96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_0798 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011206  Lferr_0941  hypothetical protein  100 
 
 		 784 aa  1550    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2150  exporter-like  47.06 
 
 		 828 aa  682    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2816  exporter-like protein  47.8 
 
 		 826 aa  680    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249956  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0305  MMPL domain protein  47.09 
 
 		 810 aa  668    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2683  exporter-like protein  47.8 
 
 		 826 aa  679    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.815942  normal  0.551153 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  46.3 
 
 		 783 aa  647    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2764  exporter-like protein  47.06 
 
 		 829 aa  682    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0195609  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1374  hypothetical protein  51.4 
 
 		 778 aa  678    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292609 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3301  hypothetical protein  49.49 
 
 		 782 aa  679    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149323  normal  0.322997 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0317  MMPL domain protein  47.3 
 
 		 806 aa  663    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0934252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6094  MMPL family membrane protein  49.08 
 
 		 823 aa  688    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125086  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0798  hypothetical protein  100 
 
 		 784 aa  1550    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0068  MMPL domain protein  45.76 
 
 		 804 aa  598  1e-170  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0429  hypothetical protein  47.21 
 
 		 827 aa  590  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3929  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  47.69 
 
 		 812 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0919  hypothetical protein  45.05 
 
 		 791 aa  566  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2750  hypothetical protein  47.25 
 
 		 773 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.536126  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3990  hypothetical protein  43.69 
 
 		 784 aa  531  1e-149  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2674  hypothetical protein  40.11 
 
 		 802 aa  504  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22432  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1322  hypothetical protein  40.92 
 
 		 802 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03730  membrane protein involved in xanthomonadin export  33.59 
 
 		 807 aa  351  2e-95  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780979  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1987  membrane protein  33.99 
 
 		 788 aa  343  8e-93  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2065  membrane protein  33.99 
 
 		 788 aa  342  2e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0476  xanthomonadin exporter  30.85 
 
 		 794 aa  290  7e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  28.08 
 
 		 805 aa  165  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  26.75 
 
 		 802 aa  147  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3055  putative drug efflux pump, RND superfamily  25.28 
 
 		 803 aa  139  2e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.322516 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0699  RND superfamily drug exporter  25.4 
 
 		 806 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  25.2 
 
 		 780 aa  131  4.0000000000000003e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4770  putative lipoprotein transmembrane  26.9 
 
 		 802 aa  130  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3693  lipoprotein transmembrane  26.9 
 
 		 802 aa  130  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.432372  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4605  Patched family protein  22.8 
 
 		 799 aa  120  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214828 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4082  putative lipoprotein transmembrane  26.08 
 
 		 802 aa  118  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3897  hypothetical protein  23.62 
 
 		 804 aa  117  6e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0343  hypothetical protein  23.07 
 
 		 802 aa  117  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3882  hypothetical protein  26.27 
 
 		 772 aa  113  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.452334  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3607  putative lipoprotein transmembrane  24.14 
 
 		 803 aa  111  6e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2094  membrane protein  26.07 
 
 		 778 aa  108  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0316  hypothetical protein  25.48 
 
 		 804 aa  107  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235423 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3520  hypothetical protein  25.04 
 
 		 841 aa  106  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3685  hypothetical protein  24.73 
 
 		 839 aa  106  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.97 
 
 		 1291 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0437  hypothetical protein  23.42 
 
 		 813 aa  105  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0338  hypothetical protein  24.17 
 
 		 843 aa  104  5e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3388  hypothetical protein  22.82 
 
 		 799 aa  104  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0341  hypothetical protein  24.17 
 
 		 847 aa  104  7e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.1938 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0331  hypothetical protein  24.14 
 
 		 835 aa  104  7e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  21.65 
 
 		 1225 aa  103  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0333  hypothetical protein  24.13 
 
 		 840 aa  103  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4377  hypothetical protein  24.6 
 
 		 834 aa  101  5e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0430  hypothetical protein  26.43 
 
 		 777 aa  101  5e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152141  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.49 
 
 		 1226 aa  97.8  7e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.45 
 
 		 1172 aa  93.2  1e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0332  hypothetical protein  24.09 
 
 		 839 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0898  putative inner membrane protein  25.65 
 
 		 768 aa  89.7  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.188824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4386  lipoprotein transmembrane  27.59 
 
 		 786 aa  88.2  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127353  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0341  hypothetical protein  24.07 
 
 		 839 aa  87.4  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0432  hypothetical protein  21.48 
 
 		 759 aa  80.5  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  23.43 
 
 		 782 aa  80.1  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2755  hypothetical protein  26.17 
 
 		 768 aa  75.9  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  21.12 
 
 		 1287 aa  75.9  0.000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3894  hypothetical protein  24.24 
 
 		 748 aa  73.9  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  22.59 
 
 		 1274 aa  73.6  0.00000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  25.22 
 
 		 849 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0121  hypothetical protein  23.35 
 
 		 763 aa  72.4  0.00000000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1496  putative lipoprotein transmembrane  25.44 
 
 		 740 aa  72  0.00000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0429  hypothetical protein  23.91 
 
 		 791 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4577  hypothetical protein  24.95 
 
 		 773 aa  70.5  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3914  putative lipoprotein transmembrane  26.76 
 
 		 784 aa  69.7  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856836  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5102  hypothetical protein  23.39 
 
 		 791 aa  68.9  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0976  KWG  23.63 
 
 		 749 aa  62.8  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4133  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  22.81 
 
 		 870 aa  61.2  0.00000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  22.66 
 
 		 847 aa  58.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4809  hypothetical protein  25.05 
 
 		 772 aa  57.8  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  29.19 
 
 		 843 aa  52.8  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  29.66 
 
 		 901 aa  51.6  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  27.33 
 
 		 893 aa  50.4  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.25 
 
 		 1045 aa  49.7  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.86 
 
 		 882 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  30.6 
 
 		 845 aa  48.5  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4166  putative transporter  21.52 
 
 		 908 aa  48.5  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.90663  normal  0.139004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.74 
 
 		 882 aa  47  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.27 
 
 		 882 aa  47.4  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  28.16 
 
 		 839 aa  47.4  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3767  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.24 
 
 		 882 aa  47  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.919255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  27.56 
 
 		 747 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0970  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.82 
 
 		 895 aa  47  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3458  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  28.24 
 
 		 669 aa  46.2  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.677236  normal  0.520256 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  26.67 
 
 		 901 aa  46.2  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0282  hypothetical protein  20.98 
 
 		 742 aa  45.8  0.003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0418733  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.41 
 
 		 887 aa  45.4  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1862  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25 
 
 		 864 aa  45.4  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2558  hypothetical protein  24.48 
 
 		 890 aa  44.7  0.006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.808467  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23 
 
 		 886 aa  44.7  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3091  exporter of the RND superfamily protein-like protein  28.77 
 
 		 776 aa  44.3  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.114197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0020  Patched family protein  25.49 
 
 		 1359 aa  44.3  0.01  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>