229 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_2678 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  45.67 
 
 		 882 aa  688    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2091  hypothetical protein  50 
 
 		 1079 aa  750    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109662  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7033  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  51.5 
 
 		 871 aa  801    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.642403  decreased coverage  0.0000000105164 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4905  hypothetical protein  49.42 
 
 		 877 aa  720    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35717  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  87.67 
 
 		 887 aa  1479    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  50.23 
 
 		 969 aa  754    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0022  RND efflux transporter  50.23 
 
 		 877 aa  709    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2350  hypothetical protein  51.27 
 
 		 877 aa  741    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  71.63 
 
 		 868 aa  1162    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  73.54 
 
 		 862 aa  1207    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  51.85 
 
 		 871 aa  790    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3184  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  50.46 
 
 		 877 aa  765    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3569  hypothetical protein  71.86 
 
 		 868 aa  1142    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  100 
 
 		 872 aa  1732    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  49.83 
 
 		 908 aa  756    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5183  RND efflux transporter  50.12 
 
 		 877 aa  737    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  50.52 
 
 		 870 aa  781    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  45.33 
 
 		 895 aa  673    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  47.81 
 
 		 882 aa  712    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  47.63 
 
 		 882 aa  727    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4948  RND efflux transporter  50.58 
 
 		 877 aa  737    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5676  RND efflux transporter  50.12 
 
 		 877 aa  737    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293298 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3246  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  53.43 
 
 		 882 aa  789    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689074 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4559  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  50.4 
 
 		 877 aa  741    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.151597 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5501  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  50.58 
 
 		 877 aa  737    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921684  normal  0.0209878 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  71.74 
 
 		 868 aa  1221    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1119  hypothetical protein  50 
 
 		 1083 aa  752    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.143143  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1399  hypothetical protein  50.35 
 
 		 877 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  72.44 
 
 		 862 aa  1244    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3264  hypothetical protein  50.46 
 
 		 877 aa  751    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  49.88 
 
 		 887 aa  797    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  47.09 
 
 		 882 aa  689    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3151  hypothetical protein  50.58 
 
 		 877 aa  753    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2383  hypothetical protein  50.35 
 
 		 877 aa  749    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  49.3 
 
 		 669 aa  581  1e-164  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  37.75 
 
 		 864 aa  498  1e-139  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  33.79 
 
 		 890 aa  415  1e-114  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20740  hypothetical protein  37.52 
 
 		 864 aa  414  1e-114  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751381  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  33.95 
 
 		 901 aa  411  1e-113  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  33.37 
 
 		 901 aa  411  1e-113  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  34.9 
 
 		 889 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1044  RND efflux transporter  35.9 
 
 		 858 aa  385  1e-105  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  33.57 
 
 		 884 aa  371  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1777  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  34.4 
 
 		 900 aa  362  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2118  hypothetical protein  34.4 
 
 		 879 aa  362  2e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  30.61 
 
 		 767 aa  294  4e-78  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  28.65 
 
 		 1128 aa  279  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.88 
 
 		 886 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  27.18 
 
 		 892 aa  264  4e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  27.71 
 
 		 910 aa  236  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  28.16 
 
 		 899 aa  233  9e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28 
 
 		 883 aa  233  1e-59  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27 
 
 		 883 aa  230  7e-59  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  25.76 
 
 		 920 aa  229  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  26.38 
 
 		 893 aa  219  2e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  26.25 
 
 		 972 aa  211  4e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.04 
 
 		 1045 aa  139  3.0000000000000003e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  23.92 
 
 		 906 aa  121  6e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  25.2 
 
 		 802 aa  81.6  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  35.97 
 
 		 845 aa  79  0.0000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2959  MMPL domain protein  26.69 
 
 		 1011 aa  78.6  0.0000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.301766  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  21.95 
 
 		 831 aa  78.2  0.0000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  18.03 
 
 		 1226 aa  75.1  0.000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  20.88 
 
 		 798 aa  74.3  0.000000000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3055  putative drug efflux pump, RND superfamily  24.52 
 
 		 803 aa  72.8  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.322516 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4143  RND efflux transporter  25 
 
 		 840 aa  71.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4274  exporters of the RND superfamily  25.45 
 
 		 846 aa  71.6  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  25.45 
 
 		 840 aa  71.6  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  21.49 
 
 		 806 aa  68.6  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  30.3 
 
 		 777 aa  67.4  0.000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  30.49 
 
 		 839 aa  65.9  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4286  RND efflux transporter  25.6 
 
 		 845 aa  65.5  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  38.38 
 
 		 782 aa  64.3  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2704  hypothetical protein  26.14 
 
 		 898 aa  63.5  0.00000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  28.48 
 
 		 777 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.06 
 
 		 1172 aa  63.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  23.42 
 
 		 730 aa  63.5  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  28.57 
 
 		 805 aa  62.4  0.00000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  28.81 
 
 		 905 aa  61.6  0.00000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  28.27 
 
 		 1359 aa  61.2  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  30.81 
 
 		 855 aa  61.2  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1742  hypothetical protein  26.73 
 
 		 824 aa  61.2  0.00000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00144404  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  26.03 
 
 		 843 aa  60.8  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  28.29 
 
 		 1204 aa  60.5  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  28.28 
 
 		 835 aa  59.7  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  28.18 
 
 		 1013 aa  60.1  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  28.77 
 
 		 385 aa  59.7  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1480  hypothetical protein  28.36 
 
 		 701 aa  59.7  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0156637  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4082  putative lipoprotein transmembrane  26.26 
 
 		 802 aa  59.3  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3300  exporter of the RND superfamily protein-like protein  18.99 
 
 		 967 aa  59.3  0.0000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107727  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0335  MMPL domain protein  32.43 
 
 		 702 aa  59.3  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.114406 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7115  MMPL domain-containing protein  28.49 
 
 		 699 aa  58.9  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.910736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  29.41 
 
 		 380 aa  58.9  0.0000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  28.51 
 
 		 800 aa  58.5  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  24.7 
 
 		 764 aa  58.5  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  27.14 
 
 		 1287 aa  58.2  0.0000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4241  MMPL domain protein  28.5 
 
 		 709 aa  58.2  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.682094  normal  0.157718 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  34.26 
 
 		 847 aa  58.2  0.0000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3607  putative lipoprotein transmembrane  32.85 
 
 		 803 aa  57.8  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0731  acriflavin resistance protein  24.93 
 
 		 1013 aa  57.4  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.693134 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>