
 		 1053 aa  654    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.899246  hitchhiker  0.00920883 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  37.85 
 
 		 1049 aa  667    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  37.15 
 
 		 1052 aa  653    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2709  CzcA family heavy metal efflux protein  48.44 
 
 		 1031 aa  879    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  36 
 
 		 1054 aa  653    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4301  CzcA family heavy metal efflux protein  57.2 
 
 		 1017 aa  1190    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00104  cation efflux system protein CzcA  100 
 
 		 1009 aa  2006    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  36.84 
 
 		 1048 aa  640    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2801  heavy metal efflux pump CzcA  49.44 
 
 		 1028 aa  889    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  39.17 
 
 		 1038 aa  648    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5655  heavy metal efflux pump CzcA  48.57 
 
 		 1037 aa  898    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0143  heavy metal efflux pump CzcA  49.85 
 
 		 1023 aa  862    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.609125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  35.98 
 
 		 1059 aa  637    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4246  heavy metal efflux pump, CzcA family  57.2 
 
 		 1017 aa  1187    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  38.66 
 
 		 1045 aa  647    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  35.33 
 
 		 1050 aa  647    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3951  CzcA family heavy metal efflux protein  57.3 
 
 		 1017 aa  1161    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0204  heavy metal efflux pump, CzcA family  48.89 
 
 		 1034 aa  924    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.48458  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0536  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.22 
 
 		 1034 aa  648    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  48.31 
 
 		 1028 aa  923    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0057  CzcA family heavy metal efflux protein  35.98 
 
 		 1053 aa  651    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2011  heavy metal efflux pump CzcA  45.47 
 
 		 1021 aa  886    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  39.26 
 
 		 1040 aa  672    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  37.27 
 
 		 1040 aa  651    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4972  heavy metal efflux pump, CzcA family  48.04 
 
 		 1031 aa  868    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.615697  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4294  heavy metal efflux pump CzcA  47.79 
 
 		 1026 aa  874    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0225  CzcA family heavy metal efflux protein  37.19 
 
 		 1040 aa  637    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  37.21 
 
 		 1038 aa  646    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  38.71 
 
 		 1031 aa  669    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4066  CzcA family heavy metal efflux protein  57.2 
 
 		 1017 aa  1159    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  36.37 
 
 		 1046 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4375  heavy metal efflux pump, CzcA family  48.42 
 
 		 1037 aa  882    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2717  RND divalent metal cation efflux transporter CzcA  36.65 
 
 		 1051 aa  656    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.300642  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0060  CzcA family heavy metal efflux protein  36.08 
 
 		 1053 aa  654    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00890967 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4188  heavy metal efflux pump CzcA  48.09 
 
 		 1026 aa  895    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809737 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3858  CzcA family heavy metal efflux protein  57.2 
 
 		 1017 aa  1159    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4441  CzcA family heavy metal efflux protein  57.2 
 
 		 1017 aa  1189    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.883147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0099  CzcA family heavy metal efflux protein  57.1 
 
 		 1017 aa  1184    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3766  CzcA family heavy metal efflux protein  57.1 
 
 		 1017 aa  1158    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3011  heavy metal efflux pump CzcA  47.43 
 
 		 1009 aa  765    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0135257 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  38.4 
 
 		 1023 aa  660    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  35.82 
 
 		 1043 aa  636    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3246  heavy metal efflux pump, CzcA family  51.83 
 
 		 1026 aa  954    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3887  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  56.7 
 
 		 1017 aa  1163    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4763  CzcA family heavy metal efflux protein  38.41 
 
 		 1029 aa  666    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0261947  normal  0.80493 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  36.24 
 
 		 1064 aa  633  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  35.78 
 
 		 1075 aa  634  1e-180  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  37.05 
 
 		 1046 aa  634  1e-180  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1762  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.56 
 
 		 1063 aa  631  1e-179  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.900927  normal  0.462536 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  35.98 
 
 		 1032 aa  626  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6172  CzcA family heavy metal efflux protein  36.28 
 
 		 1070 aa  627  1e-178  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.324532 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  36.18 
 
 		 1070 aa  625  1e-177  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  35.47 
 
 		 1034 aa  622  1e-177  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0515  heavy metal efflux pump, CzcA family  36.26 
 
 		 1047 aa  623  1e-177  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.750928  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3605  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.79 
 
 		 1049 aa  625  1e-177  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.584733  normal  0.967685 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0541  CzcA family heavy metal efflux protein  36.02 
 
 		 1074 aa  622  1e-177  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.865334  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  36.18 
 
 		 1070 aa  625  1e-177  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  36.17 
 
 		 1032 aa  625  1e-177  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  36.43 
 
 		 1070 aa  625  1e-177  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  35.01 
 
 		 1065 aa  623  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0667  CzcA family heavy metal efflux protein  36.45 
 
 		 1042 aa  624  1e-177  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.344163 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2108  heavy metal efflux pump CzcA  36.56 
 
 		 1058 aa  624  1e-177  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  36.32 
 
 		 1043 aa  625  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0771  heavy metal efflux pump, CzcA family  33.66 
 
 		 1020 aa  624  1e-177  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.166724  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3843  CzcA family heavy metal efflux protein  36.18 
 
 		 1070 aa  625  1e-177  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.591686  normal  0.830088 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  36.91 
 
 		 1062 aa  625  1e-177  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3868  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA (cation efflux system protein CzcA)  35.33 
 
 		 1044 aa  623  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  35.46 
 
 		 1063 aa  624  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4682  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.79 
 
 		 1049 aa  625  1e-177  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.439534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0556  CzcA family heavy metal efflux protein  35.93 
 
 		 1076 aa  620  1e-176  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  36.26 
 
 		 1077 aa  621  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  36.26 
 
 		 1077 aa  622  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  35.48 
 
 		 1047 aa  620  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  37.79 
 
 		 1022 aa  620  1e-176  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3369  CzcA family heavy metal efflux protein  36.09 
 
 		 1060 aa  620  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.957207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4081  CzcA family heavy metal efflux protein  35.86 
 
 		 1082 aa  621  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1716  CzcA family heavy metal efflux protein  35.4 
 
 		 1062 aa  621  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735829 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  36.26 
 
 		 1077 aa  621  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3177  heavy metal efflux pump, CzcA family  35.12 
 
 		 1462 aa  620  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.452268  normal  1 
 
 
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NC_011138  MADE_00374  putative RND efflux system protein  36.64 
 
 		 1035 aa  619  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1079  heavy metal efflux pump, CzcA family  37.53 
 
 		 1022 aa  615  1e-175  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0885781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  36.01 
 
 		 1075 aa  619  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_011138  MADE_02034  Heavy metal efflux pump CzcA  34.96 
 
 		 1069 aa  617  1e-175  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  36.16 
 
 		 1077 aa  616  1e-175  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
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NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  35.95 
 
 		 1070 aa  618  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  36.04 
 
 		 1070 aa  619  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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