More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA2758 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  100 
 
 		 901 aa  1800    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  38.88 
 
 		 901 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  39.62 
 
 		 890 aa  572  1e-161  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  38.47 
 
 		 884 aa  548  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  35.24 
 
 		 887 aa  475  1e-132  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  34.8 
 
 		 895 aa  451  1e-125  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  33.82 
 
 		 882 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  33.82 
 
 		 882 aa  446  1e-123  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  33.41 
 
 		 882 aa  444  1e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  34.55 
 
 		 882 aa  435  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  35.83 
 
 		 767 aa  436  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  33.49 
 
 		 862 aa  430  1e-119  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  35.41 
 
 		 889 aa  429  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  35.44 
 
 		 864 aa  419  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  33.72 
 
 		 868 aa  420  1e-116  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3246  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  35.49 
 
 		 882 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689074 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1777  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  36.1 
 
 		 900 aa  410  1e-113  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  34.29 
 
 		 872 aa  410  1e-113  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2118  hypothetical protein  36.22 
 
 		 879 aa  409  1.0000000000000001e-112  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  34.06 
 
 		 887 aa  404  1e-111  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  33.73 
 
 		 862 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  34.59 
 
 		 908 aa  390  1e-107  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7033  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  32.73 
 
 		 871 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.642403  decreased coverage  0.0000000105164 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  33.87 
 
 		 868 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3569  hypothetical protein  34.25 
 
 		 868 aa  384  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  33.52 
 
 		 871 aa  382  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  32.24 
 
 		 870 aa  380  1e-104  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  33.22 
 
 		 969 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3151  hypothetical protein  33.45 
 
 		 877 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5501  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  33.67 
 
 		 877 aa  357  3.9999999999999996e-97  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921684  normal  0.0209878 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1119  hypothetical protein  33.11 
 
 		 1083 aa  357  6.999999999999999e-97  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.143143  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3264  hypothetical protein  33.33 
 
 		 877 aa  356  1e-96  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2091  hypothetical protein  33.11 
 
 		 1079 aa  356  1e-96  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109662  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1399  hypothetical protein  33.33 
 
 		 877 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3184  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  33.18 
 
 		 877 aa  355  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2383  hypothetical protein  33.33 
 
 		 877 aa  355  2e-96  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4948  RND efflux transporter  33.56 
 
 		 877 aa  355  2e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  34.17 
 
 		 669 aa  354  4e-96  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4559  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  33.22 
 
 		 877 aa  350  8e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.151597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5183  RND efflux transporter  33.07 
 
 		 877 aa  349  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5676  RND efflux transporter  33.07 
 
 		 877 aa  349  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293298 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  29.68 
 
 		 892 aa  346  1e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2350  hypothetical protein  33.56 
 
 		 877 aa  345  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  29.39 
 
 		 1128 aa  343  9e-93  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4905  hypothetical protein  33.82 
 
 		 877 aa  342  2e-92  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35717  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  29.63 
 
 		 920 aa  337  7.999999999999999e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1044  RND efflux transporter  34.17 
 
 		 858 aa  335  2e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0022  RND efflux transporter  32.73 
 
 		 877 aa  335  2e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.94 
 
 		 886 aa  327  7e-88  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  30.85 
 
 		 899 aa  325  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.91 
 
 		 883 aa  322  1.9999999999999998e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20740  hypothetical protein  32.75 
 
 		 864 aa  321  3.9999999999999996e-86  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751381  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.64 
 
 		 883 aa  318  2e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  27.32 
 
 		 972 aa  256  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  27.66 
 
 		 893 aa  253  1e-65  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  26.14 
 
 		 910 aa  248  4e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.22 
 
 		 1045 aa  194  7e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  26.07 
 
 		 906 aa  143  1.9999999999999998e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  30.54 
 
 		 845 aa  98.2  6e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  32.97 
 
 		 849 aa  92  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  24.92 
 
 		 895 aa  91.3  7e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20.07 
 
 		 806 aa  83.6  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  28.32 
 
 		 380 aa  80.9  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  30.36 
 
 		 388 aa  79  0.0000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  19.94 
 
 		 1172 aa  78.6  0.0000000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  30.26 
 
 		 843 aa  75.5  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4274  exporters of the RND superfamily  24.09 
 
 		 846 aa  74.3  0.000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  25.41 
 
 		 840 aa  74.7  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  27.34 
 
 		 839 aa  73.6  0.00000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  32.58 
 
 		 862 aa  72  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  31.15 
 
 		 1011 aa  70.9  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  33.59 
 
 		 1225 aa  70.1  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  26.07 
 
 		 923 aa  70.1  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  29.61 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  28.57 
 
 		 385 aa  68.2  0.0000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  29.46 
 
 		 1359 aa  67.4  0.000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  29.59 
 
 		 855 aa  67.4  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  23.11 
 
 		 808 aa  67  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  29.74 
 
 		 1131 aa  67.4  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  27.12 
 
 		 847 aa  66.6  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  28.57 
 
 		 385 aa  66.2  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4143  RND efflux transporter  24.51 
 
 		 840 aa  65.9  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0331  hypothetical protein  22.92 
 
 		 835 aa  65.5  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  21.35 
 
 		 825 aa  63.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  26.28 
 
 		 709 aa  63.9  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  29.19 
 
 		 1204 aa  63.5  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  22.37 
 
 		 695 aa  62.4  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  24.06 
 
 		 831 aa  62.4  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  28.63 
 
 		 832 aa  62  0.00000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2949  putative membrane protein, MmpL family  23.73 
 
 		 888 aa  61.6  0.00000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.4025e-34 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0333  hypothetical protein  22.79 
 
 		 840 aa  61.2  0.00000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  34.31 
 
 		 782 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0437  hypothetical protein  22.35 
 
 		 813 aa  60.5  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  26.06 
 
 		 773 aa  60.1  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.63 
 
 		 762 aa  60.5  0.0000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  27.75 
 
 		 805 aa  59.3  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11555  transmembrane transport protein mmpL12  22.73 
 
 		 1146 aa  59.3  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.03 
 
 		 1226 aa  58.9  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  27.94 
 
 		 755 aa  58.9  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0668  drug exporter of the RND superfamily-like protein  25.11 
 
 		 796 aa  58.9  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>