205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_20740 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  46.93 
 
 		 864 aa  647    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20740  hypothetical protein  100 
 
 		 864 aa  1701    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.751381  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1044  RND efflux transporter  52.17 
 
 		 858 aa  681    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  39.55 
 
 		 895 aa  525  1e-147  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  38.97 
 
 		 882 aa  524  1e-147  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  38.08 
 
 		 882 aa  520  1e-146  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  38.99 
 
 		 882 aa  508  9.999999999999999e-143  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  39.01 
 
 		 882 aa  504  1e-141  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4254  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  37.9 
 
 		 868 aa  502  1e-140  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0797101  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3246  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  38.35 
 
 		 882 aa  489  1e-137  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.689074 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  36.8 
 
 		 887 aa  487  1e-136  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  36.51 
 
 		 862 aa  481  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2678  hypothetical protein  36.87 
 
 		 872 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4905  hypothetical protein  40.09 
 
 		 877 aa  466  9.999999999999999e-131  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.35717  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2265  hypothetical protein  37.09 
 
 		 887 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.192256 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1730  hypothetical protein  37.32 
 
 		 868 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.047499 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1727  hypothetical protein  37.15 
 
 		 862 aa  464  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0492721 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  38.19 
 
 		 908 aa  464  1e-129  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3569  hypothetical protein  37.53 
 
 		 868 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7033  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  38.28 
 
 		 871 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.642403  decreased coverage  0.0000000105164 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0015  hypothetical protein  38.47 
 
 		 871 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.676074 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  36.71 
 
 		 870 aa  427  1e-118  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  40.94 
 
 		 669 aa  424  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5183  RND efflux transporter  37.38 
 
 		 877 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5676  RND efflux transporter  37.38 
 
 		 877 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293298 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4559  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  37.43 
 
 		 877 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.151597 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3184  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  36.66 
 
 		 877 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.134423 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5501  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  37.73 
 
 		 877 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.921684  normal  0.0209878 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  37.59 
 
 		 969 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4948  RND efflux transporter  37.62 
 
 		 877 aa  404  1e-111  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3151  hypothetical protein  37.63 
 
 		 877 aa  403  1e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2091  hypothetical protein  37.91 
 
 		 1079 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0109662  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2350  hypothetical protein  37.87 
 
 		 877 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1119  hypothetical protein  37.91 
 
 		 1083 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.143143  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1399  hypothetical protein  37.63 
 
 		 877 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3264  hypothetical protein  37.63 
 
 		 877 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2383  hypothetical protein  37.63 
 
 		 877 aa  401  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  35.35 
 
 		 901 aa  392  1e-107  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0022  RND efflux transporter  37.22 
 
 		 877 aa  384  1e-105  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  32.84 
 
 		 901 aa  376  1e-102  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0057  hypothetical protein  36.15 
 
 		 889 aa  369  1e-100  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  33.03 
 
 		 890 aa  364  4e-99  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1777  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  33.49 
 
 		 900 aa  351  4e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2118  hypothetical protein  33.49 
 
 		 879 aa  350  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  32.8 
 
 		 884 aa  328  3e-88  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  34.04 
 
 		 767 aa  326  9e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  27.65 
 
 		 892 aa  253  9.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.11 
 
 		 886 aa  241  4e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  26.61 
 
 		 1128 aa  238  3e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.63 
 
 		 883 aa  226  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  27.98 
 
 		 910 aa  221  3e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  28.24 
 
 		 972 aa  220  7.999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.17 
 
 		 883 aa  218  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  25.47 
 
 		 920 aa  213  1e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  28.48 
 
 		 899 aa  204  5e-51  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  27.15 
 
 		 893 aa  179  1e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.16 
 
 		 1045 aa  177  7e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  26.73 
 
 		 906 aa  146  2e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  24.93 
 
 		 849 aa  78.6  0.0000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  25.7 
 
 		 782 aa  75.9  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  25.51 
 
 		 845 aa  73.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4274  exporters of the RND superfamily  25.55 
 
 		 846 aa  72.8  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4296  exporters of the RND superfamily  25.55 
 
 		 840 aa  72.4  0.00000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.720482  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4143  RND efflux transporter  24.42 
 
 		 840 aa  67  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0819  antibiotic ABC transporter, permease protein  22.67 
 
 		 695 aa  65.9  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.23648  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2918  exporter of the RND superfamily protein  33.53 
 
 		 1204 aa  64.7  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0248285  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  33.1 
 
 		 839 aa  64.3  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  22.73 
 
 		 747 aa  62.4  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1321  RND efflux transporter  27 
 
 		 800 aa  62.4  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0548  MMPL domain protein  22.5 
 
 		 684 aa  62.4  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0460  putative exporter of the RND superfamily protein  27.93 
 
 		 806 aa  62.4  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0222  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  27.31 
 
 		 746 aa  61.2  0.00000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1059  HAE1 family efflux transporter  23.59 
 
 		 777 aa  60.5  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.101015 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  33.67 
 
 		 895 aa  60.1  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2622  acriflavin resistance protein  30.37 
 
 		 1014 aa  60.1  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  27.04 
 
 		 752 aa  58.9  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0476  xanthomonadin exporter  24.87 
 
 		 794 aa  57.8  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  24.92 
 
 		 752 aa  57.8  0.0000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.3 
 
 		 798 aa  57.8  0.000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  29.39 
 
 		 805 aa  57.4  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  23.32 
 
 		 780 aa  57  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  30.41 
 
 		 1011 aa  57.4  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  25.96 
 
 		 843 aa  57  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4897  hypothetical protein  29.05 
 
 		 864 aa  56.2  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  24.3 
 
 		 783 aa  56.2  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  30.24 
 
 		 1131 aa  56.2  0.000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2375  transport protein, putative  28.8 
 
 		 825 aa  56.2  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2278  transport protein, putative  28.1 
 
 		 835 aa  55.5  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4386  lipoprotein transmembrane  26.14 
 
 		 786 aa  55.5  0.000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127353  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  20.47 
 
 		 1226 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1164  acriflavin resistance protein  29.28 
 
 		 1110 aa  55.1  0.000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.149808  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.87 
 
 		 1172 aa  55.1  0.000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3055  putative drug efflux pump, RND superfamily  27.63 
 
 		 803 aa  54.7  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.322516 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  23.62 
 
 		 905 aa  54.7  0.000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  30.6 
 
 		 1287 aa  54.7  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0245  transporter, putative  26.13 
 
 		 893 aa  54.7  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3078  exporter of the RND superfamily protein-like protein  31.28 
 
 		 1109 aa  54.3  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  31.47 
 
 		 748 aa  53.5  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  26.39 
 
 		 847 aa  54.3  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2967  acriflavin resistance protein  31.18 
 
 		 1032 aa  53.5  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.510734  normal  0.0225941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>