More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3510 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009092  Shew_3510  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
273 aa  560  1e-158  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4595  phospholipid/glycerol acyltransferase  76.81 
 
 
270 aa  432  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0345  phospholipid/glycerol acyltransferase  76.05 
 
 
282 aa  427  1e-119  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12739  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4367  acyltransferase family protein  75 
 
 
283 aa  424  1e-118  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0326  phospholipid/glycerol acyltransferase  76.65 
 
 
263 aa  425  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811057 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0447  phospholipid/glycerol acyltransferase  74.14 
 
 
291 aa  425  1e-118  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.363645  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0351  phospholipid/glycerol acyltransferase  76.05 
 
 
282 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3675  phospholipid/glycerol acyltransferase  76.05 
 
 
282 aa  427  1e-118  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.264662  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0348  phospholipid/glycerol acyltransferase  74.52 
 
 
291 aa  425  1e-118  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3887  phospholipid/glycerol acyltransferase  71.86 
 
 
272 aa  421  1e-117  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.74878  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0341  phospholipid/glycerol acyltransferase  74.52 
 
 
274 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0351  phospholipid/glycerol acyltransferase  74.52 
 
 
291 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000438312 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0343  phospholipid/glycerol acyltransferase  74.52 
 
 
274 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22208  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3378  acyltransferase family protein  71.48 
 
 
275 aa  395  1e-109  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0353  phospholipid/glycerol acyltransferase  66.79 
 
 
284 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1487  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.68 
 
 
267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3874  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.65 
 
 
255 aa  171  7.999999999999999e-42  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.442124 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5092  acyltransferase family protein  38.34 
 
 
270 aa  169  6e-41  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0438  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.22 
 
 
270 aa  167  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4761  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.48 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.043692  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3684  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.48 
 
 
268 aa  165  5.9999999999999996e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004063  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  36.67 
 
 
255 aa  165  9e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2104  putative acyltransferase  35.78 
 
 
265 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3885  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.03 
 
 
271 aa  164  2.0000000000000002e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_003296  RS00796  putative 1-acyl-SN-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha transmembrane protein  35.08 
 
 
268 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0440  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.13 
 
 
262 aa  159  3e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3064  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.33 
 
 
264 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.860383 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4377  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.57 
 
 
259 aa  152  7e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00050902  normal  0.183182 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0927  putative acyltransferase  32.13 
 
 
264 aa  150  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4568  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.17 
 
 
262 aa  150  3e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3924  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.94 
 
 
265 aa  149  4e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0110  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.8 
 
 
253 aa  149  6e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0690  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.3 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157472  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0889  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.05 
 
 
272 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4073  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.77 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3598  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.84 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288024  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0967  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.84 
 
 
253 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00103918  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2172  acyltransferase family protein  31.31 
 
 
248 aa  102  6e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2235  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.82 
 
 
262 aa  100  3e-20  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0790  acyltransferase, putative  30.08 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0933  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.08 
 
 
267 aa  99.8  5e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1496  acyltransferase, putative  32.32 
 
 
250 aa  96.7  4e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0218828  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2680  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.94 
 
 
267 aa  95.9  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1329  acyltransferase, putative  30.41 
 
 
248 aa  94.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.291897  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3998  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.92 
 
 
248 aa  93.6  3e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3310  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.57 
 
 
272 aa  89.7  4e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2760  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.28 
 
 
276 aa  83.2  0.000000000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4194  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.29 
 
 
260 aa  80.1  0.00000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500511  normal  0.10275 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1366  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.11 
 
 
270 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000635595 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  23.46 
 
 
1287 aa  76.3  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.76 
 
 
1226 aa  75.1  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0508  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.49 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.216043 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.05 
 
 
1291 aa  72.4  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4067  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.65 
 
 
258 aa  72  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.124606  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4035  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.65 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3927  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.22 
 
 
258 aa  70.5  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.058142  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2662  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.62 
 
 
243 aa  66.6  0.0000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3072  1-acyl-glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsC  24.86 
 
 
229 aa  65.9  0.0000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.024728 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0259  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.39 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.073981 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0937  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  32.37 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  24.29 
 
 
1225 aa  63.2  0.000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1359  lysophospholipid exporter/ 2-acylglycerolphosphoethanolamine acyltransferase  31.25 
 
 
645 aa  62.8  0.000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.526954 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0294  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.73 
 
 
236 aa  62.8  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.180002 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0186  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.11 
 
 
258 aa  62.8  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0569  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.53 
 
 
272 aa  62  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.733686  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2499  1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase  26.28 
 
 
244 aa  61.6  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1596  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  25.26 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0265  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.59 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2263  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.59 
 
 
254 aa  60.5  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.593921  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32744  predicted protein  29.82 
 
 
214 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.131887  normal  0.0803599 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1020  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.21 
 
 
200 aa  60.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004025  hypothetical protein  30.99 
 
 
624 aa  60.5  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0141461  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1727  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.94 
 
 
215 aa  60.1  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0137  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.12 
 
 
236 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00271824  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0276  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.01 
 
 
244 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0276  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.74 
 
 
257 aa  60.1  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.196869 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2547  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30.14 
 
 
236 aa  60.1  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000918466  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01437  hypothetical protein  30.99 
 
 
624 aa  59.7  0.00000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1938  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.43 
 
 
247 aa  59.3  0.00000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1552  hypothetical protein  30.28 
 
 
626 aa  59.3  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0120  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.57 
 
 
269 aa  59.3  0.00000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.183425 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0255  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.69 
 
 
244 aa  58.9  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.539885  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0644  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.62 
 
 
235 aa  58.9  0.00000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.54251e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1988  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.47 
 
 
231 aa  58.9  0.00000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2335  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.73 
 
 
238 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0738  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  26.38 
 
 
216 aa  57.8  0.0000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.310129  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4060  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.79 
 
 
231 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03735  acyltransferase  25.31 
 
 
249 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2629  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.97 
 
 
245 aa  57.8  0.0000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0078972  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_19580  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  33.05 
 
 
401 aa  57.4  0.0000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2351  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.86 
 
 
254 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1330  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  30.5 
 
 
193 aa  56.6  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000270973  normal  0.0367266 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1600  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.45 
 
 
254 aa  57  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2768  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.78 
 
 
645 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0380  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  28.47 
 
 
234 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3116  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative  28.89 
 
 
234 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1470  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.43 
 
 
211 aa  56.6  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.151456  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0363  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.89 
 
 
234 aa  56.2  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000581696  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1022  putative acyltransferase  27.27 
 
 
236 aa  56.2  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508637  normal  0.11203 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0129  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.88 
 
 
251 aa  55.8  0.0000007  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.320021  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>