215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_004063 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013456  VEA_004063  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  100 
 
 
255 aa  530  1e-150  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2104  putative acyltransferase  57.71 
 
 
265 aa  323  2e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.554453  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0889  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.4 
 
 
272 aa  238  5e-62  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4568  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.25 
 
 
262 aa  224  1e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3885  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.4 
 
 
271 aa  219  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.173019 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1487  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.13 
 
 
267 aa  206  4e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3874  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.67 
 
 
255 aa  196  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.442124 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3924  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.4 
 
 
265 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4377  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.84 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00050902  normal  0.183182 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5092  acyltransferase family protein  36.93 
 
 
270 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0438  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.6 
 
 
270 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0326  phospholipid/glycerol acyltransferase  35.92 
 
 
263 aa  165  5.9999999999999996e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00811057 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3510  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.67 
 
 
273 aa  165  8e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.124246  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0345  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.58 
 
 
282 aa  161  9e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.12739  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4367  acyltransferase family protein  34.17 
 
 
283 aa  160  3e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0351  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.17 
 
 
282 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3675  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.17 
 
 
282 aa  159  3e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.264662  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0353  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.62 
 
 
284 aa  159  4e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0351  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.78 
 
 
291 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000438312 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4595  phospholipid/glycerol acyltransferase  35 
 
 
270 aa  157  1e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0343  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.78 
 
 
274 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.22208  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0348  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.78 
 
 
291 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0341  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.78 
 
 
274 aa  157  1e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3378  acyltransferase family protein  34.94 
 
 
275 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0447  phospholipid/glycerol acyltransferase  34.78 
 
 
291 aa  157  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.363645  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0440  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.1 
 
 
262 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.54306 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3887  phospholipid/glycerol acyltransferase  33.47 
 
 
272 aa  150  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.74878  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3064  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.5 
 
 
264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.860383 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0927  putative acyltransferase  30.12 
 
 
264 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00796  putative 1-acyl-SN-glycerol-3-phosphate acyltransferase alpha transmembrane protein  31.4 
 
 
268 aa  142  4e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3684  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.66 
 
 
268 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.72169 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4761  phospholipid/glycerol acyltransferase  31.66 
 
 
268 aa  142  6e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.043692  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0690  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.12 
 
 
264 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.157472  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0110  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.79 
 
 
253 aa  130  1.0000000000000001e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4073  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.08 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3598  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.97 
 
 
264 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288024  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0967  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.37 
 
 
253 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00103918  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2172  acyltransferase family protein  33.66 
 
 
248 aa  112  7.000000000000001e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1496  acyltransferase, putative  31.43 
 
 
250 aa  91.3  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0218828  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0933  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.67 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0790  acyltransferase, putative  27.67 
 
 
267 aa  90.1  3e-17  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1329  acyltransferase, putative  26.47 
 
 
248 aa  89.7  4e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.291897  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3998  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.4 
 
 
248 aa  86.7  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2680  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.24 
 
 
267 aa  82.8  0.000000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00706693  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2760  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.2 
 
 
276 aa  82.8  0.000000000000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2235  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.98 
 
 
262 aa  81.6  0.00000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1366  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.38 
 
 
270 aa  79.7  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000635595 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4194  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.92 
 
 
260 aa  79.3  0.00000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.500511  normal  0.10275 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3310  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.44 
 
 
272 aa  71.2  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2001  MCP methyltransferase, CheR-type  28.17 
 
 
1287 aa  64.3  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1596  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  25.85 
 
 
244 aa  62.4  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4243  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  24.24 
 
 
250 aa  60.8  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0459048  hitchhiker  0.000000000931416 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1078  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.82 
 
 
1226 aa  58.9  0.00000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0011  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.54 
 
 
255 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1020  phospholipid/glycerol acyltransferase  30.89 
 
 
200 aa  57.4  0.0000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1873  phospholipid/glycerol acyltransferase  24.14 
 
 
1291 aa  57.4  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1330  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferases  28.21 
 
 
193 aa  57  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000270973  normal  0.0367266 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1153  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  32.17 
 
 
194 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3541  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.85 
 
 
250 aa  55.8  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.203157 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1406  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  34.48 
 
 
229 aa  55.5  0.0000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2708  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.9 
 
 
236 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.109904  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0140  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.03 
 
 
206 aa  54.3  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2573  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.73 
 
 
251 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00353227 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01551  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.84 
 
 
206 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01571  putative 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.27 
 
 
206 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.870937  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2335  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.14 
 
 
238 aa  53.1  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1212  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 
1557 aa  52.4  0.000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.97717  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1147  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.83 
 
 
192 aa  52.8  0.000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1012  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  32.8 
 
 
1133 aa  52.4  0.000007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.888633  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0644  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.57 
 
 
235 aa  52  0.000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  6.54251e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0948  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.91 
 
 
199 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2547  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  26.85 
 
 
236 aa  51.6  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000918466  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0294  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  31.54 
 
 
236 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.180002 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03830  hypothetical membrane protein  24.76 
 
 
1225 aa  50.4  0.00003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2052  phospholipid/glycerol acyltransferase  23.03 
 
 
257 aa  50.4  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.850396  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0011  Protoheme IX farnesyltransferase  25.7 
 
 
240 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0074  phospholipid/glycerol acyltransferase  29.66 
 
 
261 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000544756 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2971  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  21.53 
 
 
247 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.040353  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1224  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 
1538 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1326  AMP-dependent synthetase and ligase  31.54 
 
 
1538 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.683911  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1165  long-chain-fatty-acid CoA ligase  31.54 
 
 
1537 aa  49.3  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0005  acyltransferase  25.15 
 
 
257 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1683  phospholipid/glycerol acyltransferase  25.32 
 
 
259 aa  49.3  0.00006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.837761  normal  0.0100169 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4035  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.2 
 
 
258 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0137  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  28.57 
 
 
236 aa  48.9  0.00007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00271824  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00080  LPA acyltransferase protein  25.6 
 
 
242 aa  48.9  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.729238  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4067  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.2 
 
 
258 aa  49.3  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.124606  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0058  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.81 
 
 
261 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.000912039  unclonable  0.000000385865 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3562  phospholipid/glycerol acyltransferase  22.89 
 
 
264 aa  48.9  0.00009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.749653 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3927  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  23.2 
 
 
258 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.058142  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1179  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  29.82 
 
 
193 aa  48.9  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.230312  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00060  putative acyltransferase  25.15 
 
 
257 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0074  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.81 
 
 
261 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  unclonable  0.0000000000185774  normal  0.109161 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3069  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.62 
 
 
261 aa  48.5  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.0056603  hitchhiker  0.00898563 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1925  phospholipid/glycerol acyltransferase  27.39 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0681343  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3537  phospholipid/glycerol acyltransferase  28.02 
 
 
250 aa  48.1  0.0001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0406833 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1976  phospholipid/glycerol acyltransferase  26.82 
 
 
214 aa  48.1  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2170  1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase  25.89 
 
 
193 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000489643  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1147  lyso-ornithine lipid acyltransferase  35.8 
 
 
245 aa  48.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0193  HAD family hydrolase  25.95 
 
 
518 aa  48.1  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0459706  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>