More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2865 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  65.17 
 
 		 895 aa  905    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  60.41 
 
 		 1131 aa  1162    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  43.52 
 
 		 1109 aa  761    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  51.15 
 
 		 1204 aa  898    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  100 
 
 		 1011 aa  2006    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  40.73 
 
 		 862 aa  541  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  41.43 
 
 		 855 aa  528  1e-148  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  36.96 
 
 		 874 aa  500  1e-140  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3322  exporter of the RND superfamily protein-like protein  40.66 
 
 		 872 aa  496  9.999999999999999e-139  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  41.75 
 
 		 862 aa  486  1e-135  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  34.01 
 
 		 805 aa  391  1e-107  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  40.59 
 
 		 842 aa  368  1e-100  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  33.81 
 
 		 1359 aa  332  2e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  36.92 
 
 		 879 aa  317  9e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.43238 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  32.54 
 
 		 923 aa  305  3.0000000000000004e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2608  exporter of the RND superfamily protein  34.55 
 
 		 860 aa  304  4.0000000000000003e-81  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0269848  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  31.67 
 
 		 832 aa  303  1e-80  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  25.04 
 
 		 764 aa  186  2.0000000000000003e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  25.24 
 
 		 752 aa  138  6.0000000000000005e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  25.68 
 
 		 778 aa  134  6e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  23.94 
 
 		 748 aa  131  7.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  22.58 
 
 		 747 aa  127  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  22.87 
 
 		 755 aa  123  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.28 
 
 		 756 aa  119  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  24.29 
 
 		 812 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  24.3 
 
 		 872 aa  118  6e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  22.09 
 
 		 864 aa  117  8.999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  25.32 
 
 		 752 aa  115  5e-24  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  24.96 
 
 		 758 aa  113  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  27.11 
 
 		 380 aa  108  4e-22  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  22.8 
 
 		 755 aa  107  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  20.71 
 
 		 1051 aa  105  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  21.68 
 
 		 807 aa  102  5e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  21.3 
 
 		 767 aa  99  4e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  21.48 
 
 		 816 aa  97.8  9e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  32.42 
 
 		 388 aa  95.9  4e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  26.63 
 
 		 385 aa  95.1  5e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  21.04 
 
 		 808 aa  94.7  7e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.19 
 
 		 837 aa  91.7  7e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  30.77 
 
 		 385 aa  90.5  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  30.22 
 
 		 385 aa  89.4  3e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  21.3 
 
 		 815 aa  84.3  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  19.9 
 
 		 778 aa  84  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  20.03 
 
 		 821 aa  84.3  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  31.51 
 
 		 777 aa  82.4  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  32.18 
 
 		 905 aa  80.5  0.0000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  22.11 
 
 		 811 aa  80.9  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  23.55 
 
 		 1083 aa  79.7  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  32.12 
 
 		 387 aa  80.5  0.0000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  22.38 
 
 		 890 aa  77.8  0.0000000000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  23.83 
 
 		 792 aa  77.8  0.0000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  30.28 
 
 		 746 aa  76.3  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  24.68 
 
 		 898 aa  75.5  0.000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  26.01 
 
 		 835 aa  75.5  0.000000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  20.95 
 
 		 789 aa  75.1  0.000000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  27.67 
 
 		 777 aa  73.9  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  31.29 
 
 		 861 aa  73.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  19.77 
 
 		 813 aa  73.2  0.00000000003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  30.41 
 
 		 806 aa  72.8  0.00000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  22.71 
 
 		 824 aa  72.8  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  21.89 
 
 		 815 aa  72.4  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.17 
 
 		 882 aa  72  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  21.17 
 
 		 821 aa  72  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  25.43 
 
 		 800 aa  71.2  0.00000000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  22.87 
 
 		 849 aa  70.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  23.64 
 
 		 825 aa  69.7  0.0000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  30.43 
 
 		 804 aa  69.3  0.0000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  30.41 
 
 		 798 aa  69.7  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  19.16 
 
 		 788 aa  68.6  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  23.1 
 
 		 792 aa  68.9  0.0000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  33.65 
 
 		 921 aa  68.2  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.87 
 
 		 882 aa  67.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.38 
 
 		 886 aa  67.8  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  21.35 
 
 		 727 aa  66.6  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  20.04 
 
 		 828 aa  67  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  26.35 
 
 		 859 aa  66.2  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  20.5 
 
 		 800 aa  65.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  24.34 
 
 		 881 aa  65.9  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  30.66 
 
 		 845 aa  64.7  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.9 
 
 		 831 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  34.31 
 
 		 839 aa  63.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.14 
 
 		 1291 aa  63.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  25.77 
 
 		 865 aa  62.8  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  23 
 
 		 768 aa  62.8  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  31.32 
 
 		 901 aa  62.4  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  21.89 
 
 		 796 aa  62.4  0.00000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  21.44 
 
 		 808 aa  62  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  33.33 
 
 		 889 aa  61.6  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  29.28 
 
 		 869 aa  61.2  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  21.96 
 
 		 796 aa  60.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  29.75 
 
 		 869 aa  61.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  25.34 
 
 		 860 aa  61.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  30.8 
 
 		 1013 aa  60.8  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  21.34 
 
 		 779 aa  60.1  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  25.57 
 
 		 803 aa  60.1  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.1 
 
 		 895 aa  60.5  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.75 
 
 		 882 aa  59.7  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.48 
 
 		 1045 aa  59.3  0.0000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  30.34 
 
 		 821 aa  58.9  0.0000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.07 
 
 		 864 aa  58.5  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>