More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0632 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0632  RND efflux transporter  100 
 
 		 763 aa  1505    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510967  normal  0.17381 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1526  RND efflux transporter  43.52 
 
 		 756 aa  588  1e-166  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0154  RND efflux transporter  43.16 
 
 		 751 aa  534  1e-150  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  29.72 
 
 		 755 aa  286  1.0000000000000001e-75  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1317  RND efflux transporter  24.14 
 
 		 778 aa  205  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.00469095  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  29.52 
 
 		 807 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  24.18 
 
 		 764 aa  192  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  23.55 
 
 		 789 aa  191  4e-47  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003709  predicted exporter of the RND superfamily  25.24 
 
 		 792 aa  188  3e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1652  hypothetical protein  23.9 
 
 		 779 aa  182  2.9999999999999997e-44  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0699635  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0392  exporter of the RND superfamily protein-like protein  23.65 
 
 		 837 aa  181  4e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0677  RND efflux transporter  25.27 
 
 		 811 aa  169  2e-40  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1180  hypothetical protein  23.64 
 
 		 801 aa  168  2.9999999999999998e-40  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  24.93 
 
 		 800 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0540  hypothetical protein  22.87 
 
 		 764 aa  156  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3675  membrane protein  20.03 
 
 		 808 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  21.39 
 
 		 815 aa  145  3e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2986  RND efflux transporter  22.3 
 
 		 1051 aa  142  3e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.594238  normal  0.491222 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  25.18 
 
 		 824 aa  140  7e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3357  putative integral membrane protein  26.12 
 
 		 872 aa  140  7.999999999999999e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.42147  normal  0.0868518 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  22.19 
 
 		 1083 aa  138  4e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1021  exporter of the RND superfamily protein-like protein  25.95 
 
 		 762 aa  137  5e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.119734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  23.64 
 
 		 835 aa  136  1.9999999999999998e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  22.73 
 
 		 831 aa  135  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  21.04 
 
 		 806 aa  133  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1117  hypothetical protein  22.61 
 
 		 765 aa  132  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.103936  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  25.65 
 
 		 807 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0562  hypothetical protein  25.91 
 
 		 800 aa  131  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593707  normal  0.20774 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  26.03 
 
 		 825 aa  129  1.0000000000000001e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1281  resistance-nodulation-cell division family transporter  24.84 
 
 		 828 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.338562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  21.69 
 
 		 967 aa  129  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2200  hypothetical protein  21.38 
 
 		 816 aa  127  1e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  23 
 
 		 797 aa  125  3e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1279  hypothetical protein  21.07 
 
 		 821 aa  125  3e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0588  hypothetical protein  25.09 
 
 		 815 aa  125  4e-27  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0321  putative integral membrane protein  21.05 
 
 		 813 aa  121  4.9999999999999996e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.322021  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  20.81 
 
 		 773 aa  121  6e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0367  putative integral membrane protein  23.73 
 
 		 821 aa  119  9.999999999999999e-26  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1024  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0943  RND efflux transporter  24.45 
 
 		 791 aa  117  6e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0581  RND efflux transporter  20.66 
 
 		 788 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.843516  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1805  Patched family protein  21.27 
 
 		 804 aa  114  7.000000000000001e-24  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.732433  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3230  hypothetical protein  24.03 
 
 		 808 aa  111  6e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2467  RND efflux transporter  22.8 
 
 		 792 aa  110  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.022945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1519  putative integral membrane protein  22.09 
 
 		 859 aa  109  2e-22  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.430265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1018  MMPL domain-containing protein  23.51 
 
 		 861 aa  108  3e-22  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00165976  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3164  hypothetical protein  22.81 
 
 		 784 aa  104  5e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.330305  normal  0.727475 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0958  hypothetical protein  23.78 
 
 		 779 aa  103  1e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.764454  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1422  RND efflux transporter  23.7 
 
 		 865 aa  103  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0501757  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3183  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.66 
 
 		 717 aa  102  2e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  23.39 
 
 		 674 aa  101  6e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1350  RND efflux transporter  22.98 
 
 		 790 aa  100  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832069  decreased coverage  0.00000222062 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  20.04 
 
 		 905 aa  99.8  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  21.34 
 
 		 674 aa  99  3e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05360  predicted exporters of the RND superfamily  22.36 
 
 		 727 aa  97.4  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000165826  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0048  integral membrane protein  23.59 
 
 		 788 aa  97.4  8e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0277  hypothetical protein  20.21 
 
 		 823 aa  93.6  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1565  hypothetical protein  20.99 
 
 		 823 aa  93.6  1e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  23.67 
 
 		 385 aa  92.8  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  24.84 
 
 		 385 aa  92  3e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  23.32 
 
 		 820 aa  92.4  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  24.53 
 
 		 385 aa  92  4e-17  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2270  putative transport protein  24.52 
 
 		 799 aa  92  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0857118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1376  hypothetical protein  20.85 
 
 		 823 aa  92  4e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  21.81 
 
 		 752 aa  91.3  6e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  25.78 
 
 		 881 aa  90.5  1e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  23.4 
 
 		 388 aa  89  3e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  22 
 
 		 898 aa  88.2  5e-16  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3778  putative transport protein  22.75 
 
 		 796 aa  87.8  7e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.00000448082  decreased coverage  0.0000696113 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1152  RND efflux transporter  22.28 
 
 		 692 aa  86.7  0.000000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0148359  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6840  RND efflux transporter  20.51 
 
 		 786 aa  85.9  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.172281  normal  0.135262 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  21.3 
 
 		 1359 aa  85.1  0.000000000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  21.2 
 
 		 803 aa  84.7  0.000000000000006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0766  hypothetical protein  22.27 
 
 		 689 aa  83.6  0.00000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.71633  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4359  RND efflux transporter  24.24 
 
 		 786 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2744  RND efflux transporter  26.13 
 
 		 860 aa  82  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.343287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1155  RND efflux transporter  23.3 
 
 		 830 aa  82  0.00000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1591  hypothetical protein  19.67 
 
 		 768 aa  82  0.00000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  25 
 
 		 380 aa  81.6  0.00000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4346  RND efflux transporter  22.75 
 
 		 786 aa  81.3  0.00000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.312397  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2803  hypothetical protein  21.22 
 
 		 772 aa  79.3  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.929153  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2968  RND efflux transporter  20.63 
 
 		 869 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5040  RND efflux transporter  23.59 
 
 		 786 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981854  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5820  RND efflux transporter  23.59 
 
 		 786 aa  78.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4435  transporter, putative  21 
 
 		 786 aa  78.2  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.565976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  18.29 
 
 		 755 aa  78.2  0.0000000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4325  transporter, putative  21 
 
 		 786 aa  78.2  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0993317 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2787  transporter, putative  20.27 
 
 		 869 aa  78.2  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0297  hypothetical protein  23.04 
 
 		 387 aa  78.2  0.0000000000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.981573  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2477  hypothetical protein  22.16 
 
 		 772 aa  77.8  0.0000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0495637  normal  0.0162982 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1486  RND efflux transporter  23.85 
 
 		 694 aa  77.8  0.0000000000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.0030427  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1525  hypothetical protein  23.54 
 
 		 694 aa  77.4  0.0000000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1579  hypothetical protein  20.67 
 
 		 799 aa  77.4  0.0000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.69775  normal  0.0697261 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  21.21 
 
 		 756 aa  77  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0258  hypothetical protein  20.22 
 
 		 767 aa  76.6  0.000000000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.467137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2139  hypothetical protein  21.85 
 
 		 770 aa  76.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.124395 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  23.43 
 
 		 746 aa  75.5  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1941  Patched family protein  20.87 
 
 		 767 aa  75.1  0.000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.314196  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  20.32 
 
 		 752 aa  74.3  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1522  RND efflux transporter  19.35 
 
 		 669 aa  73.9  0.000000000009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.707162  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2019  hypothetical protein  20.43 
 
 		 799 aa  73.2  0.00000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.62058  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>