144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0913 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_0913  exporter-like protein  100 
 
 		 792 aa  1597    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.231192  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  27.64 
 
 		 782 aa  237  6e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.05 
 
 		 1291 aa  198  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  21.53 
 
 		 1226 aa  190  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.32 
 
 		 1172 aa  177  9e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  21.77 
 
 		 1225 aa  176  1.9999999999999998e-42  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  22.14 
 
 		 1274 aa  147  1e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  27.12 
 
 		 849 aa  145  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  20.53 
 
 		 1287 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  24.31 
 
 		 839 aa  114  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  24.26 
 
 		 843 aa  107  1e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  25.74 
 
 		 847 aa  99  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  21.22 
 
 		 783 aa  93.6  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2739  hypothetical protein  31.98 
 
 		 845 aa  79  0.0000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0689  SecD/SecF family protein export membrane protein  27.78 
 
 		 899 aa  77.4  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0944468  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  21.61 
 
 		 802 aa  75.5  0.000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2082  RND superfamily exporter  34.56 
 
 		 893 aa  74.7  0.000000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3301  hypothetical protein  23.17 
 
 		 782 aa  73.6  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149323  normal  0.322997 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1642  putative rRNA methylase  22.9 
 
 		 892 aa  73.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0106541  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3221  hypothetical protein  34.1 
 
 		 874 aa  70.5  0.0000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2575  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  21.67 
 
 		 886 aa  70.1  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000305046  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3894  hypothetical protein  22.77 
 
 		 748 aa  68.6  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2065  membrane protein  20.91 
 
 		 788 aa  68.6  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3055  putative drug efflux pump, RND superfamily  22.54 
 
 		 803 aa  68.6  0.0000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.322516 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2094  membrane protein  21.27 
 
 		 778 aa  68.6  0.0000000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1987  membrane protein  20.91 
 
 		 788 aa  68.2  0.0000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  28.64 
 
 		 1128 aa  67  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1021  RND efflux transporter  27.31 
 
 		 920 aa  67  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000753999  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3882  hypothetical protein  21.08 
 
 		 772 aa  65.9  0.000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.452334  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2683  exporter-like protein  24.4 
 
 		 826 aa  64.7  0.000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.815942  normal  0.551153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2816  exporter-like protein  21.64 
 
 		 826 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249956  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2750  hypothetical protein  23.64 
 
 		 773 aa  63.5  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.536126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1238  hypothetical protein  32.64 
 
 		 855 aa  63.9  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.409284  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2150  exporter-like  25.78 
 
 		 828 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2764  exporter-like protein  25.78 
 
 		 829 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0195609  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3359  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25 
 
 		 883 aa  62.8  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.000128558  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3117  putative rRNA methylase  30.4 
 
 		 972 aa  61.6  0.00000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0109517  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4082  putative lipoprotein transmembrane  23.43 
 
 		 802 aa  61.6  0.00000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1013  hypothetical protein  26.01 
 
 		 906 aa  61.2  0.00000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4386  lipoprotein transmembrane  21.17 
 
 		 786 aa  61.2  0.00000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127353  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6094  MMPL family membrane protein  25.4 
 
 		 823 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125086  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1239  hypothetical protein  31.25 
 
 		 862 aa  60.1  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3897  hypothetical protein  20.44 
 
 		 804 aa  60.8  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0886  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  25.21 
 
 		 883 aa  59.7  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.34494e-16 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0788  Patched family protein  31.94 
 
 		 923 aa  59.7  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0437  hypothetical protein  22.54 
 
 		 813 aa  59.7  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0317  MMPL domain protein  22.34 
 
 		 806 aa  59.3  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0934252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0338  hypothetical protein  21.86 
 
 		 843 aa  58.9  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0341  hypothetical protein  21.86 
 
 		 847 aa  59.3  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.1938 
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  21.92 
 
 		 805 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0316  hypothetical protein  21.75 
 
 		 804 aa  58.5  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235423 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0456  HAE1 family efflux transporter  29.17 
 
 		 752 aa  58.2  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.857513  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03730  membrane protein involved in xanthomonadin export  20.72 
 
 		 807 aa  58.5  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780979  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3929  phosphoglucomutase/phosphomannomutase alpha/beta/subunit  24.62 
 
 		 812 aa  58.2  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1374  hypothetical protein  25.55 
 
 		 778 aa  57.8  0.0000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292609 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1747  hypothetical protein  27.61 
 
 		 901 aa  56.6  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.162879  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1194  hypothetical protein  35.71 
 
 		 832 aa  56.2  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000134903  hitchhiker  0.0000145799 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3159  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  32.64 
 
 		 887 aa  56.2  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.457417  normal  0.706665 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3348  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  26.71 
 
 		 1045 aa  56.6  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4691  putative transport protein  23.06 
 
 		 797 aa  55.5  0.000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.628482  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2755  hypothetical protein  21.41 
 
 		 768 aa  55.5  0.000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2553  hypothetical protein  28.57 
 
 		 862 aa  55.5  0.000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.531881  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1669  hypothetical protein  26.09 
 
 		 388 aa  55.5  0.000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0810  hypothetical protein  22.04 
 
 		 884 aa  55.1  0.000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.059286  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4605  Patched family protein  22.06 
 
 		 799 aa  55.1  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.214828 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0333  hypothetical protein  21.37 
 
 		 840 aa  54.7  0.000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4341  Patched family protein  30.4 
 
 		 895 aa  55.1  0.000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.354864  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1447  RND efflux transporter  26.29 
 
 		 820 aa  54.3  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.751862  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0429  hypothetical protein  23.85 
 
 		 827 aa  53.5  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  20.46 
 
 		 780 aa  54.3  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0898  putative inner membrane protein  22.68 
 
 		 768 aa  53.9  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.188824  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08450  efflux transporter, putative, hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  20 
 
 		 764 aa  54.3  0.00001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2758  hypothetical protein  32.41 
 
 		 901 aa  52.8  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.829629  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2674  hypothetical protein  22.04 
 
 		 802 aa  52.4  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22432  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2229  Patched family protein  25.46 
 
 		 755 aa  52.4  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.271746  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3175  SecD/SecF family protein export membrane protein  29.6 
 
 		 910 aa  52.8  0.00003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0343  hypothetical protein  22.92 
 
 		 802 aa  52.4  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2973  putative protein export membrane protein  33.58 
 
 		 862 aa  52  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.228418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0860  Patched family protein  25.74 
 
 		 1131 aa  51.6  0.00005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0331  hypothetical protein  22 
 
 		 835 aa  51.6  0.00006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0432  hypothetical protein  19.54 
 
 		 759 aa  51.2  0.00008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0264  MMPL domain-containing protein  26.56 
 
 		 385 aa  51.2  0.00008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00700265 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1637  hypothetical protein  30.23 
 
 		 385 aa  51.2  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0068  MMPL domain protein  22.63 
 
 		 804 aa  50.8  0.00009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0699  RND superfamily drug exporter  23.12 
 
 		 806 aa  50.8  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0305  MMPL domain protein  24.5 
 
 		 810 aa  50.4  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1056  efflux transporter, , hydrophobe/amphiphile efflux-3 (HAE3) family  26.32 
 
 		 756 aa  50.1  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0557741  normal  0.21545 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0691  hypothetical protein  28.28 
 
 		 805 aa  49.7  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1479  hypothetical protein  31.25 
 
 		 969 aa  48.9  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.756433  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2865  Patched family protein  28.8 
 
 		 1011 aa  49.3  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4286  RND efflux transporter  32.23 
 
 		 845 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2350  hypothetical protein  31.25 
 
 		 877 aa  48.9  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1399  hypothetical protein  31.25 
 
 		 877 aa  48.9  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.604121  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3264  hypothetical protein  31.25 
 
 		 877 aa  48.9  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3151  hypothetical protein  31.25 
 
 		 877 aa  48.9  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2383  hypothetical protein  31.25 
 
 		 877 aa  48.9  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0572  hypothetical protein  24.79 
 
 		 385 aa  48.9  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.67085  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6341  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  29.34 
 
 		 882 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432737  decreased coverage  0.00194577 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7156  hopanoid biosynthesis associated RND transporter like protein HpnN  30.22 
 
 		 882 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3607  putative lipoprotein transmembrane  22.21 
 
 		 803 aa  48.1  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>