More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_03830 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013162  Coch_0383  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.02 
 
 
1172 aa  879    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.54 
 
 
1226 aa  1171    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.43 
 
 
1291 aa  799    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  100 
 
 
1225 aa  2456    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  31.85 
 
 
1287 aa  617  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2108  exporter  29.15 
 
 
1274 aa  499  1e-139  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.153842  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2657  exporter  24.19 
 
 
782 aa  210  2e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0913  exporter-like protein  21.77 
 
 
792 aa  157  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.231192  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3595  RND efflux transporter  20.78 
 
 
843 aa  113  2.0000000000000002e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0456  hypothetical protein  20.2 
 
 
849 aa  110  2e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.897508  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3894  hypothetical protein  22.65 
 
 
748 aa  107  1e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2188  hypothetical protein  21.15 
 
 
839 aa  107  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0941  hypothetical protein  22.92 
 
 
784 aa  101  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0798  hypothetical protein  22.92 
 
 
784 aa  101  7e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4577  hypothetical protein  23.44 
 
 
773 aa  101  8e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1699  hypothetical protein  21.72 
 
 
847 aa  99  5e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0923287  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2674  hypothetical protein  21.74 
 
 
802 aa  99  5e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.22432  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004073  membrane protein inferred for ABFAE pathway  20.81 
 
 
780 aa  97.8  1e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4177  transmembrane protein  20.61 
 
 
783 aa  97.1  2e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0898  putative inner membrane protein  21.63 
 
 
768 aa  96.3  3e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.188824  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0476  xanthomonadin exporter  19.66 
 
 
794 aa  96.3  4e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2150  exporter-like  19.71 
 
 
828 aa  96.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.139185  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2764  exporter-like protein  19.71 
 
 
829 aa  96.3  4e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0195609  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6094  MMPL family membrane protein  19.41 
 
 
823 aa  95.5  5e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.125086  normal  0.449875 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2816  exporter-like protein  19.11 
 
 
826 aa  94.7  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.249956  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0936  RND superfamily drug exporter  21.52 
 
 
802 aa  94.4  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0699  RND superfamily drug exporter  21.37 
 
 
806 aa  92.4  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0317  MMPL domain protein  19.31 
 
 
806 aa  91.7  9e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0934252  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4809  hypothetical protein  23.68 
 
 
772 aa  90.1  2e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4605  Patched family protein  20.91 
 
 
799 aa  90.5  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.214828 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0265  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.63 
 
 
244 aa  89.7  3e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2094  membrane protein  21.61 
 
 
778 aa  89.7  3e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0430  hypothetical protein  21.63 
 
 
777 aa  89.4  4e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.152141  normal  0.223141 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2683  exporter-like protein  18.75 
 
 
826 aa  88.2  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.815942  normal  0.551153 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0305  MMPL domain protein  18.83 
 
 
810 aa  88.2  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2065  membrane protein  20.43 
 
 
788 aa  87.8  0.000000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0644  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.75 
 
 
235 aa  87  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.54251e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2755  hypothetical protein  20.48 
 
 
768 aa  87  0.000000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0326  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.83 
 
 
263 aa  86.3  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811057 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0276  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.63 
 
 
244 aa  86.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3055  putative drug efflux pump, RND superfamily  20.72 
 
 
803 aa  85.5  0.000000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.322516 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0255  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.46 
 
 
244 aa  85.1  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539885  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1987  membrane protein  20.73 
 
 
788 aa  85.1  0.000000000000008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2708  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.69 
 
 
236 aa  84  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.109904  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3882  hypothetical protein  20.93 
 
 
772 aa  83.6  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.452334  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1147  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.58 
 
 
209 aa  83.6  0.00000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3116  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  32.48 
 
 
234 aa  82  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2819  putative rRNA methylase  20.19 
 
 
1128 aa  82  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000245096  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4386  lipoprotein transmembrane  22.03 
 
 
786 aa  81.6  0.00000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.127353  normal  0.409533 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3301  hypothetical protein  19.7 
 
 
782 aa  81.6  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.149323  normal  0.322997 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0447  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.09 
 
 
291 aa  80.9  0.0000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.363645  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0508  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.16 
 
 
257 aa  80.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.216043 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5102  hypothetical protein  20 
 
 
791 aa  80.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1938  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.35 
 
 
247 aa  80.5  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2263  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.23 
 
 
254 aa  80.9  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.593921  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2351  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.23 
 
 
254 aa  80.1  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3974  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.6 
 
 
231 aa  79.7  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000150159  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0413  conserved hypothetical protein, membrane  21.78 
 
 
773 aa  79.7  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0655355  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1596  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  30.06 
 
 
244 aa  79.7  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00775  lipoprotein transmembrane  18.61 
 
 
805 aa  79.3  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4367  acyltransferase family protein  25 
 
 
283 aa  79  0.0000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2618  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.61 
 
 
244 aa  79  0.0000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4595  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.31 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3685  hypothetical protein  21.58 
 
 
839 aa  79  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4060  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.6 
 
 
231 aa  78.6  0.0000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03730  membrane protein involved in xanthomonadin export  19.01 
 
 
807 aa  77.8  0.000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.780979  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2547  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.54 
 
 
236 aa  77  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000918466  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4067  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.62 
 
 
258 aa  76.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.124606  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1249  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acetyltransferase, putative  30.15 
 
 
204 aa  76.3  0.000000000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2750  hypothetical protein  20.97 
 
 
773 aa  76.3  0.000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.536126  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0363  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.17 
 
 
234 aa  76.6  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000581696  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4035  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.62 
 
 
258 aa  76.6  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0343  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.42 
 
 
274 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22208  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0068  MMPL domain protein  21.82 
 
 
804 aa  76.3  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0348  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.42 
 
 
291 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1600  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  35.82 
 
 
254 aa  75.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3927  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.62 
 
 
258 aa  75.9  0.000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.058142  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0345  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.12 
 
 
282 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12739  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0341  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.42 
 
 
274 aa  75.9  0.000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2690  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.12 
 
 
222 aa  76.3  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.524315 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0781  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.38 
 
 
216 aa  75.9  0.000000000005  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000401407  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3520  hypothetical protein  21.4 
 
 
841 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0351  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.42 
 
 
291 aa  75.9  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000438312 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0351  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.12 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3675  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.12 
 
 
282 aa  75.5  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.264662  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2213  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.86 
 
 
261 aa  75.5  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0965505  hitchhiker  0.00600362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2499  1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase  32.86 
 
 
244 aa  75.5  0.000000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2001  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.36 
 
 
225 aa  75.5  0.000000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3510  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.27 
 
 
273 aa  75.1  0.000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0871  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.69 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0294  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.45 
 
 
236 aa  75.1  0.000000000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.180002 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0690  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.38 
 
 
264 aa  74.7  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157472  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0429  hypothetical protein  21.08 
 
 
791 aa  74.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1988  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.08 
 
 
231 aa  74.7  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4653  HAD-superfamily subfamily IB hydrolase, TIGR01490  26.13 
 
 
493 aa  74.7  0.00000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4073  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.9 
 
 
264 aa  73.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3378  acyltransferase family protein  28.57 
 
 
275 aa  73.9  0.00000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1671  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.19 
 
 
242 aa  73.9  0.00000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.596452  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3598  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.9 
 
 
264 aa  73.9  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288024  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0259  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.1 
 
 
236 aa  73.2  0.00000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.073981 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>