136 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0159 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0159  hypothetical protein  100 
 
 
706 aa  1423    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1709  hypothetical protein  36.39 
 
 
688 aa  481  1e-134  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2396  hypothetical protein  41.12 
 
 
724 aa  474  1e-132  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.92908 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1480  hypothetical protein  27.95 
 
 
701 aa  307  4.0000000000000004e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0156637  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  27.14 
 
 
695 aa  299  1e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1909  hypothetical protein  25.73 
 
 
692 aa  287  4e-76  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00515667  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  27.25 
 
 
684 aa  283  7.000000000000001e-75  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0356  hypothetical protein  27.87 
 
 
685 aa  249  2e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  22.96 
 
 
730 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  25.78 
 
 
1013 aa  72.8  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4632  MMPL domain-containing protein  26.09 
 
 
681 aa  71.6  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.839502 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  25.19 
 
 
699 aa  70.5  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0312  MMPL domain-containing protein  25.49 
 
 
1028 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4042  MMPL domain-containing protein  23.03 
 
 
735 aa  70.5  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.087579 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4595  MMPL domain-containing protein  25.84 
 
 
1040 aa  69.3  0.0000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0308  MMPL domain protein  22.77 
 
 
717 aa  67.8  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.123677 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4841  MMPL  24.36 
 
 
1022 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0784394  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4929  MMPL domain-containing protein  24.36 
 
 
1022 aa  65.9  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.559096  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0225  MMPL domain-containing protein  24.29 
 
 
745 aa  63.5  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.196903  normal  0.86442 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  18.73 
 
 
764 aa  63.2  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.92 
 
 
746 aa  62  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3618  MMPL domain-containing protein  23.57 
 
 
712 aa  61.2  0.00000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2627  MMPL domain protein  27.97 
 
 
701 aa  61.2  0.00000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.606801  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4247  MMPL domain-containing protein  25.23 
 
 
726 aa  60.5  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0552437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0905  MMPL domain protein  23.89 
 
 
713 aa  60.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6559  MMPL domain protein  23.7 
 
 
735 aa  60.1  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.559545  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3665  MMPL domain-containing protein  21.96 
 
 
735 aa  57.4  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  23.67 
 
 
709 aa  56.6  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1120  putative integral membrane protein  23.08 
 
 
854 aa  56.2  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.310464 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  21.45 
 
 
752 aa  55.8  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1143  hypothetical protein  20.76 
 
 
704 aa  55.5  0.000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6559  drug exporter of the RND superfamily-like protein  29.01 
 
 
812 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00116362 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  23.87 
 
 
385 aa  55.5  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3833  transport protein  26.77 
 
 
944 aa  55.1  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2011  acriflavin resistance protein  27.03 
 
 
1060 aa  55.1  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0404797 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2393  MMPL domain protein  25.76 
 
 
714 aa  54.7  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0143938  decreased coverage  0.00201251 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  25.64 
 
 
874 aa  54.7  0.000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3750  MMPL domain protein  23.4 
 
 
737 aa  54.3  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01000  RND family efflux transporter  24.07 
 
 
1044 aa  53.5  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.703446  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1271  MMPL domain protein  25.54 
 
 
747 aa  52.8  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.017354 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0030  acriflavin resistance protein  26.79 
 
 
1027 aa  53.1  0.00002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0439457  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2790  hypothetical protein  22.91 
 
 
729 aa  53.1  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00546434  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0308  MMPL domain protein  23.63 
 
 
740 aa  52.8  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.968834  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  21.43 
 
 
981 aa  52  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3095  AcrB/AcrD/AcrF family protein  22 
 
 
1093 aa  52.4  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.396369  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1049  MMPL domain protein  23.78 
 
 
723 aa  52  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.700963  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  20.99 
 
 
752 aa  51.6  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0967  MMPL domain protein  24.2 
 
 
576 aa  51.6  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.100325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4975  MMPL domain protein  30.17 
 
 
682 aa  51.6  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0669  AcrB/AcrD/AcrF family cation efflux protein  25.45 
 
 
1052 aa  51.2  0.00006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  21.2 
 
 
748 aa  51.2  0.00007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1710  acriflavin resistance protein  24.32 
 
 
1060 aa  50.4  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0432348  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  27.44 
 
 
755 aa  50.4  0.0001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2920  MMPL domain-containing protein  22.24 
 
 
706 aa  50.4  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2177  acriflavin resistance protein  23.18 
 
 
1057 aa  50.4  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.754609  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0818  MMPL domain protein  24.41 
 
 
1054 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  21.47 
 
 
893 aa  49.7  0.0002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4242  MMPL domain-containing protein  23.6 
 
 
842 aa  49.3  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.348233  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  26.25 
 
 
385 aa  49.7  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11207  transmembrane transport protein mmpL10  24.11 
 
 
1002 aa  49.7  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0221  RND efflux transporter  23.77 
 
 
771 aa  49.3  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.822518  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  28.3 
 
 
388 aa  49.3  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2662  MMPL domain protein  22.72 
 
 
749 aa  49.3  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2021  acriflavin resistance protein  29.21 
 
 
1038 aa  49.7  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.86587  normal  0.343149 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2469  acriflavin resistance protein  24 
 
 
1073 aa  49.3  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.969761  normal  0.0970954 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  26.4 
 
 
879 aa  49.7  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37330  predicted RND superfamily drug exporter  24.44 
 
 
699 aa  49.3  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.366571 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6822  integral membrane protein  23.87 
 
 
741 aa  48.9  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3125  transport protein  26.1 
 
 
1077 aa  48.9  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  26.88 
 
 
385 aa  48.9  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  23.77 
 
 
849 aa  48.9  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  20.13 
 
 
974 aa  48.5  0.0004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0586  MMPL domain protein  24.5 
 
 
778 aa  48.5  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.291824  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.06 
 
 
1172 aa  48.5  0.0005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  21.24 
 
 
824 aa  48.1  0.0005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2166  acriflavin resistance protein  24 
 
 
1060 aa  48.1  0.0005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0800  acriflavin resistance protein  22.94 
 
 
1048 aa  48.1  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  21.67 
 
 
767 aa  48.1  0.0005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20.36 
 
 
756 aa  48.1  0.0005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0888  acriflavin resistance protein  22.58 
 
 
1055 aa  48.1  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.869514 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3812  MMPL domain-containing protein  27.18 
 
 
753 aa  47.8  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.443864  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  20.31 
 
 
1226 aa  47.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15720  predicted RND superfamily drug exporter  22.15 
 
 
920 aa  47.8  0.0007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.448336  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  26.4 
 
 
862 aa  47.4  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  24.77 
 
 
777 aa  47.4  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19760  predicted RND superfamily drug exporter  25.44 
 
 
732 aa  47.8  0.0008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4864  acriflavin resistance protein  26.49 
 
 
1034 aa  47  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.120441 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2384  AcrB/AcrD/AcrF family protein  24.73 
 
 
1060 aa  46.6  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.668736  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4071  hydrophobe/amphiphile efflux-1 HAE1  27.87 
 
 
1055 aa  47  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.702974  normal  0.202748 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1311  MMPL domain protein  23.76 
 
 
773 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.610628  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  24.86 
 
 
380 aa  47  0.001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4044  queuine tRNA-ribosyltransferase  26.72 
 
 
1382 aa  47  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3114  transport protein  23.54 
 
 
1062 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.927661  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60830  multidrug efflux RND transporter MexD  27.23 
 
 
1043 aa  46.6  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.503401  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1895  acriflavin resistance protein  24.82 
 
 
1051 aa  46.2  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.691491  normal  0.309208 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3174  transport protein  23.54 
 
 
1062 aa  46.2  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1563  acriflavin resistance protein  25.42 
 
 
1041 aa  46.2  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03981  acriflavin resistance protein D  21.32 
 
 
1082 aa  46.6  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3690  acriflavin resistance protein  21.21 
 
 
1077 aa  46.2  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.440679  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3338  acriflavin resistance protein  22.05 
 
 
1067 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>