More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BbuZS7_0258 on replicon NC_011728
Organism: Borrelia burgdorferi ZS7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  100 
 
 
767 aa  1490    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.82 
 
 
764 aa  191  4e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.53 
 
 
1051 aa  168  4e-40  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  23.19 
 
 
755 aa  159  2e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  23.71 
 
 
807 aa  155  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  21.56 
 
 
815 aa  150  1.0000000000000001e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  25.04 
 
 
727 aa  148  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  23.49 
 
 
779 aa  147  5e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  23.23 
 
 
801 aa  144  5e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  23.08 
 
 
811 aa  137  7.000000000000001e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.43 
 
 
807 aa  136  9.999999999999999e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  21.46 
 
 
768 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  21.44 
 
 
778 aa  136  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  25.55 
 
 
692 aa  134  5e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  21.46 
 
 
800 aa  134  7.999999999999999e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  22.79 
 
 
771 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  21.76 
 
 
808 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  22.45 
 
 
771 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  22.45 
 
 
771 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  25.65 
 
 
898 aa  132  3e-29  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  23.19 
 
 
771 aa  130  8.000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  21.05 
 
 
772 aa  127  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  21.05 
 
 
835 aa  128  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  22.09 
 
 
816 aa  126  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  24.28 
 
 
821 aa  127  1e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  25 
 
 
800 aa  125  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  20.22 
 
 
792 aa  125  3e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  24.33 
 
 
821 aa  125  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  21.23 
 
 
767 aa  124  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  24.7 
 
 
694 aa  124  6e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  25.76 
 
 
1083 aa  124  7e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4865  RND efflux transporter  20.75 
 
 
786 aa  124  8e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.743305  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  22.03 
 
 
771 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2196  hypothetical protein  21.7 
 
 
771 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.233357  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2441  hypothetical protein  22.03 
 
 
771 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  22.03 
 
 
771 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  21.91 
 
 
771 aa  122  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  20.41 
 
 
923 aa  122  3e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.59 
 
 
773 aa  121  3.9999999999999996e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  22.39 
 
 
813 aa  120  7e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  20.69 
 
 
825 aa  119  1.9999999999999998e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  22.72 
 
 
1359 aa  119  3e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  25.31 
 
 
823 aa  119  3e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  20.2 
 
 
771 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  20.63 
 
 
808 aa  118  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  20.87 
 
 
881 aa  117  6e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  23.8 
 
 
905 aa  115  2.0000000000000002e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  18.96 
 
 
790 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  20.77 
 
 
770 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  21.74 
 
 
767 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  18.83 
 
 
779 aa  115  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  21.73 
 
 
824 aa  115  4.0000000000000004e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  21.99 
 
 
769 aa  114  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  21.75 
 
 
768 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  21.91 
 
 
869 aa  111  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  21.03 
 
 
764 aa  111  4.0000000000000004e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  24.79 
 
 
823 aa  111  5e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  24.18 
 
 
689 aa  111  6e-23  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  21.44 
 
 
1011 aa  110  8.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  25.12 
 
 
823 aa  110  1e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  19.95 
 
 
787 aa  110  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  23.6 
 
 
788 aa  110  1e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  24.23 
 
 
694 aa  109  2e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  21.74 
 
 
869 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  19.9 
 
 
792 aa  108  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.18 
 
 
837 aa  107  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.65 
 
 
803 aa  107  9e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  17.93 
 
 
788 aa  106  1e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  18.73 
 
 
795 aa  105  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  18.37 
 
 
756 aa  104  5e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  22.51 
 
 
748 aa  103  8e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  21.51 
 
 
789 aa  102  2e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  23.89 
 
 
828 aa  102  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  18.64 
 
 
797 aa  103  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.61 
 
 
812 aa  102  3e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  21.95 
 
 
778 aa  102  3e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  23.43 
 
 
815 aa  101  4e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  20.08 
 
 
772 aa  101  7e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  18.99 
 
 
791 aa  99.4  2e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  24.18 
 
 
804 aa  99.8  2e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  19.58 
 
 
877 aa  97.8  7e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  20.98 
 
 
796 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  18.14 
 
 
794 aa  96.7  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  19.34 
 
 
804 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  21.02 
 
 
790 aa  96.3  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  18.16 
 
 
799 aa  96.3  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  19.12 
 
 
784 aa  95.1  4e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  20.92 
 
 
793 aa  94.7  6e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  18.18 
 
 
751 aa  94  8e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  17.7 
 
 
799 aa  94  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  20.57 
 
 
786 aa  92.4  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  35.33 
 
 
861 aa  92.8  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  18.39 
 
 
806 aa  91.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  21.07 
 
 
674 aa  90.9  8e-17  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  20.71 
 
 
674 aa  90.5  9e-17  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  19.2 
 
 
752 aa  90.1  1e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  22.04 
 
 
816 aa  90.1  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  20.61 
 
 
872 aa  89.4  2e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  20.25 
 
 
784 aa  89.7  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  20.58 
 
 
794 aa  89.4  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>