238 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0588 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  100 
 
 
815 aa  1656    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  45.38 
 
 
823 aa  679    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  78.26 
 
 
816 aa  1321    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  45.1 
 
 
823 aa  682    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  43.14 
 
 
828 aa  654    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  54.29 
 
 
813 aa  864    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  58.97 
 
 
821 aa  952    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  48.77 
 
 
821 aa  753    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  45.25 
 
 
823 aa  681    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  47.86 
 
 
824 aa  731    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  42.98 
 
 
835 aa  635  1e-180  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  40.13 
 
 
825 aa  565  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  39.73 
 
 
872 aa  555  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  36.82 
 
 
859 aa  520  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  32.31 
 
 
807 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  30.53 
 
 
800 aa  399  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  23.71 
 
 
778 aa  196  2e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  22.29 
 
 
755 aa  192  2e-47  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  22.05 
 
 
764 aa  176  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  21.62 
 
 
815 aa  159  1e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  22.39 
 
 
773 aa  153  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  21.71 
 
 
808 aa  147  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.48 
 
 
807 aa  145  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  23.22 
 
 
788 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  21.5 
 
 
865 aa  134  1.0000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.78 
 
 
1051 aa  130  8.000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.84 
 
 
831 aa  130  9.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.48 
 
 
967 aa  129  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  21.14 
 
 
756 aa  127  7e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  21.2 
 
 
788 aa  126  1e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.05 
 
 
837 aa  124  8e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  21.95 
 
 
806 aa  120  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  21.24 
 
 
800 aa  117  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  21.96 
 
 
801 aa  116  2.0000000000000002e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  22.18 
 
 
811 aa  115  2.0000000000000002e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  20.9 
 
 
1083 aa  115  4.0000000000000004e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  21.01 
 
 
860 aa  115  4.0000000000000004e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  22.73 
 
 
792 aa  115  5e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  21.05 
 
 
779 aa  112  2.0000000000000002e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  23.02 
 
 
803 aa  110  7.000000000000001e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4267  putative RND superfamily transporter  21.66 
 
 
789 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  21.62 
 
 
877 aa  109  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  22.03 
 
 
751 aa  106  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  22.84 
 
 
778 aa  104  5e-21  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  22.83 
 
 
767 aa  104  6e-21  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  20.54 
 
 
764 aa  102  2e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  24.73 
 
 
763 aa  102  3e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  22.26 
 
 
804 aa  102  4e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.2 
 
 
762 aa  100  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  22.09 
 
 
898 aa  98.6  4e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  22.08 
 
 
789 aa  98.2  5e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  21.04 
 
 
905 aa  93.2  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  21.01 
 
 
1204 aa  92.4  3e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  21.18 
 
 
748 aa  91.7  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  20.8 
 
 
788 aa  91.3  7e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  21.53 
 
 
1011 aa  90.5  1e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  20.85 
 
 
788 aa  90.1  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.31 
 
 
717 aa  90.1  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  19.24 
 
 
881 aa  89  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  24.15 
 
 
380 aa  87  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1714  RND superfamily transporter  22.14 
 
 
789 aa  86.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0904131 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.07 
 
 
747 aa  85.5  0.000000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  23.75 
 
 
385 aa  84.7  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  23.73 
 
 
1359 aa  82.8  0.00000000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  20.82 
 
 
694 aa  83.2  0.00000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  19.62 
 
 
779 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  21.43 
 
 
694 aa  80.9  0.00000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  22.61 
 
 
385 aa  80.5  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  21.7 
 
 
869 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0077  putative membrane transporter  20.15 
 
 
797 aa  80.1  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.273508 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  19.42 
 
 
746 aa  79.7  0.0000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2275  RND superfamily transporter  20.55 
 
 
797 aa  78.2  0.0000000000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.857443  normal  0.323939 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  21.42 
 
 
869 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  23.11 
 
 
385 aa  77  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  20.6 
 
 
752 aa  75.1  0.000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  28.3 
 
 
862 aa  74.7  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  19.27 
 
 
755 aa  74.7  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  23.5 
 
 
771 aa  74.7  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  26.39 
 
 
832 aa  74.3  0.000000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  22.71 
 
 
388 aa  73.2  0.00000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  18.89 
 
 
799 aa  73.2  0.00000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  25 
 
 
972 aa  71.6  0.00000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  20 
 
 
777 aa  70.9  0.00000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  27.62 
 
 
864 aa  70.5  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1961  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  21.23 
 
 
758 aa  70.5  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2562  RND efflux transporter  25.76 
 
 
697 aa  70.5  0.0000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.143404  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  20.29 
 
 
674 aa  70.5  0.0000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  23.53 
 
 
874 aa  69.3  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  25.35 
 
 
855 aa  69.7  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2061  putative membrane transporter  23.92 
 
 
796 aa  68.9  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  19.4 
 
 
765 aa  68.2  0.0000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  23.08 
 
 
895 aa  68.2  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  19.91 
 
 
752 aa  68.2  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.22 
 
 
776 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  20.99 
 
 
799 aa  65.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2275  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.16 
 
 
812 aa  65.9  0.000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0590834  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  20.03 
 
 
805 aa  66.2  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  27.27 
 
 
923 aa  65.9  0.000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  19.6 
 
 
784 aa  64.7  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2681  hypothetical protein  29.5 
 
 
879 aa  64.7  0.000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.43238 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>