More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_1961 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  48.34 
 
 		 756 aa  726    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  45.53 
 
 		 747 aa  705    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  100 
 
 		 758 aa  1540    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  46.51 
 
 		 746 aa  667    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  46.14 
 
 		 777 aa  665    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  45.48 
 
 		 777 aa  648    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  57.99 
 
 		 752 aa  912    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  42.78 
 
 		 752 aa  629  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  34.9 
 
 		 748 aa  451  1e-125  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  32.77 
 
 		 778 aa  421  1e-116  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  33.2 
 
 		 812 aa  406  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  32.18 
 
 		 755 aa  396  1e-109  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  32.17 
 
 		 864 aa  296  8e-79  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  23.54 
 
 		 865 aa  187  7e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4453  RND efflux transporter  26.83 
 
 		 889 aa  179  2e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2964  hypothetical protein  25.18 
 
 		 687 aa  178  4e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2999  MMPL domain-containing protein  24.63 
 
 		 821 aa  174  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1628  RND superfamily protein-like exporter  27.07 
 
 		 921 aa  150  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.221009 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  26.49 
 
 		 385 aa  144  5e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  27.2 
 
 		 385 aa  142  3e-32  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  26.22 
 
 		 385 aa  137  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.15 
 
 		 764 aa  135  3e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  25.96 
 
 		 388 aa  132  3e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  22.46 
 
 		 1359 aa  120  7.999999999999999e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  25.89 
 
 		 380 aa  117  6e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  27.94 
 
 		 387 aa  117  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  23.43 
 
 		 895 aa  109  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  24.53 
 
 		 1051 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  23.6 
 
 		 923 aa  100  9e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  21.48 
 
 		 755 aa  100  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  22.26 
 
 		 805 aa  96.3  2e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  22.02 
 
 		 831 aa  87.4  0.000000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.98 
 
 		 807 aa  86.7  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6781  RND efflux transporter  20.92 
 
 		 799 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1668  Patched family protein  22.1 
 
 		 842 aa  80.9  0.00000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  19.2 
 
 		 773 aa  80.1  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  20.16 
 
 		 756 aa  80.1  0.0000000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  21.67 
 
 		 786 aa  77.4  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  31.37 
 
 		 1011 aa  77  0.000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  30.67 
 
 		 1131 aa  77  0.000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  21.99 
 
 		 905 aa  76.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  20.71 
 
 		 779 aa  76.3  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  24.16 
 
 		 835 aa  74.7  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  20.92 
 
 		 771 aa  74.3  0.000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  27.22 
 
 		 1204 aa  74.7  0.000000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  21.39 
 
 		 786 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  18.95 
 
 		 784 aa  74.3  0.000000000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  22.76 
 
 		 816 aa  73.9  0.000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  22.78 
 
 		 861 aa  73.6  0.00000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  20.05 
 
 		 778 aa  72.8  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  22.01 
 
 		 786 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  22.01 
 
 		 786 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  21.11 
 
 		 787 aa  72  0.00000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  19.48 
 
 		 815 aa  71.2  0.00000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  23.68 
 
 		 794 aa  71.2  0.00000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  21.44 
 
 		 767 aa  70.9  0.00000000008  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  24.45 
 
 		 799 aa  70.9  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  30.16 
 
 		 1109 aa  70.5  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  20 
 
 		 772 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  24.83 
 
 		 981 aa  70.1  0.0000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  24.14 
 
 		 799 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  22.46 
 
 		 826 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  24.14 
 
 		 799 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  21.85 
 
 		 786 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  21.86 
 
 		 786 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  23.87 
 
 		 832 aa  69.3  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  20.4 
 
 		 684 aa  68.9  0.0000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  20.71 
 
 		 797 aa  68.6  0.0000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  21.98 
 
 		 695 aa  68.6  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  20.41 
 
 		 771 aa  68.2  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  27.7 
 
 		 874 aa  67.8  0.0000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  22.69 
 
 		 795 aa  67.4  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2280  MMPL domain protein  20.35 
 
 		 758 aa  66.6  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.871082  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.22 
 
 		 1045 aa  66.6  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  20.35 
 
 		 813 aa  66.6  0.000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  24.91 
 
 		 974 aa  65.9  0.000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  27.56 
 
 		 845 aa  66.6  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  24 
 
 		 974 aa  66.2  0.000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  27.69 
 
 		 709 aa  66.6  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  22.98 
 
 		 796 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  24.72 
 
 		 825 aa  65.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  20.45 
 
 		 771 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  20.45 
 
 		 771 aa  65.9  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  22.32 
 
 		 787 aa  65.5  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  20.98 
 
 		 824 aa  65.1  0.000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  18.61 
 
 		 821 aa  65.5  0.000000004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.16 
 
 		 808 aa  64.7  0.000000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  23.2 
 
 		 799 aa  64.7  0.000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2554  hypothetical protein  21.2 
 
 		 771 aa  64.3  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0631379  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  25.53 
 
 		 799 aa  64.3  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  21.18 
 
 		 796 aa  64.3  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  20.53 
 
 		 972 aa  64.3  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  25.64 
 
 		 1011 aa  63.9  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  23.06 
 
 		 784 aa  63.2  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  22.43 
 
 		 820 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2434  hypothetical protein  21.03 
 
 		 771 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.338411  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2809  transporter, putative  22.73 
 
 		 821 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0254275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1910  hypothetical protein  21.03 
 
 		 771 aa  62.8  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0338156  normal  0.0625477 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  22.3 
 
 		 767 aa  62.4  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  20.48 
 
 		 768 aa  62.4  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>