212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpet_0110 on replicon NC_009486
Organism: Thermotoga petrophila RKU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  94.36 
 
 		 674 aa  1254    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  100 
 
 		 674 aa  1337    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1522  RND efflux transporter  49.02 
 
 		 669 aa  592  1e-168  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.707162  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  40.76 
 
 		 689 aa  469  1.0000000000000001e-131  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  24.29 
 
 		 694 aa  168  2.9999999999999998e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  24.64 
 
 		 764 aa  153  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  23.26 
 
 		 694 aa  147  5e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  23.32 
 
 		 727 aa  134  7.999999999999999e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  23.47 
 
 		 692 aa  126  1e-27  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2060  hypothetical protein  22.69 
 
 		 790 aa  104  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137629  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24330  hypothetical protein  22.18 
 
 		 793 aa  102  3e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.507248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  23.31 
 
 		 755 aa  99.8  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2935  Patched family protein  23.01 
 
 		 784 aa  97.4  8e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3777  hypothetical protein  21.3 
 
 		 796 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  21.4 
 
 		 767 aa  94  9e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1701  hypothetical protein  21.88 
 
 		 796 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.49055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3229  hypothetical protein  23.27 
 
 		 794 aa  92  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0514277  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  22.18 
 
 		 799 aa  90.1  1e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3723  RND efflux transporter  21.14 
 
 		 799 aa  89  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2064  RND efflux transporter  21.08 
 
 		 795 aa  89  3e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1551  hypothetical protein  20.67 
 
 		 799 aa  87.4  7e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  21.58 
 
 		 756 aa  87  0.000000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  21.33 
 
 		 799 aa  87  0.000000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  21.34 
 
 		 767 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.16 
 
 		 807 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  20.71 
 
 		 1051 aa  82.4  0.00000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  22.38 
 
 		 763 aa  80.5  0.0000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  22.07 
 
 		 808 aa  79.7  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  21.63 
 
 		 764 aa  79  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  21.91 
 
 		 772 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  24.17 
 
 		 905 aa  75.9  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  27.32 
 
 		 385 aa  75.5  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  27.45 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  27.18 
 
 		 385 aa  75.1  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  21.32 
 
 		 860 aa  75.1  0.000000000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  20.84 
 
 		 768 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  20.73 
 
 		 821 aa  74.7  0.000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2222  hypothetical protein  20.28 
 
 		 768 aa  74.7  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  22.13 
 
 		 751 aa  74.3  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  32.26 
 
 		 792 aa  74.3  0.000000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  23.15 
 
 		 828 aa  73.2  0.00000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1808  hypothetical protein  21.09 
 
 		 767 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  20.06 
 
 		 778 aa  72.4  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  25.28 
 
 		 380 aa  71.2  0.00000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  26.01 
 
 		 898 aa  71.2  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  26.7 
 
 		 388 aa  70.9  0.00000000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  25.15 
 
 		 695 aa  70.9  0.00000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  22.99 
 
 		 811 aa  70.9  0.00000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1940  RND efflux transporter  23.49 
 
 		 877 aa  70.5  0.00000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  19.81 
 
 		 808 aa  70.5  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  20.99 
 
 		 823 aa  70.5  0.00000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  20.93 
 
 		 815 aa  70.5  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  21.21 
 
 		 825 aa  70.1  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  20.99 
 
 		 823 aa  69.7  0.0000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3429  hypothetical protein  18.5 
 
 		 787 aa  68.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  23.54 
 
 		 792 aa  68.9  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  21.14 
 
 		 800 aa  68.2  0.0000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  19.25 
 
 		 784 aa  67.8  0.0000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  21.29 
 
 		 770 aa  67.4  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2001  hypothetical protein  20.08 
 
 		 771 aa  66.6  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  17.98 
 
 		 881 aa  65.9  0.000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  20 
 
 		 799 aa  65.5  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0113  MMPL domain-containing protein  21 
 
 		 865 aa  65.1  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.382745  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  20.54 
 
 		 823 aa  64.3  0.000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2594  hypothetical protein  20.95 
 
 		 771 aa  64.7  0.000000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  21.8 
 
 		 820 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  25.99 
 
 		 790 aa  63.9  0.000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  23.61 
 
 		 800 aa  63.5  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.58 
 
 		 967 aa  63.2  0.00000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  21.55 
 
 		 865 aa  62.4  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0356  hypothetical protein  25.62 
 
 		 685 aa  62  0.00000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  20.03 
 
 		 747 aa  61.6  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  22.22 
 
 		 815 aa  61.6  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  25.53 
 
 		 791 aa  61.6  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  21.29 
 
 		 807 aa  61.6  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  20.11 
 
 		 796 aa  61.2  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2971  RND efflux transporter  20.31 
 
 		 797 aa  61.2  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1480  hypothetical protein  21.98 
 
 		 701 aa  61.2  0.00000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0156637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1534  RND superfamily exporter  20.12 
 
 		 787 aa  61.2  0.00000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0360223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10910  predicted RND superfamily drug exporter  22.01 
 
 		 728 aa  60.8  0.00000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0552916  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  20.97 
 
 		 847 aa  60.8  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2812  transporter, putative  21.15 
 
 		 804 aa  60.5  0.00000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.796656  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  21.19 
 
 		 779 aa  60.5  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1909  hypothetical protein  23.13 
 
 		 692 aa  60.1  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00515667  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0645  RND family transporter  22.25 
 
 		 834 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0103634  normal  0.324813 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2006  RND superfamily exporter  20.92 
 
 		 794 aa  59.3  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.882933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  19.51 
 
 		 816 aa  58.9  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  27.01 
 
 		 797 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  24.77 
 
 		 895 aa  58.9  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.4 
 
 		 837 aa  58.5  0.0000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  24.28 
 
 		 874 aa  58.5  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  25.83 
 
 		 387 aa  57.8  0.0000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1784  hypothetical protein  20.85 
 
 		 771 aa  57.8  0.0000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.455314  normal  0.263872 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.67 
 
 		 773 aa  57.8  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1679  hypothetical protein  21.12 
 
 		 771 aa  57.8  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.980542  normal  0.247829 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1754  hypothetical protein  21.12 
 
 		 771 aa  57.8  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0558079  normal  0.523278 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  29.38 
 
 		 849 aa  57  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  21.66 
 
 		 748 aa  57  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  23.37 
 
 		 861 aa  55.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  20 
 
 		 806 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>