153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1096 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013889  TK90_1096  Methyltransferase type 11  100 
 
 
203 aa  415  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0381  methyltransferase type 11  66.01 
 
 
213 aa  285  4e-76  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.116579 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2180  methyltransferase type 12  61.39 
 
 
205 aa  257  6e-68  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  35.09 
 
 
238 aa  56.6  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1038  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.48 
 
 
244 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1530  3-demethylubiquinone-9 3-O-methyltransferase  35.09 
 
 
237 aa  54.7  0.0000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02731  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.02 
 
 
235 aa  54.3  0.000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02158  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1427  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.77 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000505917  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1104  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.62 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.580904  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02117  hypothetical protein  30.77 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3366  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00379  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.23 
 
 
239 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.296609  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2527  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1419  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000287901 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2383  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
240 aa  53.9  0.000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.679426  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2607  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3020  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  31.62 
 
 
249 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.615191  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2462  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.26 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.331199 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3212  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.48 
 
 
239 aa  52.4  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.812098  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1398  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  34.26 
 
 
237 aa  52.8  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 
200 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  28.23 
 
 
200 aa  52.4  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003110  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.08 
 
 
242 aa  51.6  0.000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.35235  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0328  hypothetical protein  34.23 
 
 
351 aa  51.6  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.621774 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1381  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
225 aa  51.6  0.000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.231177  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3278  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.64 
 
 
238 aa  50.8  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0349494  normal  0.285122 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2800  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.91 
 
 
242 aa  50.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.241472 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.14 
 
 
246 aa  50.1  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.79 
 
 
205 aa  49.7  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1845  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.06 
 
 
234 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.00431464  normal  0.756459 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1574  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  35.14 
 
 
246 aa  49.3  0.00003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  26.49 
 
 
285 aa  49.3  0.00004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1958  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.77 
 
 
232 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.937117  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.03 
 
 
252 aa  48.9  0.00006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23220  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.91 
 
 
232 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0574161  hitchhiker  0.00443225 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2433  putative methyltransferase  31.3 
 
 
348 aa  48.5  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0150817 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  26.7 
 
 
278 aa  48.5  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.91 
 
 
229 aa  48.1  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3270  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.58 
 
 
241 aa  48.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0514123  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
242 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
242 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
242 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
242 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15760  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.79 
 
 
232 aa  48.1  0.00009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 
242 aa  48.1  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2471  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.64 
 
 
253 aa  47.4  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2861  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.81 
 
 
240 aa  47.4  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0308666  decreased coverage  0.000000000135895 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.82 
 
 
242 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.167435  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1311  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.82 
 
 
242 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.310574  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2847  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.82 
 
 
242 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.170371  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4401  Methyltransferase type 12  32.09 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2740  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.77 
 
 
238 aa  47  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.57 
 
 
202 aa  47.4  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1729  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.25 
 
 
243 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0458  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.25 
 
 
234 aa  47  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  30 
 
 
274 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1317  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30.51 
 
 
229 aa  47  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124117  hitchhiker  3.42912e-24 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1995  methyltransferase type 11  32.23 
 
 
287 aa  46.6  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.731995  normal  0.0329645 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1227  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.21 
 
 
232 aa  46.2  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000143556  normal  0.238391 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1768  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.19 
 
 
241 aa  46.2  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.69336  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0910  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.2 
 
 
247 aa  46.2  0.0003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04686  methyltransferase protein  30.4 
 
 
274 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  26.11 
 
 
213 aa  46.2  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  25.54 
 
 
261 aa  45.8  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0933  methyltransferase type 11  30.19 
 
 
223 aa  46.2  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0841609  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0876  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.19 
 
 
245 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000138589  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3650  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.21 
 
 
232 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2296  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.62 
 
 
236 aa  45.8  0.0005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.91 
 
 
239 aa  45.4  0.0005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2368  methyltransferase type 12  28.99 
 
 
345 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1162  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.36 
 
 
238 aa  45.8  0.0005  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  29.6 
 
 
229 aa  45.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2845  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
348 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.292154 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.82 
 
 
238 aa  45.4  0.0006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1765  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.35 
 
 
232 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.293992  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0843  Phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  28.57 
 
 
217 aa  45.1  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1717  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
239 aa  45.1  0.0007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.457102  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3949  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.35 
 
 
232 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00452266  normal  0.0302909 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1356  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.35 
 
 
232 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.818542  normal  0.836315 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1372  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.21 
 
 
232 aa  45.1  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1742  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.35 
 
 
239 aa  44.7  0.0008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0946  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.88 
 
 
232 aa  45.1  0.0008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1719  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.91 
 
 
234 aa  44.7  0.0009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.815395  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4081  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  27.35 
 
 
232 aa  44.7  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.576596  normal  0.236104 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.48 
 
 
268 aa  44.3  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1507  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  28.83 
 
 
247 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.148991  normal  0.0208491 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  28.65 
 
 
234 aa  43.9  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  25 
 
 
282 aa  44.3  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5884  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
264 aa  44.3  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1009  Methyltransferase type 11  32 
 
 
218 aa  43.9  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.00745554  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3515  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.93 
 
 
287 aa  43.9  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 
270 aa  43.5  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3814  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
230 aa  43.9  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.212556  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  28.33 
 
 
209 aa  43.5  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.56 
 
 
240 aa  43.9  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
265 aa  43.9  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2124  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
348 aa  43.5  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0899557  normal  0.31011 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2168  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  30.83 
 
 
237 aa  43.1  0.003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.240799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>