199 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_1709 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_1709  hypothetical protein  100 
 
 		 688 aa  1368    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2396  hypothetical protein  42.98 
 
 		 724 aa  531  1e-149  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.92908 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0159  hypothetical protein  36.39 
 
 		 706 aa  457  1e-127  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  32.51 
 
 		 695 aa  343  7e-93  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1480  hypothetical protein  32.27 
 
 		 701 aa  330  5.0000000000000004e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0156637  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1909  hypothetical protein  30.61 
 
 		 692 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00515667  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  27.96 
 
 		 684 aa  294  3e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0356  hypothetical protein  28.99 
 
 		 685 aa  228  4e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.31 
 
 		 764 aa  79.3  0.0000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  24.56 
 
 		 380 aa  73.6  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  23.38 
 
 		 732 aa  72.4  0.00000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  20.54 
 
 		 704 aa  68.6  0.0000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  23.42 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  29.75 
 
 		 385 aa  65.5  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  27.09 
 
 		 729 aa  64.3  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4509  MMPL domain protein  22.65 
 
 		 723 aa  64.7  0.000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0507667  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27410  predicted RND superfamily drug exporter  24.16 
 
 		 737 aa  63.9  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.113093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  29.11 
 
 		 385 aa  63.5  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  24.59 
 
 		 893 aa  62.8  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  21.19 
 
 		 758 aa  63.2  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  25.5 
 
 		 1028 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  24.86 
 
 		 1040 aa  63.2  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  24.86 
 
 		 681 aa  62.8  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  24.24 
 
 		 1013 aa  62.4  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  20.88 
 
 		 778 aa  61.2  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7072  MMPL domain protein  24.04 
 
 		 710 aa  60.8  0.00000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.369607  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3572  MMPL domain protein  22.97 
 
 		 743 aa  60.1  0.0000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.817752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3645  MMPL domain-containing protein  20.85 
 
 		 781 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.197426 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  28.57 
 
 		 388 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  28.68 
 
 		 906 aa  58.5  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  24.19 
 
 		 799 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1601  MMPL domain protein  25.87 
 
 		 779 aa  58.2  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.760044  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  24.6 
 
 		 799 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  29.9 
 
 		 864 aa  58.2  0.0000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  26.61 
 
 		 890 aa  57.8  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1195  MMPL domain protein  20.35 
 
 		 741 aa  57.4  0.0000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1045  hypothetical protein  23.15 
 
 		 740 aa  57.4  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0306113 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  25.07 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  23.76 
 
 		 799 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  22.75 
 
 		 749 aa  57  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  22.63 
 
 		 730 aa  56.6  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1227  MMPL  24.63 
 
 		 814 aa  57.4  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0482  MMPL domain protein  20.93 
 
 		 909 aa  56.6  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  24.21 
 
 		 799 aa  57  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1977  hypothetical protein  22.22 
 
 		 750 aa  57  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.144238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  25.98 
 
 		 713 aa  56.6  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  20.96 
 
 		 920 aa  55.8  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10208  transmembrane transport protein mmpL3  23.38 
 
 		 944 aa  55.5  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0021573  normal  0.454475 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  24.58 
 
 		 974 aa  55.1  0.000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  22.06 
 
 		 764 aa  55.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2953  membrane protein, MmpL family  25.34 
 
 		 1038 aa  55.5  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.305637  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  22.58 
 
 		 745 aa  55.1  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  24.35 
 
 		 1089 aa  54.7  0.000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  21.22 
 
 		 811 aa  54.7  0.000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  22.61 
 
 		 753 aa  54.7  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2900  MMPL domain-containing protein  24.52 
 
 		 1003 aa  54.3  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.689966  normal  0.0696558 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2574  MMPL domain-containing protein  19.04 
 
 		 829 aa  54.3  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2628  MMPL domain-containing protein  19.04 
 
 		 829 aa  54.3  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.971864  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  25.35 
 
 		 981 aa  53.9  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3234  MMPL  22.86 
 
 		 836 aa  53.5  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.520088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  24.03 
 
 		 1093 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  25.22 
 
 		 1022 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1512  MMPL domain-containing protein  22.05 
 
 		 713 aa  53.5  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.625812  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  24.03 
 
 		 1093 aa  53.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  25.22 
 
 		 1022 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  21.99 
 
 		 752 aa  53.9  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  24.88 
 
 		 796 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.99 
 
 		 1045 aa  53.1  0.00002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.73 
 
 		 747 aa  52.8  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4002  putative transporter  20.51 
 
 		 730 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000986471 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  27.89 
 
 		 874 aa  53.1  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3628  MMPL domain protein  23.6 
 
 		 737 aa  53.1  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0204  MMPL domain protein  22.46 
 
 		 776 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  22.26 
 
 		 807 aa  52  0.00003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0456  RND superfamily drug efflux protein  23.89 
 
 		 1110 aa  52.4  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.850885 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  21.66 
 
 		 893 aa  52  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  21.41 
 
 		 800 aa  51.6  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1342  putative transporter  20.51 
 
 		 730 aa  52  0.00004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.487554  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.65 
 
 		 746 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15430  predicted RND superfamily drug exporter  23.55 
 
 		 733 aa  52  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.023361  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  21.31 
 
 		 717 aa  52  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  27.52 
 
 		 832 aa  51.6  0.00005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0464  MmpL11  22.07 
 
 		 978 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.01751  normal  0.274602 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10456  transmembrane transport protein mmpL4  22.5 
 
 		 967 aa  51.6  0.00005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.66 
 
 		 895 aa  51.2  0.00006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  28.23 
 
 		 790 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  28.23 
 
 		 793 aa  51.2  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  21.62 
 
 		 748 aa  51.2  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  23.11 
 
 		 576 aa  50.8  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  31.82 
 
 		 792 aa  51.2  0.00007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  26.62 
 
 		 862 aa  51.2  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  27.42 
 
 		 794 aa  50.8  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0196  large membrane protein  23.49 
 
 		 1013 aa  50.8  0.00009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1445  integral membrane protein, putative  27.84 
 
 		 493 aa  50.4  0.0001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.431426  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1204  transporter  20.73 
 
 		 730 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1182  transporter  20.22 
 
 		 730 aa  50.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1302  transporter  20.73 
 
 		 730 aa  50.1  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.94 
 
 		 756 aa  50.4  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1380  putative transporter  20.73 
 
 		 730 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.032742 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  28.16 
 
 		 787 aa  50.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>