More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_4377 on replicon NC_007974
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007974  Rmet_4377  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
259 aa  517  1e-146  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00050902  normal  0.183182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5092  acyltransferase family protein  49.59 
 
 
270 aa  238  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0438  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.78 
 
 
270 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1487  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.84 
 
 
267 aa  223  3e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3874  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.41 
 
 
255 aa  214  7e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.442124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3924  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.39 
 
 
265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0440  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.27 
 
 
262 aa  207  2e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4568  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.82 
 
 
262 aa  189  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004063  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  39.84 
 
 
255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3885  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.67 
 
 
271 aa  182  4.0000000000000006e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2104  putative acyltransferase  39.36 
 
 
265 aa  180  2e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0889  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.63 
 
 
272 aa  177  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4595  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.86 
 
 
270 aa  163  3e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4367  acyltransferase family protein  36.63 
 
 
283 aa  162  6e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0447  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.73 
 
 
291 aa  162  6e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.363645  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0348  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.73 
 
 
291 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0351  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.73 
 
 
291 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000438312 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0343  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.73 
 
 
274 aa  161  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22208  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0341  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.73 
 
 
274 aa  160  1e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3378  acyltransferase family protein  34.69 
 
 
275 aa  160  1e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0351  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.33 
 
 
282 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3675  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.33 
 
 
282 aa  160  2e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.264662  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0345  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.33 
 
 
282 aa  160  2e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12739  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0326  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.21 
 
 
263 aa  158  7e-38  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811057 
 
 
-
 
NC_003296  RS00796  putative 1-acyl-SN-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha transmembrane protein  38.67 
 
 
268 aa  158  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3510  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.51 
 
 
273 aa  157  2e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3887  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.84 
 
 
272 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.74878  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3684  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.91 
 
 
268 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4761  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.91 
 
 
268 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.043692  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0110  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.76 
 
 
253 aa  151  8e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0353  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.41 
 
 
284 aa  146  4.0000000000000006e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0927  putative acyltransferase  34.24 
 
 
264 aa  142  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0690  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.98 
 
 
264 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157472  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3064  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.63 
 
 
264 aa  139  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.860383 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4073  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.82 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3598  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.77 
 
 
264 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288024  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2172  acyltransferase family protein  31.58 
 
 
248 aa  118  9.999999999999999e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0967  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.11 
 
 
253 aa  116  3e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00103918  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3998  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.71 
 
 
248 aa  103  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3310  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.57 
 
 
272 aa  98.6  8e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1496  acyltransferase, putative  30.74 
 
 
250 aa  94.7  1e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0218828  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2760  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.02 
 
 
276 aa  86.7  4e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0933  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.69 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0790  acyltransferase, putative  28.69 
 
 
267 aa  85.5  8e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2235  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.22 
 
 
262 aa  84  0.000000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4194  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.01 
 
 
260 aa  84.3  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500511  normal  0.10275 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1366  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.06 
 
 
270 aa  81.3  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000635595 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1329  acyltransferase, putative  32.48 
 
 
248 aa  78.2  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.291897  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2680  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.57 
 
 
267 aa  77.8  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3257  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.28 
 
 
255 aa  67.4  0.0000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.48 
 
 
1226 aa  67  0.0000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3220  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.29 
 
 
236 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.418281  normal  0.367828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  27.91 
 
 
1287 aa  62.4  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1727  phospholipid/glycerol acyltransferase  32.8 
 
 
215 aa  62  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1938  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.82 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1592  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.86 
 
 
257 aa  61.2  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.434005 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0953  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.29 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0989  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.66 
 
 
247 aa  61.2  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000595038  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1141  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.18 
 
 
247 aa  59.3  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00382889  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2875  AMP-dependent synthetase and ligase  38.17 
 
 
958 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0255103  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1925  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.05 
 
 
237 aa  58.9  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0681343  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3412  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.86 
 
 
234 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.535491  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2439  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.63 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0837  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.65 
 
 
269 aa  57  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.381464 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0129  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.69 
 
 
251 aa  57  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.320021  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2052  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.05 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.850396  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2335  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.57 
 
 
238 aa  56.2  0.0000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3562  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.35 
 
 
264 aa  55.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1596  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  29.68 
 
 
244 aa  55.8  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0011  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.61 
 
 
255 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2573  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.47 
 
 
251 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353227 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01340  AAS bifunctional protein  34.55 
 
 
710 aa  54.7  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2499  1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase  24.74 
 
 
244 aa  54.7  0.000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0276  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.76 
 
 
257 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.196869 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4030  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.28 
 
 
303 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2584  acyltransferase family protein  24 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8079  AMP-dependent synthetase and ligase  31.71 
 
 
949 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  unclonable  0.00339839  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2212  phospholipid/glycerol acyltransferase  24 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0873  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.17 
 
 
258 aa  53.9  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000151489  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2001  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.85 
 
 
225 aa  53.9  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0508  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.91 
 
 
257 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.216043 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0705  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  22.99 
 
 
229 aa  54.3  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0019  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.79 
 
 
273 aa  54.7  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.917675  normal  0.550209 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1643  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.62 
 
 
241 aa  54.7  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000254888  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1179  putative 1-acylglycerol-3-phosphate O-acyltransferase (plsC)  26.77 
 
 
255 aa  54.3  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.68736 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.93 
 
 
249 aa  53.5  0.000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0473137  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00060  putative acyltransferase  24.48 
 
 
257 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3747  phospholipid/glycerol acyltransferase  30 
 
 
244 aa  53.9  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0236961  normal  0.0298826 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2547  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.94 
 
 
236 aa  53.5  0.000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000918466  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0579  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.7 
 
 
259 aa  53.1  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4035  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30 
 
 
258 aa  53.5  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  27.45 
 
 
1225 aa  53.1  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4067  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  30 
 
 
258 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.124606  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3072  1-acyl-glycerol-3-phosphate acyltransferase PlsC  28.87 
 
 
229 aa  53.5  0.000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.024728 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0545  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.97 
 
 
195 aa  52.8  0.000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.585305  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3927  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  27.11 
 
 
258 aa  53.1  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.058142  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2629  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.03 
 
 
245 aa  52.8  0.000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0078972  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1249  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acetyltransferase, putative  26.87 
 
 
204 aa  52.8  0.000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1022  putative acyltransferase  24.9 
 
 
236 aa  52.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.508637  normal  0.11203 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0265  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.93 
 
 
244 aa  52.8  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>