More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_4375 on replicon NC_010678
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008061  Bcen_4684  heavy metal efflux pump CzcA  39.9 
 
 		 1070 aa  715    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3586  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  38.75 
 
 		 1062 aa  662    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0830  CzcA family heavy metal efflux protein  40.52 
 
 		 1034 aa  751    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0011  heavy metal efflux pump CzcA  39.81 
 
 		 1077 aa  713    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.649062  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2135  CzcA family heavy metal efflux protein  40.33 
 
 		 1034 aa  720    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0043  CzcA family cobalt/zinc/cadmium efflux transporter permease  39.33 
 
 		 1053 aa  726    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.815586  hitchhiker  0.00000942954 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2410  cobalt-zinc-cadmium resistance protein CzcA  40.23 
 
 		 1048 aa  707    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.90909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1181  heavy metal efflux pump CzcA  39.81 
 
 		 1077 aa  713    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.263304  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3951  CzcA family heavy metal efflux protein  47.24 
 
 		 1017 aa  914    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0978  CzcA family heavy metal efflux protein  40.33 
 
 		 1021 aa  657    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1239  CzcA family heavy metal efflux protein  42.3 
 
 		 1032 aa  694    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1298  CzcA family heavy metal efflux protein  41.79 
 
 		 1033 aa  740    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3188  CzcA family heavy metal efflux protein  39.96 
 
 		 1066 aa  658    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1680  CzcA family heavy metal efflux protein  64.81 
 
 		 1042 aa  1261    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2720  CzcA family heavy metal efflux protein  57.78 
 
 		 1016 aa  1114    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.541366  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00409  putative cation efflux system transmembrane protein  43.39 
 
 		 1049 aa  709    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0305789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1440  heavy metal efflux pump CzcA  39.81 
 
 		 1077 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4066  CzcA family heavy metal efflux protein  47.04 
 
 		 1017 aa  912    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0493  cation efflux system transmembrane protein  40.61 
 
 		 1064 aa  722    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1943  cation efflux system protein CzcA  46.39 
 
 		 1024 aa  895    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.166034  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1177  CzcA family heavy metal efflux protein  40.98 
 
 		 1048 aa  712    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2867  CzcA family heavy metal efflux protein  38.66 
 
 		 1066 aa  652    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.212232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0520  CzcA family heavy metal efflux protein  39.63 
 
 		 1075 aa  670    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0375  cation efflux family protein  39.16 
 
 		 1053 aa  720    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1029  heavy metal efflux pump CzcA  39.72 
 
 		 1077 aa  711    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0434658  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2371  HelA protein  39.94 
 
 		 1049 aa  736    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1046  HelA protein  39.94 
 
 		 1052 aa  728    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4803  heavy metal efflux pump CzcA  39.01 
 
 		 1054 aa  717    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.791013  decreased coverage  0.00147418 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0296  heavy metal efflux pump CzcA  40.37 
 
 		 1036 aa  645    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.100092  normal  0.521043 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1178  heavy metal efflux pump CzcA  40.16 
 
 		 1033 aa  654    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.659175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2506  CzcA family heavy metal efflux protein  39 
 
 		 1054 aa  705    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.213687  normal  0.043274 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2252  heavy metal efflux pump CzcA  39.07 
 
 		 1032 aa  658    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3679  CzcA family heavy metal efflux protein  39.9 
 
 		 1070 aa  715    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0973587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2626  heavy metal efflux pump CzcA  38.97 
 
 		 1032 aa  656    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.516302 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2801  heavy metal efflux pump CzcA  57.95 
 
 		 1028 aa  1052    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.702528  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0478  CzcA family heavy metal efflux protein  39.25 
 
 		 1068 aa  654    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3804  heavy metal efflux pump CzcA  42.28 
 
 		 1038 aa  681    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.314763  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3968  heavy metal efflux pump CzcA  40.15 
 
 		 1075 aa  714    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.108456  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5655  heavy metal efflux pump CzcA  89.49 
 
 		 1037 aa  1768    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.657207  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0143  heavy metal efflux pump CzcA  57.67 
 
 		 1023 aa  1011    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.609125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1327  heavy metal efflux pump CzcA  39.73 
 
 		 1059 aa  703    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.808518  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3887  heavy metal efflux pump, CzcA family protein  47.16 
 
 		 1017 aa  923    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3341  CzcA family heavy metal efflux protein  39.49 
 
 		 1075 aa  657    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4384  CzcA family heavy metal efflux protein  38.24 
 
 		 1047 aa  640    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.55849  normal  0.35087 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0031  heavy metal efflux pump CzcA  39.92 
 
 		 1077 aa  712    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399372  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0153  heavy metal efflux pump  40.67 
 
 		 1045 aa  697    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1340  heavy metal efflux pump  37.45 
 
 		 1047 aa  651    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197837  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1418  heavy metal efflux pump  39.23 
 
 		 1062 aa  666    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.765902  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0099  CzcA family heavy metal efflux protein  47.75 
 
 		 1017 aa  942    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3621  heavy metal efflux pump CzcA  39.08 
 
 		 1050 aa  717    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.099788  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2431  CzcA family heavy metal efflux protein  40 
 
 		 1070 aa  720    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0225  CzcA family heavy metal efflux protein  37.38 
 
 		 1040 aa  652    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3509  heavy metal efflux pump CzcA  40.43 
 
 		 1034 aa  734    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0008  heavy metal efflux pump CzcA  54.44 
 
 		 1028 aa  1070    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1428  heavy metal efflux pump CzcA  38.89 
 
 		 1065 aa  682    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.905049  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1856  heavy metal efflux pump CzcA  38.5 
 
 		 1064 aa  656    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2095  heavy metal efflux pump CzcA  38.01 
 
 		 1037 aa  650    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.31475  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2011  heavy metal efflux pump CzcA  48 
 
 		 1021 aa  997    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1113  heavy metal efflux pump CzcA  40.08 
 
 		 1040 aa  709    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4154  CzcA family heavy metal efflux protein  38.79 
 
 		 1046 aa  648    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.36883 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1639  heavy metal efflux pump CzcA  38.72 
 
 		 1019 aa  676    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.550101  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3360  CzcA family heavy metal efflux protein  39.92 
 
 		 1032 aa  750    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.159877  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1375  heavy metal efflux pump CzcA  39.83 
 
 		 1077 aa  702    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1020  heavy metal efflux pump CzcA  41.58 
 
 		 1022 aa  674    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3858  CzcA family heavy metal efflux protein  47.24 
 
 		 1017 aa  914    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0161  copper transport protein  35.25 
 
 		 1456 aa  654    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.68268 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4294  heavy metal efflux pump CzcA  56.69 
 
 		 1026 aa  1076    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.200453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1968  CzcA family heavy metal efflux protein  37.34 
 
 		 1040 aa  669    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126074  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  39.89 
 
 		 1070 aa  671    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1955  cation efflux system protein  37.36 
 
 		 1043 aa  668    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.180895  normal  0.172462 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3768  Co/Zn/Cd efflux system membrane component  37.57 
 
 		 1038 aa  659    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.799569 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3513  CzcA family heavy metal efflux protein  39.62 
 
 		 1070 aa  669    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0504  heavy metal efflux pump CzcA  39.96 
 
 		 1031 aa  716    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2337  CzcA family heavy metal efflux protein  40.25 
 
 		 1046 aa  694    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.0037806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2551  heavy metal efflux pump CzcA  36.83 
 
 		 1040 aa  668    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2566  heavy metal efflux pump CzcA  40.08 
 
 		 1046 aa  693    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.609364 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1525  CzcA family heavy metal efflux protein  39.81 
 
 		 1077 aa  715    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0707  RND heavy metal efflux pump, CzcA subunit  39.09 
 
 		 1083 aa  703    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.768299  normal  0.553477 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6240  putative cation efflux system protein  55.53 
 
 		 1025 aa  1014    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2144  heavy metal efflux pump CzcA  39.09 
 
 		 1070 aa  672    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.212316 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1512  cation efflux protein  35.36 
 
 		 1455 aa  678    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.631882  normal  0.42011 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3341  heavy metal efflux pump CzcA  39.66 
 
 		 1070 aa  686    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3646  heavy metal efflux pump CzcA  38.51 
 
 		 1056 aa  654    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4188  heavy metal efflux pump CzcA  56.3 
 
 		 1026 aa  1083    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.809737 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31010  putative cation efflux system protein  38.94 
 
 		 1045 aa  638    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000160016  unclonable  6.07631e-21 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0401  heavy metal efflux pump CzcA  39.81 
 
 		 1077 aa  713    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4533  heavy metal efflux pump CzcA  38.93 
 
 		 1069 aa  682    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1850  heavy metal efflux pump CzcA  37.89 
 
 		 1072 aa  642    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.252043  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2569  heavy metal efflux pump CzcA  38.69 
 
 		 1078 aa  642    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.819785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1889  heavy metal efflux pump CzcA  36.98 
 
 		 1079 aa  650    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.921811  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5980  heavy metal resistance protein CzcA  39.04 
 
 		 1063 aa  694    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000345716  normal  0.120659 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1849  CzcA family heavy metal efflux protein  38.36 
 
 		 1062 aa  672    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.188693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3356  CzcA family heavy metal efflux protein  39.25 
 
 		 1076 aa  650    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0717317  decreased coverage  0.000585076 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3011  heavy metal efflux pump CzcA  54.79 
 
 		 1009 aa  895    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0135257 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4123  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmyA  41.93 
 
 		 1023 aa  704    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4468  heavy metal cation tricomponent efflux pump HmuA  40.29 
 
 		 1043 aa  719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.186725  normal  0.0193618 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2358  RND OM permease  41.31 
 
 		 1061 aa  674    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.650016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0518  CzcA family heavy metal efflux protein  39.53 
 
 		 1070 aa  666    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2319  CzcA family heavy metal efflux protein  40 
 
 		 1035 aa  646    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3766  CzcA family heavy metal efflux protein  47.84 
 
 		 1017 aa  910    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>