152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_0432 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_0432  hypothetical protein  100 
 
 
759 aa  1469    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0316  hypothetical protein  24.15 
 
 
804 aa  227  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235423 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  24.4 
 
 
780 aa  216  9.999999999999999e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4605  Patched family protein  25.84 
 
 
799 aa  209  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.214828 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0437  hypothetical protein  22.94 
 
 
813 aa  197  6e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3685  hypothetical protein  22.78 
 
 
839 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3897  hypothetical protein  23.39 
 
 
804 aa  188  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0343  hypothetical protein  23.44 
 
 
802 aa  183  8.000000000000001e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2094  membrane protein  24.37 
 
 
778 aa  183  8.000000000000001e-45  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0341  hypothetical protein  23.27 
 
 
839 aa  183  1e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0332  hypothetical protein  23.12 
 
 
839 aa  180  8e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4386  lipoprotein transmembrane  21.43 
 
 
786 aa  171  5e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127353  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  20.26 
 
 
802 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3914  putative lipoprotein transmembrane  23.41 
 
 
784 aa  163  1e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.856836  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3388  hypothetical protein  22.3 
 
 
799 aa  162  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4082  putative lipoprotein transmembrane  19.95 
 
 
802 aa  161  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3520  hypothetical protein  22 
 
 
841 aa  160  1e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5102  hypothetical protein  20.17 
 
 
791 aa  158  3e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3894  hypothetical protein  23.1 
 
 
748 aa  157  5.0000000000000005e-37  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0699  RND superfamily drug exporter  19.26 
 
 
806 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4577  hypothetical protein  24.2 
 
 
773 aa  154  5e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3055  putative drug efflux pump, RND superfamily  19.97 
 
 
803 aa  154  7e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.322516 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0331  hypothetical protein  23.24 
 
 
835 aa  152  3e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0333  hypothetical protein  22.76 
 
 
840 aa  150  8e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0976  KWG  25.74 
 
 
749 aa  149  2.0000000000000003e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0341  hypothetical protein  22.59 
 
 
847 aa  148  3e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.1938 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0338  hypothetical protein  22.59 
 
 
843 aa  149  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  19.14 
 
 
805 aa  147  8.000000000000001e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0430  hypothetical protein  20 
 
 
777 aa  145  2e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152141  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3882  hypothetical protein  24.46 
 
 
772 aa  145  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.452334  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0429  hypothetical protein  20.93 
 
 
791 aa  144  5e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4377  hypothetical protein  22.01 
 
 
834 aa  135  3.9999999999999996e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4770  putative lipoprotein transmembrane  18.78 
 
 
802 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3693  lipoprotein transmembrane  18.78 
 
 
802 aa  134  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.432372  normal  0.281955 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0898  putative inner membrane protein  21.25 
 
 
768 aa  132  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.188824  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2755  hypothetical protein  21.42 
 
 
768 aa  130  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0282  hypothetical protein  24.67 
 
 
742 aa  126  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0418733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4809  hypothetical protein  21.11 
 
 
772 aa  122  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0121  hypothetical protein  24.26 
 
 
763 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.142697  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3607  putative lipoprotein transmembrane  20.85 
 
 
803 aa  118  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2065  membrane protein  18.51 
 
 
788 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1987  membrane protein  18.65 
 
 
788 aa  112  4.0000000000000004e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2674  hypothetical protein  19.22 
 
 
802 aa  111  5e-23  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22432  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0068  MMPL domain protein  20.74 
 
 
804 aa  108  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.56 
 
 
1172 aa  102  2e-20  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.86 
 
 
1291 aa  99  3e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1322  hypothetical protein  20.77 
 
 
802 aa  97.4  8e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0798  hypothetical protein  22.14 
 
 
784 aa  96.3  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0941  hypothetical protein  22.14 
 
 
784 aa  96.3  2e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.98 
 
 
1226 aa  96.3  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3301  hypothetical protein  19.8 
 
 
782 aa  95.5  3e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149323  normal  0.322997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  18.8 
 
 
783 aa  89.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2816  exporter-like protein  17.63 
 
 
826 aa  88.2  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249956  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2150  exporter-like  17.83 
 
 
828 aa  87.8  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2764  exporter-like protein  17.83 
 
 
829 aa  87.8  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0195609  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  22.42 
 
 
1225 aa  87.8  7e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03730  membrane protein involved in xanthomonadin export  21.28 
 
 
807 aa  87.4  8e-16  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780979  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1496  putative lipoprotein transmembrane  18.57 
 
 
740 aa  87.4  0.000000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  19.84 
 
 
782 aa  84.3  0.000000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1374  hypothetical protein  26.71 
 
 
778 aa  81.6  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00292609 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0823  exporter of the RND superfamily protein-like protein  24.41 
 
 
798 aa  81.6  0.00000000000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.526995  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2683  exporter-like protein  24.5 
 
 
826 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.815942  normal  0.551153 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  22.7 
 
 
1274 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  23.84 
 
 
886 aa  75.1  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0919  hypothetical protein  17.3 
 
 
791 aa  73.6  0.00000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0476  xanthomonadin exporter  18.95 
 
 
794 aa  73.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0429  hypothetical protein  19.54 
 
 
827 aa  72.4  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3990  hypothetical protein  22.81 
 
 
784 aa  72  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3929  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  20.58 
 
 
812 aa  71.6  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6094  MMPL family membrane protein  22.52 
 
 
823 aa  71.2  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125086  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  19.33 
 
 
849 aa  67  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2750  hypothetical protein  21.03 
 
 
773 aa  66.2  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.536126  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  19.31 
 
 
972 aa  66.6  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0317  MMPL domain protein  24.41 
 
 
806 aa  65.5  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0934252  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0305  MMPL domain protein  25.2 
 
 
810 aa  64.7  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  22.52 
 
 
839 aa  61.6  0.00000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  18.23 
 
 
893 aa  60.5  0.0000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0610  exporter of the RND superfamily protein-like protein  19.57 
 
 
807 aa  60.1  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1695  exporter of the RND superfamily protein-like protein  22.5 
 
 
782 aa  59.3  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0209  Patched family protein  20.88 
 
 
881 aa  58.5  0.0000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0806  hypothetical protein  23.23 
 
 
1083 aa  58.2  0.0000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.712772  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  19.3 
 
 
1287 aa  57.8  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0913  exporter-like protein  20.2 
 
 
792 aa  57.4  0.0000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.231192  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0109  hypothetical protein  20.11 
 
 
674 aa  57  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0221  RND efflux transporter  20.09 
 
 
771 aa  55.8  0.000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.822518  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  23.3 
 
 
843 aa  55.1  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04040  hypothetical protein  27.57 
 
 
803 aa  55.1  0.000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1774  Patched family protein  21.55 
 
 
815 aa  54.7  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0110  RND efflux transporter  28.86 
 
 
674 aa  54.7  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.384036  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  17.67 
 
 
1045 aa  53.9  0.00001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0469  hypothetical protein  18.6 
 
 
905 aa  52.8  0.00003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1269  RND superfamily protein  23.33 
 
 
748 aa  51.6  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0768  hydrophobe/amphiphile efflux-3 HAE3  24.7 
 
 
747 aa  50.4  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.53096  normal  0.282667 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  24.42 
 
 
752 aa  50.4  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0901  HAE1 family efflux transporter  18.21 
 
 
752 aa  49.7  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.395656  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3657  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.12 
 
 
882 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.605941  normal  0.0965293 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0380  integral membrane protein, AcrB/AcrD/AcrF family  32.76 
 
 
1034 aa  48.9  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1652  hypothetical protein  32.5 
 
 
767 aa  48.5  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.485028  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  24.77 
 
 
883 aa  48.5  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7033  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  27.86 
 
 
871 aa  48.5  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.642403  decreased coverage  0.0000000105164 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>