176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1742 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  45.6 
 
 		 816 aa  701    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  100 
 
 		 824 aa  1656    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  45.28 
 
 		 828 aa  697    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  47.36 
 
 		 815 aa  714    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  44.64 
 
 		 813 aa  705    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  45.24 
 
 		 821 aa  710    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  45.65 
 
 		 835 aa  724    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  40.79 
 
 		 872 aa  615  9.999999999999999e-175  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  40.05 
 
 		 821 aa  601  1e-170  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  39.92 
 
 		 825 aa  582  1.0000000000000001e-165  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  41.18 
 
 		 823 aa  574  1.0000000000000001e-162  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  40.68 
 
 		 823 aa  569  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  40.65 
 
 		 823 aa  570  1e-161  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  35.58 
 
 		 859 aa  512  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  31.55 
 
 		 807 aa  422  1e-117  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  31.57 
 
 		 800 aa  391  1e-107  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  22.88 
 
 		 755 aa  164  9e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.53 
 
 		 807 aa  157  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  22.43 
 
 		 815 aa  157  8e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.13 
 
 		 764 aa  154  8.999999999999999e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  26.07 
 
 		 756 aa  149  1.0000000000000001e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  21.75 
 
 		 778 aa  143  9.999999999999999e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  23.62 
 
 		 788 aa  134  5e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.25 
 
 		 837 aa  132  2.0000000000000002e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  21.43 
 
 		 808 aa  132  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  23.09 
 
 		 788 aa  132  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  22.07 
 
 		 801 aa  130  8.000000000000001e-29  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.36 
 
 		 773 aa  130  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.95 
 
 		 967 aa  124  6e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  26.15 
 
 		 751 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  22.37 
 
 		 789 aa  121  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  22.26 
 
 		 806 aa  120  9e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  24.52 
 
 		 763 aa  120  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  22.61 
 
 		 800 aa  117  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  21.44 
 
 		 779 aa  113  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.97 
 
 		 1051 aa  113  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  21.05 
 
 		 860 aa  111  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  21.42 
 
 		 767 aa  110  9.000000000000001e-23  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  19.72 
 
 		 792 aa  108  3e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  21.19 
 
 		 811 aa  105  4e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  21.05 
 
 		 865 aa  105  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.99 
 
 		 762 aa  104  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  21.65 
 
 		 881 aa  103  9e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  23.35 
 
 		 804 aa  98.2  6e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  22.31 
 
 		 898 aa  97.1  1e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.2 
 
 		 831 aa  95.1  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.55 
 
 		 803 aa  94.4  7e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  27.34 
 
 		 905 aa  93.6  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  20.03 
 
 		 764 aa  90.9  9e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  23.33 
 
 		 692 aa  87.8  8e-16  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  21.68 
 
 		 1083 aa  84.7  0.000000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  21.63 
 
 		 791 aa  83.6  0.00000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.15 
 
 		 717 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  20.1 
 
 		 788 aa  82.4  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  20.27 
 
 		 796 aa  81.3  0.00000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  20.61 
 
 		 789 aa  80.1  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  21.65 
 
 		 869 aa  79.3  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  20.65 
 
 		 792 aa  78.2  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  20.71 
 
 		 788 aa  77.8  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  20.07 
 
 		 797 aa  77  0.000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  21.5 
 
 		 869 aa  77.4  0.000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  21.42 
 
 		 789 aa  75.9  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  21.19 
 
 		 1204 aa  75.5  0.000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  23.57 
 
 		 694 aa  73.9  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2963  putative membrane transporter  19.85 
 
 		 785 aa  71.2  0.00000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.581109 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  22 
 
 		 385 aa  69.7  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  19.26 
 
 		 748 aa  68.6  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  19.62 
 
 		 779 aa  68.6  0.0000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  21.77 
 
 		 765 aa  68.6  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  22.86 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.78 
 
 		 758 aa  67.8  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  21.59 
 
 		 778 aa  67.8  0.0000000008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  20.95 
 
 		 755 aa  66.6  0.000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  23.2 
 
 		 1011 aa  65.5  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  22.8 
 
 		 877 aa  64.3  0.000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  21.13 
 
 		 752 aa  63.2  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  22.57 
 
 		 385 aa  62.8  0.00000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  21.95 
 
 		 861 aa  62.8  0.00000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.9 
 
 		 776 aa  62.4  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  27.17 
 
 		 790 aa  61.2  0.00000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  26.73 
 
 		 872 aa  61.2  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  25.58 
 
 		 887 aa  60.8  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.12 
 
 		 883 aa  60.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  20.06 
 
 		 797 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2562  RND efflux transporter  24.51 
 
 		 697 aa  58.5  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  20.42 
 
 		 752 aa  58.5  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  21.13 
 
 		 674 aa  57.8  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  24.88 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  28.8 
 
 		 879 aa  57.4  0.0000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  21.6 
 
 		 747 aa  57  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  18.77 
 
 		 1359 aa  57.4  0.000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  27.49 
 
 		 832 aa  57.4  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0528  RND superfamily transporter  20.22 
 
 		 789 aa  57.4  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.760184 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  21.1 
 
 		 727 aa  56.2  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  24.22 
 
 		 842 aa  55.8  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3168  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.03 
 
 		 723 aa  56.2  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.210013  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  21.79 
 
 		 388 aa  55.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  17.49 
 
 		 784 aa  55.1  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  33.05 
 
 		 380 aa  55.1  0.000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2688  RND superfamily transporter  21.02 
 
 		 787 aa  55.1  0.000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>