176 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4133 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_7033  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  78.37 
 
 		 871 aa  1308    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.642403  decreased coverage  0.0000000105164 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3246  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  48.44 
 
 		 882 aa  699    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689074 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2091  hypothetical protein  70.38 
 
 		 1079 aa  1137    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109662  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  46.1 
 
 		 882 aa  682    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4905  hypothetical protein  59.52 
 
 		 877 aa  936    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35717  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  49.42 
 
 		 887 aa  771    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  70.49 
 
 		 969 aa  1141    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0022  RND efflux transporter  70.26 
 
 		 877 aa  1090    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  100 
 
 		 870 aa  1735    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4559  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  69.46 
 
 		 877 aa  1133    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.151597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2350  hypothetical protein  70.84 
 
 		 877 aa  1138    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  50 
 
 		 868 aa  747    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  50.29 
 
 		 862 aa  769    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  79.17 
 
 		 871 aa  1290    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3569  hypothetical protein  50.98 
 
 		 868 aa  732    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  50.64 
 
 		 872 aa  776    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  57.88 
 
 		 908 aa  946    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5183  RND efflux transporter  69.69 
 
 		 877 aa  1139    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  50.23 
 
 		 868 aa  796    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4948  RND efflux transporter  69.35 
 
 		 877 aa  1128    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5676  RND efflux transporter  69.69 
 
 		 877 aa  1139    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293298 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3184  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  69.35 
 
 		 877 aa  1168    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  45.81 
 
 		 882 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  45.78 
 
 		 887 aa  710    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  44.25 
 
 		 895 aa  638    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1119  hypothetical protein  70.38 
 
 		 1083 aa  1138    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.143143  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1399  hypothetical protein  70.38 
 
 		 877 aa  1139    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3264  hypothetical protein  70.49 
 
 		 877 aa  1143    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3151  hypothetical protein  70.49 
 
 		 877 aa  1142    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2383  hypothetical protein  70.38 
 
 		 877 aa  1139    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  50.4 
 
 		 862 aa  808    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  45.48 
 
 		 882 aa  660    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  45.92 
 
 		 882 aa  660    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5501  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  69.23 
 
 		 877 aa  1125    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921684  normal  0.0209878 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  49.39 
 
 		 669 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  37.38 
 
 		 864 aa  475  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  32.69 
 
 		 901 aa  402  9.999999999999999e-111  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  34.95 
 
 		 889 aa  384  1e-105  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  31.34 
 
 		 890 aa  375  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  32.06 
 
 		 901 aa  372  1e-101  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1044  RND efflux transporter  36.65 
 
 		 858 aa  366  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1777  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  33.45 
 
 		 900 aa  366  1e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2118  hypothetical protein  33.6 
 
 		 879 aa  364  3e-99  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  32.38 
 
 		 884 aa  360  5e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20740  hypothetical protein  36.67 
 
 		 864 aa  359  1.9999999999999998e-97  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751381  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  29.48 
 
 		 767 aa  275  2.0000000000000002e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  25.8 
 
 		 1128 aa  256  1.0000000000000001e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.51 
 
 		 886 aa  254  5.000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  25.6 
 
 		 892 aa  238  3e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  25.64 
 
 		 920 aa  219  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  26.43 
 
 		 899 aa  219  2.9999999999999998e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.41 
 
 		 883 aa  213  1e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.37 
 
 		 883 aa  209  1e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  25.12 
 
 		 910 aa  201  5e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  26.3 
 
 		 893 aa  197  7e-49  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  25.94 
 
 		 972 aa  193  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.49 
 
 		 1045 aa  144  6e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  25.37 
 
 		 906 aa  111  5e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  30.25 
 
 		 845 aa  81.3  0.00000000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  27.36 
 
 		 1204 aa  62.4  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  27.48 
 
 		 1287 aa  62  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  37.37 
 
 		 782 aa  60.8  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3150  RND superfamily protein  25.83 
 
 		 755 aa  60.1  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0817693  normal  0.0240782 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  28.42 
 
 		 849 aa  59.3  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.57 
 
 		 1172 aa  59.3  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.18 
 
 		 1226 aa  58.9  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2330  MMPL domain protein  26.21 
 
 		 730 aa  58.5  0.0000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.949575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  27.7 
 
 		 839 aa  57.8  0.0000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  31.09 
 
 		 1359 aa  57.8  0.0000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_775  membrane protein, MmpL family  24.75 
 
 		 974 aa  57.8  0.0000009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4274  exporters of the RND superfamily  22.94 
 
 		 846 aa  57  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  22.94 
 
 		 840 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0798  hypothetical protein  23.12 
 
 		 784 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0941  hypothetical protein  23.12 
 
 		 784 aa  55.8  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2637  MMPL domain protein  25.23 
 
 		 1013 aa  55.5  0.000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0699  RND superfamily drug exporter  36.67 
 
 		 806 aa  55.5  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1161  Patched family protein  20.77 
 
 		 831 aa  55.1  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  26.6 
 
 		 862 aa  55.1  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  29.85 
 
 		 802 aa  54.7  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  18.49 
 
 		 798 aa  54.7  0.000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  23.14 
 
 		 777 aa  54.7  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  25 
 
 		 1291 aa  54.7  0.000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4143  RND efflux transporter  22.38 
 
 		 840 aa  54.7  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2127  hypothetical protein  25.91 
 
 		 816 aa  54.3  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00224294  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4082  putative lipoprotein transmembrane  30.86 
 
 		 802 aa  54.3  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2006  hypothetical protein  25.32 
 
 		 789 aa  53.5  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000691446  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  29.41 
 
 		 747 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0790  MMPL domain-containing protein  22.97 
 
 		 974 aa  54.3  0.00001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4151  hypothetical protein  29.09 
 
 		 807 aa  53.5  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0333  hypothetical protein  24.07 
 
 		 840 aa  53.1  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  24.66 
 
 		 385 aa  53.5  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0872  MmpL family membrane protein  25 
 
 		 981 aa  52.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0881306  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0437  hypothetical protein  23.81 
 
 		 813 aa  52.8  0.00003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  24.66 
 
 		 385 aa  52.8  0.00003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  27.74 
 
 		 843 aa  52  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  23.97 
 
 		 388 aa  52.4  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1297  hypothetical protein  32.14 
 
 		 380 aa  52  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4286  RND efflux transporter  23.64 
 
 		 845 aa  52.4  0.00004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1701  HAE1 family efflux transporter  26.16 
 
 		 777 aa  52  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.271028  normal  0.950997 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  23.64 
 
 		 806 aa  52.4  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>