More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1152 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  100 
 
 		 692 aa  1370    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  41.52 
 
 		 694 aa  546  1e-154  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  42.84 
 
 		 694 aa  545  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  37.39 
 
 		 727 aa  470  1.0000000000000001e-131  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  24.54 
 
 		 764 aa  141  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  23.39 
 
 		 674 aa  139  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  23.47 
 
 		 674 aa  130  7.000000000000001e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1522  RND efflux transporter  26.01 
 
 		 669 aa  125  4e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.707162  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  24.56 
 
 		 767 aa  122  1.9999999999999998e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  23 
 
 		 689 aa  116  1.0000000000000001e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  24.55 
 
 		 815 aa  112  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  32.99 
 
 		 905 aa  101  4e-20  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  21.57 
 
 		 1051 aa  96.3  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  24.01 
 
 		 755 aa  96.3  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  21.93 
 
 		 835 aa  92  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  23.12 
 
 		 824 aa  92  3e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  29.07 
 
 		 898 aa  90.1  1e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.79 
 
 		 837 aa  89.4  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  22.66 
 
 		 811 aa  89.4  2e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  21.46 
 
 		 784 aa  86.3  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  24.02 
 
 		 813 aa  86.3  0.000000000000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  19.72 
 
 		 792 aa  85.9  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  24.9 
 
 		 779 aa  85.1  0.000000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  22.31 
 
 		 821 aa  85.1  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  19.85 
 
 		 799 aa  84  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  23.09 
 
 		 764 aa  83.6  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  21.01 
 
 		 794 aa  84  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  20.57 
 
 		 800 aa  83.2  0.00000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  22.39 
 
 		 807 aa  82  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  21.65 
 
 		 784 aa  81.6  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  25.85 
 
 		 821 aa  81.3  0.00000000000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  19.29 
 
 		 799 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  18.99 
 
 		 799 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  20.85 
 
 		 796 aa  80.1  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  27.68 
 
 		 380 aa  79.7  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0867  HAE1 family efflux transporter  22.76 
 
 		 778 aa  79.3  0.0000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  19.29 
 
 		 799 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  19.96 
 
 		 796 aa  78.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  20.43 
 
 		 756 aa  78.2  0.0000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  20.15 
 
 		 790 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  20.15 
 
 		 793 aa  78.2  0.0000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  24.31 
 
 		 823 aa  77.8  0.0000000000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  21.94 
 
 		 816 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  21.72 
 
 		 789 aa  76.3  0.000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  23.61 
 
 		 1083 aa  76.3  0.000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  21.36 
 
 		 788 aa  76.3  0.000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  21.58 
 
 		 828 aa  76.3  0.000000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  29.13 
 
 		 860 aa  75.5  0.000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  28.88 
 
 		 865 aa  75.1  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.72 
 
 		 807 aa  75.1  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  24.64 
 
 		 387 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  19.96 
 
 		 816 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  22.05 
 
 		 803 aa  74.7  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  21.57 
 
 		 808 aa  75.1  0.000000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  23.91 
 
 		 823 aa  74.3  0.000000000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  23.91 
 
 		 823 aa  73.9  0.000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  22.91 
 
 		 864 aa  73.2  0.00000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  27.75 
 
 		 874 aa  73.6  0.00000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  23.35 
 
 		 787 aa  73.6  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3142  transporter, putative  20.08 
 
 		 799 aa  72.4  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  26.7 
 
 		 762 aa  72.4  0.00000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  26.15 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  27.23 
 
 		 831 aa  71.6  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  25.64 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  23.08 
 
 		 861 aa  71.6  0.00000000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  20.45 
 
 		 385 aa  71.2  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  28.97 
 
 		 859 aa  71.2  0.00000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  29.19 
 
 		 872 aa  69.7  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  20.97 
 
 		 751 aa  68.9  0.0000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  21.3 
 
 		 787 aa  67.4  0.0000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  28.57 
 
 		 862 aa  67.4  0.000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  23.17 
 
 		 797 aa  66.6  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  23.27 
 
 		 799 aa  67  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  21.16 
 
 		 747 aa  66.6  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  20.43 
 
 		 788 aa  66.6  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  21.14 
 
 		 763 aa  65.9  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3579  RND superfamily transporter  20.11 
 
 		 788 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.900215  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3202  transporter, putative  19.25 
 
 		 826 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.320198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  19.62 
 
 		 771 aa  65.5  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  25.14 
 
 		 877 aa  65.5  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  22.89 
 
 		 804 aa  65.1  0.000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  23.72 
 
 		 773 aa  64.7  0.000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1720  RND superfamily transporter  19.76 
 
 		 788 aa  64.3  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.362573  normal  0.170717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  20.47 
 
 		 778 aa  63.9  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  20.89 
 
 		 765 aa  63.5  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  17.54 
 
 		 786 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  18.53 
 
 		 786 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  19.81 
 
 		 834 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  19.19 
 
 		 768 aa  63.2  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  32.39 
 
 		 779 aa  63.5  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  20 
 
 		 795 aa  63.5  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  27.04 
 
 		 855 aa  63.2  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  18.73 
 
 		 786 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  18.73 
 
 		 786 aa  63.2  0.00000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  19.36 
 
 		 808 aa  62.4  0.00000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  25 
 
 		 792 aa  63.2  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6390  transporter, putative  18.4 
 
 		 786 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.191266  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1728  hypothetical protein  18.8 
 
 		 769 aa  62.4  0.00000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  25.91 
 
 		 815 aa  61.2  0.00000005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  19.54 
 
 		 771 aa  61.2  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>